| 摘要 | 第8-12页 |
| ABSTRACT | 第12-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-37页 |
| 1.1 多杀性巴氏杆菌 | 第17-25页 |
| 1.2 微生物基因组学研究进展 | 第25-32页 |
| 1.3 免疫蛋白质组学 | 第32-33页 |
| 1.4 反向疫苗学 | 第33-34页 |
| 1.5 疫苗候选分子的研究进展 | 第34-37页 |
| 第二章 引言 | 第37-41页 |
| 2.1 研究背景 | 第37页 |
| 2.2 研究目的及意义 | 第37-38页 |
| 2.3 主要研究内容 | 第38-39页 |
| 2.4 技术路线 | 第39-41页 |
| 第三章 牛源多杀性巴氏杆菌全基因组的测序 | 第41-63页 |
| 3.1 材料与方法 | 第41-46页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第41-42页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第42-46页 |
| 3.2 结果与分析 | 第46-59页 |
| 3.2.1 多杀性巴氏杆菌菌落形态及致病性分析 | 第46-49页 |
| 3.2.2 4株菌株基因组的种型鉴定 | 第49-50页 |
| 3.2.3 基因组测序、拼接组装 | 第50-51页 |
| 3.2.4 基因组功能注释 | 第51-55页 |
| 3.2.5 全基因组信息图的绘制 | 第55-57页 |
| 3.2.6 RNA预测 | 第57-58页 |
| 3.2.7 假基因预测 | 第58页 |
| 3.2.8 噬菌体相关基因预测 | 第58-59页 |
| 3.2.9 全基因组序列提交 | 第59页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第59-63页 |
| 第四章 多杀性巴氏杆菌比较基因组学分析 | 第63-87页 |
| 4.1 材料与方法 | 第63-65页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第63页 |
| 4.1.2 主要方法 | 第63-65页 |
| 4.2 结果与分析 | 第65-82页 |
| 4.2.1 进化树的构建及菌株筛选 | 第65-67页 |
| 4.2.2 基因组共线性分析 | 第67-70页 |
| 4.2.3 BSR分析 | 第70-72页 |
| 4.2.4 插入序列分析 | 第72-74页 |
| 4.2.5 差异基因分析 | 第74-75页 |
| 4.2.6 毒力相关基因分析 | 第75-80页 |
| 4.2.7 双组分调控系统分析 | 第80-81页 |
| 4.2.8 膜蛋白和分泌蛋白的分析 | 第81-82页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第82-87页 |
| 第五章 候选保护性抗原的筛选 | 第87-121页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第87-102页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第87-92页 |
| 5.1.2 主要方法 | 第92-102页 |
| 5.2 结果与分析 | 第102-117页 |
| 5.2.1 通过比较基因组学筛选候选抗原 | 第102-104页 |
| 5.2.2 4株Pm外膜蛋白的蛋白质组学分析 | 第104页 |
| 5.2.3 外膜蛋白质谱分析及生物信息学分析 | 第104-106页 |
| 5.2.4 候选基因的克隆表达及表达产物纯化 | 第106-108页 |
| 5.2.5 小鼠模型建立 | 第108-114页 |
| 5.2.6 候选抗原反应原性分析 | 第114-116页 |
| 5.2.7 候选抗原免疫原性分析 | 第116-117页 |
| 5.3 结论与讨论 | 第117-121页 |
| 第六章 rPmCQ2_1g0327交叉保护性分析 | 第121-143页 |
| 6.1 实验材料与方法 | 第121-125页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第121页 |
| 6.1.2 主要方法 | 第121-125页 |
| 6.2 结果与分析 | 第125-139页 |
| 6.2.1 PmCQ2_1g0327的基本特征 | 第125-127页 |
| 6.2.2 PmCQ2_1g0327的特异性分析 | 第127-128页 |
| 6.2.3 PmCQ2_1g0327的抗原表位预测分析 | 第128-131页 |
| 6.2.4 优势抗原表位的克隆表达和纯化 | 第131-132页 |
| 6.2.5 不同片段的反应原性分析和免疫原性分析 | 第132-133页 |
| 6.2.6 PmCQ2_1g0327蛋白的同源性分析 | 第133-134页 |
| 6.2.7 PmCQ2_1g0327的共线性分析 | 第134-135页 |
| 6.2.8 PmB_1759g0022的抗原表位分析 | 第135-137页 |
| 6.2.9 rPmB_1759g0022反应原性分析 | 第137-138页 |
| 6.2.10 rPmCQ2_1g0327定位特征和黏附的影响 | 第138-139页 |
| 6.3 结论与讨论 | 第139-143页 |
| 第七章 综合与结论 | 第143-147页 |
| 7.1 多杀性巴氏杆菌全基因组的测序 | 第143-144页 |
| 7.2 多杀性巴氏杆菌的比较基因组学分析 | 第144页 |
| 7.3 保护性候选抗原分子的筛选 | 第144-145页 |
| 7.4 rPmCQ2_1g0327交叉保护性研究 | 第145-147页 |
| 论文创新点 | 第147-149页 |
| 参考文献 | 第149-163页 |
| 在读期间发表的文章及参研课题 | 第163-165页 |
| 附录 | 第165-199页 |
| 致谢 | 第199-201页 |
