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Asia1型口蹄疫病毒衣壳蛋白进化踪迹分析

摘要第1-7页
Abstract第7-11页
英文缩略表第11-12页
第一章 前言第12-17页
   ·口蹄疫第12-14页
     ·FMDV的结构蛋白第12-13页
     ·FMDV衣壳蛋白的抗原特性第13-14页
     ·FMDV衣壳蛋白的受体结合特性第14页
     ·FMDV衣壳蛋白的相互作用界面第14页
   ·预测重要功能残基的计算机辅助技术第14-16页
     ·同源建模第15页
     ·踪迹残基分析方法第15-16页
   ·研究的目的和意义第16-17页
第二章 衣壳蛋白VP1~VP4四聚体结构的同源建模及其优化第17-22页
   ·材料和方法第17-18页
     ·硬件与软件第17页
     ·模板序列与目标序列第17页
     ·同源建模第17页
     ·模型优化第17-18页
     ·结构模型的合理性评估第18页
   ·结果第18-21页
     ·模板序列与目标序列比对结果第18页
     ·建模及优化结果第18-19页
     ·模型评估结果第19-21页
   ·讨论第21-22页
第三章 衣壳蛋白进化踪迹分析第22-33页
   ·材料和方法第22-23页
     ·服务器和软件第22页
     ·蛋白质序列第22-23页
     ·序列比对第23页
     ·进化踪迹分析第23页
   ·结果第23-32页
     ·ET分区内组别第23-26页
     ·各分组的组特异残基第26-31页
     ·踪迹残基可以唯一确定FMDV毒株第31-32页
   ·讨论第32-33页
第四章 衣壳蛋白抗原位点与相互作用界面残基的预测第33-42页
   ·材料与方法第33页
     ·服务器与软件第33页
     ·构建好的模型与ET分析结果第33页
     ·抗原性区域功能性氨基酸的预测第33页
     ·鉴定位于蛋白亚基相互作用界面的氨基酸残基第33页
     ·高度保守组件RGD的分析第33页
   ·结果第33-40页
     ·具有抗原性的重要功能氨基酸残基第33-37页
     ·相互作用界面上的氨基酸残基第37-40页
     ·高度保守组件RGD的分析第40页
   ·讨论第40-42页
第五章 结论第42-43页
参考文献第43-49页
致谢第49-50页
作者简历第50页

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