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猪传染性胃肠炎病毒的分离鉴定及其基因组测序分析

摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
1 前言第11-24页
    1.1 TGE的流行性及危害性第11-12页
        1.1.1 传染源、传播途径、宿主第11页
        1.1.2 流行特点第11-12页
        1.1.3 危害性第12页
    1.2 病原学第12-15页
        1.2.1 TGE病毒的分类地位第12-13页
        1.2.2 形态学特征及其培养特性第13-14页
        1.2.3 抗原性和变异性第14页
        1.2.4 物理性质和化学性质第14-15页
    1.3 TGE发病机理第15页
    1.4 病理变化及临床症状第15-16页
        1.4.1 病理变化第15-16页
        1.4.2 临床症状第16页
    1.5 分子生物学第16-22页
        1.5.1 基因组结构第16-17页
        1.5.2 TGEV的结构基因第17-21页
        1.5.3 非结构基因第21-22页
    1.6 TGE的分离第22页
    1.7 研究的目的和意义第22-24页
2 材料与方法第24-34页
    2.1 实验材料第24-25页
        2.1.1 病料来源及细胞第24页
        2.1.2 毒株、菌株第24页
        2.1.3 主要试验试剂第24页
        2.1.4 主要试验试剂及培养基的配制第24-25页
    2.2 实验方法第25-34页
        2.2.1 疑似病料的处理第25页
        2.2.2 组织总RNA的提取第25页
        2.2.3 病料处理液在ST细胞上的盲传及PCR鉴定第25-26页
        2.2.4 间接免疫荧光(Indirect immunofluorescence assay,IFA)实验第26页
        2.2.5 病毒粒子透射电镜观察第26页
        2.2.6 TGEV分离株全基因组片段的RT-PCR分段扩增第26-28页
        2.2.7 RACE法获取 5'末端和 3'末端非编码区片段第28-31页
        2.2.8 目的基因的克隆及序列测定第31页
        2.2.9 TGEV全基因组序列的生物信息学分析第31-32页
        2.2.10 病毒理化性质鉴定第32-34页
3 结果第34-49页
    3.1 TGEV分离株的分离及细胞病变观察第34-35页
    3.2 TGEV分离株的间接免疫荧光鉴定第35-36页
    3.3 TGEV分离株的电镜观察结果第36页
    3.4 全基因组RT-PCR分段扩增结果第36-37页
    3.5 全基因组序列的生物信息学分析第37-47页
        3.5.1 分离株全基因组序列拼接第37页
        3.5.2 全基因组基因组结构分析第37-41页
        3.5.3 全基因组序列同源性分析第41-42页
        3.5.4 系统进化树分析第42-45页
        3.5.5 TGEV S蛋白结构分析第45-47页
    3.6 病毒的理化性质实验第47-49页
        3.6.1 pH3.0 稳定实验第47页
        3.6.2 分离株氯仿敏感性实验第47页
        3.6.3 醚敏感性实验第47-48页
        3.6.4 热敏实验第48-49页
4 讨论第49-54页
    4.1 病毒的分离鉴定第49页
    4.2 病毒全基因组分段扩增第49-50页
    4.3 分离株生物信息学分析第50-52页
    4.4 S蛋白结构分析第52-54页
5 结论第54-55页
致谢第55-56页
参考文献第56-66页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第66页

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