| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-41页 |
| 1.1 大豆高产育种研究进展 | 第15-28页 |
| 1.1.1 传统育种在大豆产量改良中的成就 | 第16页 |
| 1.1.2 分子标记辅助选择在大豆产量改良中的研究进展 | 第16-28页 |
| 1.2 关联分析在植物遗传育种中的应用 | 第28-39页 |
| 1.2.1 连锁不平衡的概念及衡量 | 第29-30页 |
| 1.2.2 连锁不平衡的影响因素 | 第30-32页 |
| 1.2.3 不同植物的连锁不平衡水平 | 第32-33页 |
| 1.2.4 关联分析策略和应用方法 | 第33-35页 |
| 1.2.5 关联分析在植物中的应用现状 | 第35-37页 |
| 1.2.6 关联分析在植物中的应用展望 | 第37-39页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第39-40页 |
| 1.4 研究技术路线 | 第40-41页 |
| 第二章 大豆产量性状QTL候选区域SSR关联分析 | 第41-67页 |
| 2.1 材料与方法 | 第42-47页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第42页 |
| 2.1.2 试验设计 | 第42页 |
| 2.1.3 性状测定 | 第42-43页 |
| 2.1.4 DNA提取 | 第43页 |
| 2.1.5 SSR标记选择及PCR扩增 | 第43-46页 |
| 2.1.6 数据分析 | 第46-47页 |
| 2.2 结果与分析 | 第47-63页 |
| 2.2.1 产量性状的表型变异 | 第47-49页 |
| 2.2.2 产量性状间的相关 | 第49页 |
| 2.2.3 群体遗传结构 | 第49-51页 |
| 2.2.4 产量性状QTL候选区域内的连锁不平衡 | 第51-52页 |
| 2.2.5 产量性状与标记间的关联分析 | 第52-57页 |
| 2.2.6 与产量性状稳定关联的标记位点优异等位变异发掘 | 第57-63页 |
| 2.3 讨论 | 第63-67页 |
| 2.3.1 表型相关的遗传基础 | 第63-64页 |
| 2.3.2 群体结构对关联分析的影响 | 第64页 |
| 2.3.3 关联分析的解析力与QTL精细定位 | 第64-65页 |
| 2.3.4 稳定关联标记位点的优异等位变异育种利用 | 第65-67页 |
| 第三章 大豆产量及产量组分的全基因组关联分析 | 第67-87页 |
| 3.1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第68页 |
| 3.1.2 试验设计及性状测定 | 第68页 |
| 3.1.3 DNA提取 | 第68页 |
| 3.1.4 SNP分型 | 第68页 |
| 3.1.5 数据分析 | 第68-70页 |
| 3.2 结果与分析 | 第70-82页 |
| 3.2.1 大豆产量及产量组分表型变异 | 第70-71页 |
| 3.2.2 产量及产量组分间的相关 | 第71-72页 |
| 3.2.3 群体遗传多样性及单倍型组成 | 第72-73页 |
| 3.2.4 群体结构及遗传亲缘关系 | 第73-74页 |
| 3.2.5 LD衰减情况 | 第74-75页 |
| 3.2.6 产量及产量组分全基因组关联分析 | 第75-82页 |
| 3.3 讨论 | 第82-87页 |
| 3.3.1 群体遗传多样性及群体结构 | 第82-83页 |
| 3.3.2 连锁不平衡(LD) | 第83页 |
| 3.3.3 与大豆产量及产量组分关联的关键SNPs和单倍型 | 第83-87页 |
| 第四章 大豆产量相关候选基因 GmGA3ox 单倍型鉴定 | 第87-101页 |
| 4.1 材料与方法 | 第88-90页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第88页 |
| 4.1.2 田间试验设计 | 第88页 |
| 4.1.3 性状测定 | 第88页 |
| 4.1.4 DNA提取 | 第88页 |
| 4.1.5 候选基因GmGA3ox克隆 | 第88-89页 |
| 4.1.6 数据分析 | 第89-90页 |
| 4.2 结果与分析 | 第90-98页 |
| 4.2.1 候选基因GmGA3ox的筛选 | 第90-92页 |
| 4.2.2 GmGA3ox基因序列多态性 | 第92-94页 |
| 4.2.3 位点间LD及单倍域 | 第94-95页 |
| 4.2.4 GmGA3ox基因多态性位点及单倍型与大豆产量及其组分关联分析 | 第95-97页 |
| 4.2.5 单倍型序列结构分析 | 第97-98页 |
| 4.3 讨论 | 第98-101页 |
| 4.3.1 GmGA3ox基因与大豆产量性状相关 | 第98-99页 |
| 4.3.2 GMGA3ox基因优异单倍型鉴定及功能标记开发 | 第99-101页 |
| 第五章 大豆光合相关性状的全基因组关联分析 | 第101-119页 |
| 5.1 材料与方法 | 第102-104页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第102页 |
| 5.1.2 试验设计 | 第102-103页 |
| 5.1.3 性状测定 | 第103-104页 |
| 5.1.4 DNA提取与SNP分型 | 第104页 |
| 5.1.5 数据分析 | 第104页 |
| 5.2 结果与分析 | 第104-115页 |
| 5.2.1 光合相关性状表型变异 | 第104-105页 |
| 5.2.2 光合相关性状间相关 | 第105-106页 |
| 5.4.3 光合相关性状全基因组关联分析 | 第106-115页 |
| 5.3 讨论 | 第115-119页 |
| 5.3.1 环境对光合相关性状关联位点的影响 | 第115页 |
| 5.3.2 关键标记位点与多个光合相关性状共关联 | 第115-116页 |
| 5.3.3 光合相关性状关联位点与产量性状QTL共区间 | 第116-119页 |
| 全文结论 | 第119-121页 |
| 本研究主要创新之处 | 第121-123页 |
| 参考文献 | 第123-143页 |
| 附录 | 第143-149页 |
| 攻读博士期间发表及待发表的论文 | 第149-151页 |
| 致谢 | 第151页 |
