| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 1 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第12页 |
| 1.2 昆虫生物钟的研究概况 | 第12-18页 |
| 1.2.1 昆虫生物钟及钟基因的研究史 | 第12-15页 |
| 1.2.2 昆虫生物钟基因结构及生物学功能 | 第15-16页 |
| 1.2.3 昆虫生物钟的分子机制 | 第16-18页 |
| 1.3 昆虫隐花色素的研究概况 | 第18-20页 |
| 1.3.1 隐花色素的概述 | 第18-19页 |
| 1.3.2 隐花色素的功能研究概况 | 第19-20页 |
| 1.4 研究目的 | 第20页 |
| 1.5 技术路线 | 第20-21页 |
| 1.6 本研究的创新性 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-33页 |
| 2.1 材料 | 第22-24页 |
| 2.1.1 供试昆虫 | 第22页 |
| 2.1.2 葱蝇成虫的饲养 | 第22-23页 |
| 2.1.3 试验样品收集 | 第23-24页 |
| 2.2 仪器和设备 | 第24-25页 |
| 2.2.1 葱蝇饲养所用仪器和设备 | 第24页 |
| 2.2.2 分子生物学实验所用仪器和设备 | 第24-25页 |
| 2.3 所用试剂和试剂盒 | 第25-26页 |
| 2.3.1 菌株 | 第25页 |
| 2.3.2 主要试剂 | 第25页 |
| 2.3.3 部分溶液以及培养基的配置 | 第25-26页 |
| 2.4 葱蝇 cry 基因的分析与克隆 | 第26-30页 |
| 2.4.1 RNA 的提取及 cDNA 的合成 | 第26页 |
| 2.4.2 葱蝇 cry 基因相关引物的设计 | 第26页 |
| 2.4.3 葱蝇 cry 基因中间片段 cDNA 序列的克隆与分析 | 第26-28页 |
| 2.4.4 葱蝇 cry 基因 3’末端 cDNA 序列的克隆与分析 | 第28-29页 |
| 2.4.5 葱蝇 cry 基因 5’末端 cDNA 序列的克隆与分析 | 第29-30页 |
| 2.4.6 葱蝇（6-4）photolyase 基因、CPD photolyase 基因 cDNA 序列的分析 | 第30页 |
| 2.5 生物信息学分析 | 第30-31页 |
| 2.6 葱蝇 cry 基因的表达分析 | 第31-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-60页 |
| 3.1 葱蝇 cry 基因的克隆 | 第33-37页 |
| 3.1.1 葱蝇总 RNA 的提取与检测 | 第33页 |
| 3.1.2 葱蝇 cry 基因中间片段的 PCR 扩增结果 | 第33-34页 |
| 3.1.3 葱蝇 cry 基因中间片段的测序结果 | 第34-35页 |
| 3.1.4 葱蝇 cry 基因 3′末端的 PCR 扩增结果 | 第35-36页 |
| 3.1.5 葱蝇 cry 基因 3′末端的测序结果 | 第36页 |
| 3.1.6 葱蝇 cry 基因 5′末端的 PCR 扩增及测序结果 | 第36-37页 |
| 3.2 葱蝇 cry 基因的生物信息学分析 | 第37-47页 |
| 3.2.1 葱蝇 cry 基因序列和蛋白序列 | 第37-38页 |
| 3.2.2 葱蝇 CRY 蛋白的疏水性 | 第38-39页 |
| 3.2.3 葱蝇 CRY 蛋白的信号肽 | 第39-40页 |
| 3.2.4 葱蝇 CRY 蛋白的跨膜区域 | 第40-41页 |
| 3.2.5 葱蝇 CRY 蛋白的结构域 | 第41页 |
| 3.2.6 葱蝇 CRY 蛋白功能位点预测 | 第41-42页 |
| 3.2.7 葱蝇 CRY 蛋白的二级结构 | 第42-43页 |
| 3.2.8 葱蝇 CRY 蛋白的三级结构 | 第43-44页 |
| 3.2.9 葱蝇 CRY 蛋白序列的相似性分析 | 第44-45页 |
| 3.2.10 葱蝇 CRY 蛋白的系统进化树 | 第45-47页 |
| 3.3 葱蝇隐花色素家族其他成员基因的生物信息学分析 | 第47-54页 |
| 3.3.1 葱蝇隐花色素家族其他成员基因的序列分析 | 第47-49页 |
| 3.3.2 葱蝇隐花色素家族其他成员基因编码蛋白质特性分析 | 第49-54页 |
| 3.4 葱蝇隐花色素家族的系统进化 | 第54-57页 |
| 3.5 葱蝇 cry 基因在葱蝇成虫头部 48 小时的表达模式 | 第57-60页 |
| 3.5.1 葱蝇 cry 基因在葱蝇成虫雄虫头部 48 小时的表达模式 | 第58页 |
| 3.5.2 葱蝇 cry 基因在葱蝇成虫雌虫头部 48 小时的表达模式 | 第58-60页 |
| 4 讨论 | 第60-64页 |
| 4.1 葱蝇 cry 基因的研究 | 第60-61页 |
| 4.1.1 葱蝇 cry 基因序列和蛋白质结构特点 | 第60页 |
| 4.1.2 葱蝇 CRY 蛋白家族的系统进化 | 第60-61页 |
| 4.2 葱蝇成虫样时间点的选择 | 第61-62页 |
| 4.3 葱蝇 cry 基因在葱蝇成虫头部 48 小时的表达模式 | 第62-64页 |
| 5 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-71页 |
| 附录 A：攻读硕士学位期间发表论文及科研情况 | 第71-72页 |
| 附录 B：葱蝇 cry 基因序列 BLAST 比对图 | 第72-73页 |
| 附录 C：葱蝇 CRY 蛋白序列 BLAST 比对图 | 第73-75页 |
| 附录 D：葱蝇（6-4）photolyase 蛋白序列 BLAST 比对图 | 第75-77页 |
| 附录 E：葱蝇 CPD photolyase 蛋白序列 BLAST 比对图 | 第77-79页 |
| 附录 F：葱蝇 cry 基因表达的实时荧光定量 PCR 图 | 第79-81页 |
| 附录 G：缩略词 | 第81-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
