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坛紫菜孢子体世代及配子体世代间microRNA差异表达谱的初步研究

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第1章 引言第11-28页
   ·紫菜孢子体世代和配子体世代基因的差异表达研究第11-12页
   ·基因表达调控的研究第12-13页
   ·植物 miRNA 的研究第13-26页
     ·miRNA 概述第14页
     ·miRNA 的形成与作用机制第14-16页
     ·miRNA 的鉴别第16-18页
     ·miRNA 的生物学实验验证第18-21页
     ·miRNA 靶基因的预测及验证第21-22页
     ·miRNA 与 siRNA 的区别第22-23页
     ·植物 miRNA 的特点第23-24页
     ·植物 miRNA 的生物学功能第24-25页
     ·藻类 miRNA 的研究第25-26页
   ·本研究的目的意义第26-27页
   ·本研究的技术路线第27-28页
第2章 材料和方法第28-38页
   ·实验材料第28页
   ·实验仪器第28页
   ·实验试剂第28-29页
   ·实验引物第29页
   ·实验方法第29-38页
     ·材料培养第29-30页
     ·叶状体总 RNA 的提取第30-31页
     ·丝状体总 RNA 的提取方法第31-32页
     ·总 RNA 质量检测第32页
     ·总 RNA 的逆转录检测第32-33页
     ·小分子 RNA 的高通量测序第33-34页
     ·高通量测序数据的生物信息学分析第34-35页
     ·miRNA 表达水平的实时荧光定量 PCR 验证第35-37页
     ·miRNA 靶基因的预测第37页
     ·miRNA 靶基因的 COG 分类及 KEGG 代谢途径分析第37-38页
第3章 实验结果第38-53页
   ·坛紫菜叶状体总 RNA 不同提取方法的结果比较第38-39页
   ·RNA 的逆转录检测第39-40页
   ·坛紫菜小 RNA 文库高通量测序数据的初步分析第40-42页
   ·小 RNAs 数据的分类注释第42页
   ·坛紫菜已知 miRNA 的鉴定第42-43页
   ·坛紫菜新 miRNA 的预测第43-46页
   ·坛紫菜 miRNA 家族的保守性分析第46页
   ·坛紫菜孢子体世代和配子体世代 miRNA 差异表达谱分析第46-48页
   ·miRNA 相对表达丰度的实时荧光定量 PCR 检测第48-50页
   ·坛紫菜 miRNA 靶基因预测第50-53页
第4章 讨论第53-60页
   ·坛紫菜叶状体 RNA 不同分离方法的比较分析第53-54页
   ·多糖等次生代谢物对坛紫菜叶状体总 RNA 提取的影响第54-55页
   ·坛紫菜 sRNA 的特点第55页
   ·坛紫菜新预测 miRNA 的特点第55-56页
   ·坛紫菜 miRNA 家族的保守性分析第56-57页
   ·miRNA 在坛紫菜不同世代间的差异表达及功能分析第57-58页
   ·miRNA 表达水平的实时荧光定量 PCR 验证第58-59页
   ·进一步研究的设想第59-60页
结论第60-61页
致谢第61-62页
参考文献第62-72页
附录第72-94页

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