| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-14页 |
| ·课题背景 | 第10-11页 |
| ·研究内容 | 第11-12页 |
| ·研究意义 | 第12-13页 |
| ·本文组织结构 | 第13-14页 |
| 第二章 蛋白质loop结构预测与运动学 | 第14-24页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第14页 |
| ·蛋白质loop区域预测 | 第14-16页 |
| ·蛋白质loop的柔性 | 第16页 |
| ·运动学 | 第16-23页 |
| ·应用运动学于蛋白质loop结构预测 | 第17-18页 |
| ·循环坐标下降法 | 第18-21页 |
| ·雅可比矩阵方法 | 第21-23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 基于运动学的蛋白质loop结构预测方法设计 | 第24-33页 |
| ·循环坐标下降法与雅可比矩阵法的比较与分析 | 第24-26页 |
| ·测试集 | 第24页 |
| ·实验设计与结果 | 第24-26页 |
| ·循环坐标下降法的一般化扩展 | 第26-29页 |
| ·两阶段CCD――TSCCD：封闭肽段的拓扑控制 | 第29-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第四章 基于运动学的蛋白质loop结构预测实践 | 第33-49页 |
| ·旋转：封闭肽段的机械转动 | 第33-37页 |
| ·设计与方法 | 第33-34页 |
| ·结果 | 第34-37页 |
| ·随机游走：封闭肽链的“连续”运动 | 第37-47页 |
| ·设计与方法 | 第37-39页 |
| ·loop摆动的模拟 | 第39-41页 |
| ·apo态和holo态的转变预测 | 第41-47页 |
| ·本章小结 | 第47-49页 |
| 第五章 总结与展望 | 第49-51页 |
| ·工作总结 | 第49页 |
| ·研究展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-56页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |