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组蛋白乙酰化修饰调控果蝇热休克基因表达和寿命的分子机制研究

中文摘要第1-5页
英文摘要第5-7页
目录第7-11页
引言第11-16页
 一、研究背景和立题依据第11-13页
 二、亟待解决的问题第13页
 三、本文的研究内容和意义第13-16页
第一章 文献综述第16-47页
 一、真核生物染色质结构与基因转录活性第16-32页
  (一) 真核生物的染色质结构第16页
  (二) 核小体重塑复合物第16-18页
   1. 依赖于ATP的核小体重塑复合物第17页
   2. 组蛋白酶类修饰复合物第17-18页
  (三) 组蛋白乙酰基转移酶的功能及其分类第18-25页
   1. 组蛋白乙酰基转移酶及其复合物的种类第18-20页
   2. 组蛋白乙酰基转移酶及其复合物的功能第20-25页
  (四) 组蛋白去乙酰化酶及其抑制剂第25-32页
   1. 组蛋白去乙酰化酶的分类第25-28页
   2. 组蛋白去乙酰化酶的功能第28-30页
   3. 组蛋白去乙酰化酶抑制剂第30-32页
 二、热休克蛋白的生物学功能及其表达调控第32-38页
  (一) 热休克蛋白的生物学功能第32-35页
   1. 热休克蛋白的分子伴侣活性第32-33页
   2. 热休克蛋白与细胞凋亡第33页
   3. 热休克蛋白与免疫调控第33-34页
   4. 热休克蛋白在衰老中的作用第34-35页
  (二) 热休克蛋白的表达调控第35-38页
   1. 热休克基因的顺式作用元件第35页
   2. 热休克基因的反式作用因子第35-36页
   3. 热休克基因的表达调控第36-37页
   4. 组蛋白乙酰化修饰与热休克基因表达调控的关系第37-38页
 三、生物衰老与寿命调控第38-47页
  (一) 机体代谢速率与寿命第38-39页
  (二) 氧化损伤与衰老第39-41页
   1. 活性氧及其来源第39-40页
   2. 活性氧代谢第40页
   3. 不饱和脂肪酸第40-41页
  (三) 类固醇激素对寿命的调控第41-42页
   1. 类固醇对寿命的调控第41-42页
   2. 胰岛素/IGF 信号通路在寿命调控中的作用第42页
  (四) 果蝇中影响寿命的基因第42-47页
   1. 基因功能降低可延长寿命的基因第43-44页
   2. 过表达延长寿命的基因第44-47页
第二章 组蛋白乙酰化修饰、热休克蛋白表达和果蝇寿命的关系研究第47-77页
 一、实验材料与方法第47-56页
  (一) 实验材料第47页
   1. 果蝇第47页
   2. 主要试剂第47页
  (二) 实验方法第47-56页
   1. 果蝇的培养第47-48页
   2. 果蝇寿命统计第48页
   3. 筛选长寿和短寿的果蝇品系第48页
   4. 果蝇的去乙酰化酶抑制剂处理和热激诱导第48-49页
   5. 果蝇总RNA 的提取第49-51页
   6. 逆转录PCR第51-52页
   7. 定量Real Time PCR第52-53页
   8. 果蝇全蛋白及核蛋白的提取第53-54页
   9. SDS-PAGE 电泳和Western Blotting 分析第54-56页
 二、结果与分析第56-72页
  (一) 实验条件的确定第56-58页
   1. RT-PCR 反应中模板浓度的确定第56页
   2. RT-PCR 反应循环数的确定第56-57页
   3. 果蝇温和热激诱导温度的确定第57-58页
  (二) 果蝇长寿品系和短寿品系的筛选第58-59页
  (三) 热休克蛋白的表达与果蝇寿命的关系第59-65页
   1. 不同寿命的果蝇衰老过程中hsp 基因基础表达的差异第59-61页
   2. 不同寿命的果蝇hsp 基因热诱导反应灵敏度和诱导强度的差异第61-64页
   3. 不同寿命的果蝇耐热能力的差异第64-65页
  (四) 组蛋白乙酰化修饰以及热激诱导与果蝇寿命的关系第65-68页
   1. HDI处理和热激诱导对果蝇体内组蛋白乙酰化水平的影响第65页
   2. HDI处理和热激诱导对果蝇寿命长短的影响第65-68页
  (五) 果蝇衰老过程中组蛋白乙酰化修饰与HSP 表达调控的关系第68-72页
   1. HDI处理对果蝇衰老过程中hsp m RNA表达水平的影响第69-71页
   2. HDI处理对果蝇衰老过程中 Hsp 蛋白表达水平的影响第71-72页
 三、讨论第72-76页
  (一) 热休克基因的表达与果蝇寿命第72-73页
  (二) 组蛋白乙酰化修饰与果蝇热休克基因表达调控的关系第73页
  (三) 组蛋白乙酰化与去乙酰化修饰与果蝇寿命第73-75页
  (四) 去乙酰化酶抑制剂延长果蝇寿命的分子模型第75-76页
 四、小结第76-77页
第三章 组蛋白乙酰化修饰影响果蝇hsp 基因表达调控的分子机制研究第77-118页
 一、实验材料与方法第77-82页
  (一) 实验材料第77页
   1. 果蝇三龄幼虫第77页
   2. 主要试剂第77页
  (二) 实验方法第77-82页
   1. 果蝇的培养第77-78页
   2. 果蝇的去乙酰化酶抑制剂处理和热激诱导第78页
   3. 染色质免疫沉淀第78-82页
 二、实验结果与分析第82-110页
  (一) 果蝇幼虫中CHIP 实验体系的建立第82-85页
   1. ChIP 实验中果蝇幼虫用量的确定第82-83页
   2. ChIP 实验DNA 剪切条件的确定第83-84页
   3. 甲醛交联的浓度和时间的确定第84-85页
   4. 实验体系的确立第85页
  (二) 组蛋白乙酰化修饰调控hsp22 基因表达的分子机制第85-93页
   1. HDI 处理提高了果蝇幼虫hsp22 的mRNA 表达水平第86-87页
   2. HDI 处理诱导果蝇幼虫组蛋白H3 的超乙酰化第87-88页
   3. HDI 处理诱导了hsp22 基因位点处组蛋白H3 的超乙酰化第88-89页
   4. 组蛋白H3的超乙酰化有利转录因子与特异序列的结合第89-91页
   5. 组蛋白H3 的超乙酰化增强了RNA polⅡ的转录起始与延伸第91-93页
  (三) 组蛋白乙酰化修饰调控hsp70 基因表达的分子机制研究第93-101页
   1. HDI处理对hsp70 基因位置处组蛋白H3 乙酰化水平的影响第93-95页
   2. 热激过程中hsp70 基因启动子处组蛋白H3 乙酰化水平的变化第95-96页
   3. 乙酰化水平的变化对转录因子结合的影响第96-99页
   4. 组蛋白乙酰化水平的变化对hsp70 转录的影响第99-101页
  (四) 组蛋白乙酰化修饰调控hsp26 基因表达的分子机制研究第101-110页
   1. HDI 处理对hsp26 基因mRNA 表达水平的影响第102-104页
   2. HDI处理对hsp26基因启动子不同调控元件处组蛋白H3乙酰化水平的影响第104-105页
   3. 组蛋白H3 的超乙酰化对转录因子结合的影响第105-107页
   4. 热激过程中hsp26启动子处组蛋白H3乙酰化水平的变化第107-108页
   5. 组蛋白乙酰化修饰与RNA polⅡ转录的关系第108-110页
 三、讨论第110-116页
  (一) 组蛋白乙酰化修饰参与果蝇热休克基因的表达调控第110-111页
  (二) 乙酰化修饰与转录因子、转录因子与转录因子之间的关系第111-112页
  (三) 乙酰化修饰与RNA polⅡ转录的关系第112-113页
  (四) 参与hsp基因表达的组蛋白乙酰化酶和去乙酰化酶第113-114页
  (五) 热激过程中hsp基因启动子处染色质的重塑第114-115页
  (六) 热休克基因表达调控的分子模型第115-116页
 四、小结第116-118页
本论文的结论与创新点第118-119页
参考文献第119-142页
英文缩写词第142-143页
致谢第143-144页
作者简介第144页

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