致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 引言 | 第11-33页 |
1.1 基于质谱的蛋白质组学研究现状 | 第11-13页 |
1.2 定量蛋白质组学 | 第13-20页 |
1.2.1 代谢标记 | 第14-15页 |
1.2.2 化学标记 | 第15-19页 |
1.2.2.1 iTRAQ和TMT标记 | 第16-17页 |
1.2.2.2 二甲基标记法 | 第17页 |
1.2.2.3 ~(18)O标记 | 第17-19页 |
1.2.3 SRM、MRM和PRM | 第19-20页 |
1.2.4 非标定量 | 第20页 |
1.3 银屑病概述 | 第20-29页 |
1.3.1 银屑病 | 第20-22页 |
1.3.2 寻常型银屑病的临床和组织学特征 | 第22-24页 |
1.3.3 寻常型银屑病的病理学研究现况 | 第24-29页 |
1.3.3.1 免疫发生的分子通路 | 第24-25页 |
1.3.3.2 炎症发生的分子通路 | 第25-27页 |
1.3.3.3 遗传因素的影响 | 第27-29页 |
1.4 甲氨蝶呤治疗银屑病的研究现况 | 第29-33页 |
1.4.1 甲氨蝶呤的临床应用和疗效 | 第29-30页 |
1.4.2 甲氨蝶呤的作用机制研究现况 | 第30-33页 |
第2章 用于银屑病治疗的甲氨蝶呤药物蛋白质组学研究 | 第33-62页 |
2.1 实验材料 | 第33-36页 |
2.1.1 试剂与耗材 | 第33-35页 |
2.1.2 溶液的配制方法 | 第35-36页 |
2.2 实验方法 | 第36-42页 |
2.2.1 样本获取方法 | 第36-37页 |
2.2.2 色氨酸荧光定量方法 | 第37页 |
2.2.3 SDS-PAGE电泳胶 | 第37-38页 |
2.2.4 超滤膜辅助酶解方法(FASP)酶解 | 第38页 |
2.2.5 BCA蛋白浓度测定 | 第38页 |
2.2.6 iTRAQ标记 | 第38-39页 |
2.2.7 High pH RP分级 | 第39页 |
2.2.8 Western Blot方法验证 | 第39-40页 |
2.2.9 色谱柱的灌制 | 第40-41页 |
2.2.10 液相色谱方法 | 第41页 |
2.2.11 质谱方法 | 第41页 |
2.2.12 数据库搜索 | 第41-42页 |
2.2.13 生物信息学分析 | 第42页 |
2.3 实验结果 | 第42-59页 |
2.3.1 实验设计 | 第42-45页 |
2.3.2 质谱数据总览 | 第45页 |
2.3.3 实验数据的质量分析 | 第45-47页 |
2.3.4 差异表达蛋白表达谱分析 | 第47-49页 |
2.3.5 差异表达蛋白生物学过程与信号通路富集分析 | 第49-51页 |
2.3.6 差异表达蛋白-蛋白相互作用网络 | 第51-52页 |
2.3.7 差异表达蛋白模糊聚类分析(Fuzzy c-means) | 第52-53页 |
2.3.8 PPI—发现潜在生物标志物 | 第53-55页 |
2.3.9 潜在生物标志物的验证 | 第55-59页 |
2.4 讨论 | 第59-62页 |
第3章 结论与讨论 | 第62-65页 |
3.1 组学数据的价值有待进一步挖掘 | 第62页 |
3.2 药物蛋白质组学方法为银屑病复杂机制的探讨提供了新思路 | 第62-63页 |
3.3 药物蛋白质组学方法为甲氨蝶呤作用机制研究给予新的认识 | 第63-64页 |
3.4 总结和展望 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-78页 |
附录 | 第78-85页 |
附录1 缩略词表 | 第78-81页 |
附录2 MTX作用机制可能的潜在生物标志物列表 | 第81-82页 |
附录3 差异蛋白质模糊聚类分析 3-7 类 | 第82-85页 |
作者简历 | 第85页 |