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一种新型基于锁核酸的低丰度未知突变基因富集方法的研究

致谢第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
专业词汇中英文对照表第11-16页
第一章 绪论第16-32页
   ·检测突变基因的意义第16-18页
   ·低丰度突变基因检测方法的发展现状第18-28页
     ·针对已知基因突变的富集检测方法第19-21页
     ·针对未知基因突变的富集检测方法第21-24页
     ·COLD-PCR和ice-COLD-PCR第24-28页
   ·本课题立项依据及主要研究内容第28-32页
第二章 标准样品的构建第32-52页
   ·基因的克隆第32-43页
     ·TP53基因第8外显子序列第32页
     ·载体第32-34页
     ·目的序列的扩增第34-36页
     ·酶切第36-37页
     ·连接第37页
     ·CaCl_2法制备大肠杆菌感受态细胞TOP10第37-38页
     ·转化第38-39页
     ·PCR法筛选阳性克隆第39-42页
     ·测序鉴定第42-43页
   ·突变体构建第43-49页
     ·定点突变第43-44页
     ·PCR产物回收第44-46页
     ·酶切第46-47页
     ·连接第47页
     ·转化第47页
     ·PCR法筛选阳性克隆第47-49页
     ·测序鉴定第49页
   ·标准样品的构建第49-51页
     ·质粒的提取第49-51页
     ·稀释法构建标准样品第51页
     ·测序验证第51页
   ·小结第51-52页
第三章 封闭序列的合成及其理化性质分析第52-64页
   ·封闭序列的设计第52页
   ·封闭序列的合成与纯化第52-55页
     ·封闭序列的合成第52-53页
     ·封闭序列的纯化第53-55页
   ·纯化产物产率的计算第55-56页
   ·封闭序列的质谱鉴定第56-57页
   ·封闭序列的熔解曲线测定第57-59页
     ·封闭序列与反向互补序列之间进行退火第57页
     ·3%Agarose 电泳验证退火效率第57页
     ·Real Time测定熔解曲线第57-59页
   ·单碱基错配对封闭序列Tm值的影响第59-61页
   ·本章小结第61-64页
第四章 LNA-COLD-PCR平台的搭建第64-104页
   ·不同关键变性温度对野生型及突变型基因扩增效果的影响第64-66页
   ·混合样品的初步条件摸索第66-71页
   ·LNA-COLD-PCR条件的系统优化第71-95页
     ·以含有G818A的标准样品进行LNA-COLD-PCR的条件优化第71-90页
       ·BS60-1终浓度250pM第71-75页
       ·BS60-1终浓度2.5nM第75-79页
       ·BS60-1终浓度25nM第79-82页
       ·BS60-1终浓度10nM第82-86页
       ·比较不同BS60-1浓度对G818A富集效果的影响第86-87页
       ·不同模板浓度对G818A富集效果的影响第87-90页
     ·以含有C847T的标准样品进行LNA-COLD-PCR的条件优化第90-95页
   ·不同标准检测样品的富集检测效果第95页
   ·其他封闭序列的尝试第95-98页
   ·对照方法的选择第98-100页
   ·标准样本的检测第100-101页
   ·讨论第101-102页
   ·本章小结第102-104页
第五章 总结第104-106页
参考文献第106-116页
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第116页

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