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家蚕细胞中miRNA的检测、过表达及上调miRNA潜在靶基因的筛选

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
缩略语第8-9页
目录第9-14页
第一章 绪论第14-22页
 1 miRNA 概述第14-18页
   ·miRNA 的发现第14页
   ·miRNA 的合成及其作用机理第14-16页
     ·miRNA 的生物合成过程第14-16页
     ·miRNA 的作用机理第16页
   ·miRNA 的特征、功能和意义第16-18页
     ·miRNA 的特征第16-17页
     ·miRNA 的功能和意义第17-18页
 2 miRNA 的鉴定及表达的检测第18-19页
   ·miRNA 的鉴定方法第18页
     ·直接克隆法鉴定 miRNA第18页
     ·嵌合基因芯片法鉴定 miRNA第18页
     ·生物信息学方法识别 miRNA第18页
   ·miRNA 表达的检测第18-19页
 3 miRNA 的靶基因的寻找与鉴定第19-22页
   ·miRNA 靶基因的寻找方法第19-20页
     ·生物信息学方法第19-20页
     ·生物学实验方法第20页
   ·miRNA 靶基因的鉴定第20-22页
第二章 实验设计方案第22-25页
 1 实验的目的和意义第22页
 2 实验内容第22-24页
 3 实验流程图第24-25页
第三章 家蚕 BmN 细胞中 miRNA 的检测第25-31页
 1 实验材料与试剂第25页
   ·材料第25页
   ·试剂第25页
   ·试剂配制第25页
 2 miRNA 基因芯片检测第25-27页
   ·Trizol 法提取家蚕 BmN 细胞总 RNA第26页
   ·芯片实验基本过程第26-27页
     ·分离小 RNA第26页
     ·加 polyA 尾与核苷酸标记第26页
     ·杂交第26页
     ·检测及图像分析第26-27页
 3 结果第27-30页
 4 讨论第30-31页
第四章 家蚕 miRNA表达载体的构建第31-46页
 1 材料与试剂第31-33页
   ·材料第31页
   ·试剂第31页
   ·主要试剂的配制第31-33页
 2 方法第33-40页
   ·家蚕基因组 DNA 提取第33页
     ·家蚕基因组 DNA 的提取步骤第33页
     ·家蚕基因组 DNA 的检测第33页
   ·重组质粒 pIEx-1-EGFP 的构建第33-37页
     ·EGFP 基因的 PCR 扩增第33-34页
     ·EGFP 基因与 pIEx-1 载体的双酶切第34-35页
     ·连接反应第35页
     ·CaCl2 法制备 E.coliTG1 感受态细胞第35页
     ·连接产物的转化第35-36页
     ·重组质粒提取第36页
     ·重组质粒的 PCR 及双酶切鉴定第36-37页
     ·重组质粒的测序鉴定第37页
   ·重组质粒 pIEx-1-EGFP-pri-mir-1a/8/14/133 的构建第37-40页
     ·pri-mir-1a/8/14/133 基因的 PCR 扩增第37-38页
     ·pri-mir-1a/8/14/133 基因扩增产物和 pIEx-1-EGFP 载体的双酶切并纯化第38-39页
     ·连接反应第39页
     ·连接产物的转化第39页
     ·重组质粒的提取与鉴定第39-40页
     ·重组质粒的测序鉴定第40页
 3 结果第40-44页
   ·电泳和紫外分光光度法检测家蚕基因组 DNA第40-41页
   ·PCR 扩增 EGFP 基因第41页
   ·重组质粒 pIEx-1-EGFP 的鉴定第41-42页
   ·PCR 扩增 pri-mir-1a/8/14/133第42-43页
   ·重组质粒 pIEx-1-EGFP-pri-mir-1a/8/14/133 的鉴定第43-44页
 4 讨论第44-46页
第五章 家蚕 miRNA的过表达及检测第46-66页
 1 材料与试剂第46-48页
   ·试剂及仪器第46页
   ·试剂配方第46-48页
 2 方法第48-56页
   ·细胞培养与冻存、复苏第48-49页
     ·家蚕 BmN 细胞贴壁培养第48-49页
     ·细胞冻存第49页
     ·细胞复苏第49页
   ·家蚕 BmN 细胞中重组质粒的脂质粒介导法转染第49-50页
   ·家蚕 BmN 细胞中化学合成的 miRNA mimics 转染第50页
   ·家蚕 BmN 细胞小 RNA 的提取第50-51页
   ·Stem-loop RT-PCR 法检测细胞中 miRNA 的表达水平第51-54页
     ·逆转录反应第52-53页
     ·荧光定量 PCR 反应第53页
     ·荧光定量 PCR 结果分析第53-54页
   ·Northern blot 法检测细胞中 miRNA 的表达水平第54-56页
     ·探针及凝胶的制备第54-55页
       ·地高辛标记的探针的制备第54页
       ·凝胶的制备第54-55页
     ·样品制备第55页
     ·上样第55页
     ·转膜第55页
     ·紫外交联第55页
     ·预杂交第55-56页
     ·杂交第56页
     ·洗膜第56页
     ·DIG Luminescent Detection Kit 检测第56页
 3. 结果第56-64页
   ·重组质粒转染家蚕 BmN 细胞的效率第56-57页
   ·miRNA mimics 转染家蚕 BmN 细胞的效率第57-58页
   ·Stem-loop RT-PCR 检测 miRNA 的过表达水平第58-63页
     ·重组质粒转染家蚕细胞后 miRNA 的过表达情况第58-61页
       ·qRT-PCR 反应的扩增曲线和溶解曲线分析第59-60页
       ·bmo-miR-1a/8/14/133 过表达差异分析第60-61页
     ·miRNA mimics 转染家蚕细胞后 miRNA 的过表达情况第61-63页
       ·qRT-PCR 反应的扩增曲线和溶解曲线分析第61-62页
       ·bmo-miR-1a/8/14 上调差异分析第62-63页
   ·miRNA 的 Northern blot 检测第63-64页
 4 讨论第64-66页
第六章 bmo-miR-14 对 BmN 细胞中基因的 mRNA 及蛋白表达水平的影响第66-83页
 1 材料与试剂第66-69页
   ·仪器及试剂第66页
   ·试剂配制第66-69页
     ·双向电泳试剂配制第66-68页
     ·考马斯亮兰染色试剂配制第68页
     ·质谱鉴定用试剂第68-69页
 2 方法第69-76页
   ·表达谱芯片检测 bmo-miR-14 上调对家蚕 BmN 细胞中基因 mRNA 水平的影响第69-71页
     ·实验样品的准备第69页
     ·芯片实验基本过程第69-70页
       ·家蚕 BmN 细胞总 RNA 的提取第69-70页
       ·对样品 RNA 进行荧光标记第70页
       ·杂交与清洗第70页
     ·芯片扫描与图像的采集、数据分析第70-71页
   ·双向电泳及质谱分析 bmo-miR-14 对家蚕 BmN 细胞中基因蛋白水平的影响第71-75页
     ·样品制备第71-72页
       ·miRNA mimics 转染的家蚕 BmN 细胞总蛋白提取第71-72页
       ·Bradford 法蛋白定量第72页
     ·双向电泳第72-74页
       ·双向电泳第一向:等电聚焦电泳第72-73页
       ·平衡胶条第73页
       ·SDS-PAGE 电泳第73-74页
     ·双向电泳凝胶考马斯亮兰染色第74页
     ·凝胶扫描及蛋白差异分析第74页
     ·质谱鉴定第74-75页
       ·胶内酶解第74-75页
       ·点靶第75页
       ·MALDI-TOF/TOF 质谱鉴定和数据库搜索第75页
       ·搜索结果的判定标准第75页
   ·bmo-miR-14 潜在靶基因靶位点的预测第75-76页
 3 结果第76-81页
   ·RNA 的纯度及浓度检测第76页
   ·转染 bmo-miR-14 mimics 的家蚕 BmN 细胞的表达谱芯片分析第76-77页
   ·Bradford 法蛋白定量第77-78页
   ·双向电泳图谱分析第78页
   ·差异蛋白的质谱鉴定第78-79页
   ·bmo-miR-14 潜在靶基因靶位点的预测第79-81页
 4 讨论第81-83页
第七章 bmo-miR-133对 B mN 细胞中基因的 mRNA及蛋白表达水平的影响第83-90页
 1 材料与试剂第83页
 2 方法第83-84页
   ·表达谱芯片检测 bmo-miR-133 对家蚕 BmN 细胞中基因 mRNA 水平的影响第83页
     ·实验样品的准备第83页
     ·芯片实验基本过程、扫描与图像的采集、数据分析第83页
   ·双向电泳及质谱分析 bmo-miR-133 对家蚕 BmN 细胞中基因蛋白水平的影响第83-84页
     ·样品制备第83-84页
       ·转染重组质粒至家蚕 BmN 细胞及细胞总蛋白提取第83-84页
       ·Bradford 法蛋白定量第84页
     ·双向电泳第84页
     ·双向电泳凝胶考马斯亮兰染色第84页
     ·凝胶扫描及蛋白差异分析第84页
     ·质谱鉴定第84页
   ·bmo-miR-133 靶位点的分析第84页
 3 结果第84-89页
   ·RNA 的浓度及纯度检测第84-85页
   ·过表达 bmo-miR-133 的家蚕 BmN 细胞的表达谱芯片分析第85-86页
   ·Bradford 法蛋白定量第86-87页
   ·双向电泳图谱分析第87页
   ·差异蛋白的质谱鉴定第87-88页
   ·bmo-miR-133 潜在靶基因靶位点的预测第88-89页
 4 结论第89-90页
结论第90-91页
参考文献第91-95页
致谢第95页

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