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特殊环境来源微生物新木聚糖酶基因的克隆、表达及性质研究

中文摘要第3-4页
Abstract第4-5页
缩略词表第6-11页
第一章 引言第11-22页
    1.1 木聚糖第11-14页
        1.1.1 半纤维素与木聚糖第11-12页
        1.1.2 木聚糖的酶解第12-14页
    1.2 木聚糖酶研究进展第14-22页
        1.2.1 木聚糖酶的来源和生化特性第14-15页
        1.2.2 木聚糖酶的分类第15-16页
            1.2.2.1 第10/11家族(GH10/11)木聚糖酶第15-16页
        1.2.3 木聚糖酶的催化机制第16-17页
        1.2.4 木聚糖酶分子的结构区域第17-19页
            1.2.4.1 催化区第17-18页
            1.2.4.2 碳水化合物结构域第18页
            1.2.4.3 连接区和重复序列第18页
            1.2.4.4 热稳定区第18-19页
        1.2.5 木聚糖酶的克隆与分子进化第19页
        1.2.6 木聚糖酶的应用第19-20页
            1.2.6.1 在造纸工业上的应用第19页
            1.2.6.2 在食品工业上的应用第19-20页
            1.2.6.3 在饲料工业上的应用第20页
            1.2.6.4 木聚糖酶在其它方面的应用第20页
        1.2.7 本课题选题依据及创新点第20-21页
        1.2.8 本课题研究内容第21-22页
第二章 产木聚糖酶微生物的筛选、鉴定及木聚糖降解酶相关基因的克隆第22-36页
    2.1 实验材料第22-25页
        2.1.1 样品第22页
        2.1.2 菌株和质粒第22页
        2.1.3 主要试剂第22-23页
        2.1.4 引物合成及DNA测序第23页
        2.1.5 常用溶液第23页
        2.1.6 主要仪器设备第23-24页
        2.1.7 培养基第24-25页
    2.2 实验方法第25-30页
        2.2.1 样品的处理及木聚糖酶产生菌的筛选第25页
            2.2.1.1 样品的处理第25页
            2.2.1.2 产酶微生物的筛选第25页
            2.2.1.3 产木聚糖酶菌株的确定第25页
        2.2.2 菌株的鉴定第25-28页
            2.2.2.1 形态学观察第25-26页
            2.2.2.2 细菌基因组DNA的提取第26页
            2.2.2.3 16S rDNA的PCR扩增第26-27页
            2.2.2.4 PCR扩增产物的回收与纯化第27页
            2.2.2.5 DNA片段的连接和转化第27页
            2.2.2.6 阳性重组子的筛选及DNA测序第27-28页
        2.2.3 木聚糖降解酶相关基因的克隆第28-30页
            2.2.3.1 细菌基因组的提取及简并引物设计第28-29页
            2.2.3.2 木聚糖降解酶相关基因部分序列的克隆第29-30页
    2.3 结果与分析第30-35页
        2.3.1 产木聚糖酶微生物的筛选第30-31页
            2.3.1.1 平板初筛第30页
            2.3.1.2 产木聚糖酶菌株的确定第30-31页
        2.3.2 菌株SL3和SL4的鉴定第31-33页
            2.3.2.1 形态观察第31-32页
            2.3.2.2 16S rDNA序列分析第32-33页
        2.3.3 木聚糖降解酶相关基因部分序列的获得与分析第33-35页
    2.4 小结第35-36页
第三章 新木聚糖酶基因全长的克隆及序列分析第36-51页
    3.1 实验材枓第36-37页
        3.1.1 菌株和质粒第36页
        3.1.2 主要试剂第36页
        3.1.3 引物合成及DNA测序第36页
        3.1.4 常用溶液第36页
        3.1.5 主要仪器设备第36页
        3.1.6 培养基第36-37页
    3.2 实验方法第37-41页
        3.2.1 GH10木聚糖酶基因全长序列的获得第37-41页
            3.2.1.1 菌株SL3、SL4基因组DNA的提取第37页
            3.2.1.2 TAIL-PCR特异性引物的设计第37-38页
            3.2.1.3 三轮TAIL-PCR反应的体系及程序第38-40页
            3.2.1.4 TAIL-PCR目标产物的回收连接和测序第40-41页
        3.2.2 木聚糖酶基因全长拼接及序列分析第41页
    3.3 结果与分析第41-50页
        3.3.1 GH10木聚糖酶基因xynSL3和xynSL4全长序列的获得第41-43页
            3.3.1.1 GH10木聚糖酶基因xynSL3全长序列的获得第41-42页
            3.3.1.2 GH10木聚糖酶基因xynSL4全长序列的获得第42-43页
        3.3.2 GH10木聚糖酶基因xynSL3和xynSL4全长序列分析第43-47页
            3.3.2.1 木聚糖酶基因xynSL3全长序列分析第43-45页
            3.3.2.2 木聚糖酶基因xynSL4全长序列分析第45-47页
        3.3.3 XynSL4的氨基酸序列比对、三维结构预测及系统发育分析第47-50页
            3.3.3.1 XynSL4的氨基酸序列比对分析第47-48页
            3.3.3.2 XynSL4的三维结构预测第48-49页
            3.3.3.3 XynSL4的系统发育分析第49-50页
    3.4 小结第50-51页
第四章 新木聚糖酶的表达、纯化及性质研究第51-76页
    4.1 实验材料第51-53页
        4.1.1 菌株和质粒第51页
        4.1.2 主要试剂第51页
        4.1.3 引物合成及DNA测序第51页
        4.1.4 常用溶液第51-52页
        4.1.5 主要仪器设备第52页
        4.1.6 培养基第52-53页
    4.2 实验方法第53-63页
        4.2.1 原核表达载体pET-xynSL4的构建第53-56页
            4.2.1.1 木聚糖酶基因xynSL4的克隆第53页
            4.2.1.2 酶切与连接第53-54页
            4.2.1.3 重组质粒pET-xynSL4转化大肠杆菌BL21(DE3)第54-55页
            4.2.1.4 重组酶XynSL4在大肠杆菌BL21 (DE3)中的表达第55-56页
        4.2.2 重组酶XynSL4的纯化第56-59页
            4.2.2.1 重组酶XynSL4的大量诱导和浓缩第56页
            4.2.2.2 重组酶XynSL4的镍柱纯化第56-57页
            4.2.2.3 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳第57-58页
            4.2.2.4 BCA法测定蛋白浓度第58-59页
        4.2.3 重组酶XynSL4的酶活测定第59-60页
            4.2.3.1 木聚糖酶的酶活测定第59-60页
            4.2.3.2 酶活定义单位第60页
        4.2.4 重组酶XynSL4的性质测定第60-63页
            4.2.4.1 重组酶XynSL4最适反应pH及pH稳定性测定第60页
            4.2.4.2 重组酶XynSL4最适反应温度及热稳定性测定第60页
            4.2.4.3 重组酶XynSL4在60℃下的pH稳定性第60-61页
            4.2.4.4 底物的存在对XynSL4在60℃下的pH稳定性的影响第61页
            4.2.4.5 底物的存在对XynSL4在pH 7.0下的热稳定性的影响第61页
            4.2.4.6 不同底物的存在对XynSL4在pH 7.0下的热稳定性的影响第61页
            4.2.4.7 不同金属离子及化学试剂对XynSL4的影响第61页
            4.2.4.8 NaCl浓度对XynSL4酶活的影响及XynSL4的盐耐受性第61页
            4.2.4.9 重组酶XynSL4比活的测定第61-62页
            4.2.4.10 重组酶XynSL4K_m值和V_(max)的测定第62页
            4.2.4.11 重组酶XynSL4降解木聚糖的产物分析第62-63页
    4.3 结果与分析第63-74页
        4.3.1 重组酶XynSL4在大肠杆菌中的表达与纯化第63-64页
        4.3.2 重组酶XynSL4的酶学性质研究第64-74页
            4.3.2.1 重组酶XynSL4的基本酶学性质第64-66页
            4.3.2.2 重组酶XynSL4在60℃下的pH稳定性第66-67页
            4.3.2.3 底物对XynSL4在60℃下pH稳定性的影响第67-68页
            4.3.2.4 底物对XynSL4在70℃下热稳定性的影响第68-69页
            4.3.2.5 不同底物对XynSL4在70℃下热稳定性的影响第69-70页
            4.3.2.6 不同金属离子及化学试剂对XynSL4酶活性的影响第70-71页
            4.3.2.7 NaCl浓度对XynSL4酶活的影响及XynSL4的盐耐受性第71-72页
            4.3.2.8 重组酶XynSL4K_m值V_(max)和K_(cat)的测定第72-73页
            4.3.2.9 重组酶XynSL4降解木聚糖的产物分析第73-74页
    4.4 小结第74-76页
结论与展望第76-78页
    结论第76-77页
    展望第77-78页
参考文献第78-86页
致谢第86-87页
个人简历第87页

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