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鸭肠炎病毒UL18基因部分特性及其原核表达蛋白应用的研究

本论文的创新性工作第1-5页
中文摘要第5-6页
ABSTRACT第6-8页
常用英文缩写词汇第8-15页
第一部分 文献综述第15-20页
 第一章 疱疹病毒UL18基因及其编码蛋白的研究进展第15-20页
  1 疱疹病毒UL18基因序列特点第15页
  2 疱疹病毒UL18编码蛋白特点第15-16页
  3 UL18蛋白的作用第16-18页
   ·VP23与核衣壳的形成第16-18页
   ·VP23对衣壳关闭的作用第18页
   ·VP23对病毒毒力的影响第18页
   ·UL18蛋白限制NK细胞介导杀伤作用第18页
  4 UL18蛋白的定位第18-19页
  5 展望第19-20页
第二部分 实验研究第20-87页
 第二章 鸭肠炎病毒UL18基因的序列特征及密码子偏爱性分析第20-38页
  摘要第20页
  1 材料与方法第20-22页
   ·材料第20-21页
     ·基因文库第20-21页
     ·实验数据第21页
     ·主要生物信息学分析软件第21页
   ·方法第21-22页
     ·DEV UL18基因核酸序列的分子特性分析第21-22页
     ·DEV UL18基因编码蛋白序列的分子特性分析第22页
     ·DEV UL18基因的密码子偏爱性分析第22页
  2 结果第22-32页
   ·DEV UL18基因核酸序列的分子特征第22-23页
   ·DEV UL18基因编码蛋白序列的分子特征第23-29页
     ·DEV UL18基因编码蛋白的氨基酸组成分析第23-24页
     ·DEV UL18基因编码蛋白的结构域第24页
     ·DEV UL18基因编码蛋白的系统进化树第24页
     ·DEV UL18基因编码蛋白信号肽切割位点预测第24-25页
     ·DEV UL18基因编码蛋白磷酸化位点预测第25-26页
     ·DEV UL18基因编码蛋白糖基化位点预测第26页
     ·DEV UL18基因编码蛋白跨膜区预测第26页
     ·DEV UL18基因编码蛋白疏水性分析第26-27页
     ·DEV UL18基因编码蛋白抗原性分析第27-28页
     ·DEV UL18基因编码蛋白二级结构和三级结构预测分析第28-29页
     ·DEV UL18基因编码蛋白的亚细胞定位第29页
   ·DEV UL18基因的密码子偏爱性第29-32页
     ·DEV UL18基因与27种疱疹病毒UL18基因密码子使用偏爱性分析第29页
     ·DEV UL18基因密码子使用和氨基酸组成的偏爱性分析第29-31页
     ·DEV UL18基因密码子使用与人、酵母和大肠杆菌密码子使用偏爱性比较第31-32页
  3 讨论第32-37页
   ·DEV UL18基因的分子特性第32-34页
   ·DEV UL18基因编码蛋白的抗原性第34-35页
   ·DEV UL18编码蛋白与其它疱疹病毒UL18蛋白间的系统进化关系第35-36页
   ·DEV UL18基因的密码子偏爱性第36-37页
  4 小结第37页
  Abstract第37-38页
 第三章 鸭肠炎病毒UL18基因的原核表达、抗体制备及应用第38-75页
  摘要第38页
  1 材料第38-42页
   ·菌株、毒株和质粒第38页
   ·实验动物第38页
   ·主要试剂及其配制第38-42页
     ·主要试剂第38-40页
     ·主要试剂配制第40-42页
   ·主要仪器设备第42页
  2 方法第42-54页
   ·DEV UL18基因的克隆第42-44页
     ·引物设计第42页
     ·DNA的提取第42-43页
     ·PCR扩增DEV UL18基因第43页
     ·DEV UL18基因的PCR产物回收第43页
     ·DEV UL18基因的T-载体克隆与鉴定第43-44页
   ·DEV UL18基因原核表达质粒的构建第44-45页
     ·pMD18-T-UL18与表达质粒pET-32a(+)的提取、酶切与回收第44-45页
     ·构建重组表达菌株第45页
   ·DEV UL18重组蛋白的诱导表达及条件优化第45-47页
     ·重组表达质粒pET32a-UL18的诱导表达第46页
     ·重组质粒pET32a-UL18诱导条件优化第46-47页
   ·DEV UL18重组蛋白的纯化第47-48页
     ·重组表达蛋白的可溶性分析第47页
     ·重组质粒pET32a-UL18大量诱导表达第47页
     ·重组蛋白的纯化第47页
     ·重组蛋白的复性第47页
     ·Western Blotting检测第47-48页
   ·兔抗DEV UL18重组蛋白抗体的制备及纯化第48-49页
     ·兔抗重组蛋白高免血清的制备第48页
     ·免抗DEV UL18重组蛋白效价测定第48页
     ·兔抗重组蛋白高免血清IgG的纯化及鉴定第48-49页
   ·基于DEV UL18重组蛋白间接ELISA法检测DEV抗体的应用第49-50页
     ·最佳抗原包被浓度和血清稀释度的确定第49页
     ·最佳酶标二抗工作浓度的确定第49页
     ·DEV-UL18-ELISA方法临界值的确定第49页
     ·特异性试验第49页
     ·敏感性试验第49页
     ·重复性试验第49-50页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫组化法检测DEV感染鸭组织的应用第50-51页
     ·组织样品的采集与处理第50页
     ·间接免疫酶组化检测DEV UL18蛋白方法的建立第50页
     ·间接免疫酶组化检测DEV UL18蛋白方法的优化第50页
     ·特异性实验第50-51页
     ·结果判断标准第51页
     ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫组化法对DEV感染鸭组织的检测第51页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光法检测DEV感染鸭组织的应用第51-53页
     ·组织样品的采集与处理第51页
     ·间接免疫荧光检测DEV UL18蛋白方法的建立第51-52页
     ·间接免疫荧光检测DEV感染鸭组织UL18蛋白方法的优化第52页
     ·特异性实验第52页
     ·结果判断标准第52-53页
     ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光法对DEV感染鸭组织的检测第53页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光法检测DEV感染宿主细胞的应用第53-54页
     ·免疫荧光检测DEV感染宿主细胞方法的建立第53页
     ·免疫荧光检测DEV感染宿主细胞条件的优化第53-54页
     ·免疫荧光特异性检测第54页
     ·间接免疫荧光检测的结果判定第54页
     ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光法对DEV感染宿主细胞的检测第54页
  3 结果第54-67页
   ·DEV UL18基因的PCR扩增结果第54页
   ·DEV UL18基因的T-克隆鉴定结果第54页
   ·原核表达质粒pET32a-UL18的构建及鉴定结果第54-55页
   ·重组质粒pET32a-UL18的诱导表达结果第55页
   ·重组质粒pET32a-UL18的诱导表达条件优化结果第55-56页
     ·表达宿主菌优化第55-56页
     ·温度条件优化第56页
     ·时间条件优化第56页
     ·IPTG浓度优化第56页
   ·重组蛋白pET32a/DEV-UL18的纯化结果第56-58页
     ·重组表达蛋白的可溶性分析第56页
     ·重组蛋白的大量纯化第56-58页
   ·兔抗重组蛋白pET32a/DEV-UL18抗体效价检测结果第58页
   ·兔抗重组蛋白pET32a/DEV-UL18抗体IgG的纯化结果第58页
   ·Western Blotting检测结果第58页
   ·基于DEV UL18重组蛋白间接ELISA法检测DEV抗体的应用第58-61页
     ·最佳抗原包被浓度和血清稀释度第58-60页
     ·最佳酶标二抗工作浓度第60页
     ·ELISA阴阳性临界值的判定标准第60页
     ·特异性试验的检测结果第60页
     ·敏感性试验的检测结果第60-61页
     ·重复性试验的检测结果第61页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫组化的应用第61-62页
     ·间接免疫酶组化检测DEV感染鸭的组织切片优化结果第61-62页
     ·特异性试验结果第62页
     ·间接免疫酶组化法检测DEV感染鸭组织切片结果第62页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光检测DEV感染组织的应用第62-64页
     ·间接免疫荧光检测DEV感染鸭组织方法的优化第62-64页
     ·特异性试验第64页
     ·间接免疫荧光法检测DEV感染鸭组织的结果第64页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光检测DEV感染宿主细胞的应用第64-67页
     ·间接免疫荧光法检测DEV感染宿主细胞飞片条件优化结果第64-65页
     ·特异性试验第65-66页
     ·间接免疫荧光检测DEV感染宿主细胞飞片结果第66-67页
  4 讨论第67-74页
   ·DEV UL18基因的引物设计和克隆测序第67页
   ·DEV UL18基因的克隆测序和表达载体的选择第67-68页
   ·疱疹病毒UL18基因的表达第68-69页
   ·兔抗重组蛋白pET32a/DEV-UL18抗体IgG的制备和纯化第69页
   ·基于DEV UL18重组蛋白间接ELISA法检测DEV抗体方法的应用第69-71页
   ·基于兔抗DEV UL18重组蛋白抗体介导的免疫酶组化和免疫荧光法检测UL18蛋白的应用第71-73页
     ·免疫酶组化检测DEV UL18蛋白在组织分布方法的建立及应用第71-72页
     ·免疫荧光法检测DEV UL18蛋白在组织分布方法的建立及应用第72页
     ·间接免疫荧光与间接免疫酶组化检测DEV UL18蛋白在感染鸭体内分布比较第72-73页
   ·基于免抗DEV UL18重组蛋白IgG介导的免疫荧光法检测UL18蛋白细胞定位第73-74页
     ·关于蛋白在细胞内定位的检测方法第73页
     ·疱疹病毒DEV UL18蛋白的细胞定位与其功能的关系第73-74页
  5 小结第74页
  Abstract第74-75页
 第四章 鸭肠炎病毒UL18基因在感染宿主细胞中的转录及表达特征第75-87页
  摘要第75页
  1 材料第75-76页
   ·菌株、毒株和抗体第75页
   ·实验动物第75页
   ·主要试剂及其配制第75-76页
     ·细胞培养相关试剂第75-76页
     ·Western blotting检测相关试剂第76页
   ·主要仪器设备第76页
  2 方法第76-80页
   ·荧光定量RT-PCR检测DEV UL18基因在感染宿主细胞中的转录时相第76-79页
     ·荧光定量PCR引物的设计、合成及特异性检测第76页
     ·鸭胚成纤维细胞(DEF)的培养第76-77页
     ·DEV病毒的增值第77页
     ·总RNA的提取第77页
     ·DNA的去除第77页
     ·RNA完整性及纯度检测第77页
     ·反转录第77-78页
     ·目的片段的PCR扩增及回收第78页
     ·荧光定量PCR第78-79页
     ·荧光定量PCR标准曲线的制作第79页
     ·数据处理与分析第79页
   ·Western blotting检测DEV UL18在感染宿主细胞中的表达时相第79-80页
     ·鸭胚成纤维细胞的培养第79页
     ·DEV病毒的增殖及采样第79-80页
     ·SDS-PAGE电泳第80页
     ·Western blotting检测第80页
  3 结果第80-84页
   ·DEV UL18基因在感染宿主细胞中的转录时相结果第80-83页
     ·荧光定量PCR引物特异性检测第80页
     ·RNA完整性及纯度检测第80页
     ·荧光定量PCR标准曲线第80-82页
     ·DEV UL18基因在宿主细胞中的转录特征第82-83页
   ·DEV UL18基因在感染宿主细胞中的表达时相结果第83-84页
  4 讨论第84-85页
   ·实时荧光定量PCR检测DEV UL18基因在DEF细胞中转录时相方法的选择第84页
   ·DEV UL18基因的转录特征分析第84-85页
   ·DEV UL18基因的表达特征分析第85页
  5 小结第85页
  Abstract第85-87页
结论第87-88页
参考文献第88-98页
致谢第98-99页
作者简介第99页

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