基于组合核函数的蛋白质交互关系抽取
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 1 绪论 | 第8-14页 |
| ·研究背景 | 第8页 |
| ·研究意义 | 第8-9页 |
| ·研究现状 | 第9-10页 |
| ·本文工作 | 第10-12页 |
| ·本文结构 | 第12-14页 |
| 2 蛋白质交互关系抽取的相关理论 | 第14-26页 |
| ·关系抽取 | 第14-16页 |
| ·信息抽取 | 第14页 |
| ·关系抽取 | 第14-15页 |
| ·命名实体识别 | 第15页 |
| ·蛋白质交互关系抽取 | 第15-16页 |
| ·机器学习 | 第16-17页 |
| ·支持向量机 | 第17-19页 |
| ·支持向量机的基本原理 | 第17页 |
| ·广义分类面与支持向量机 | 第17-18页 |
| ·核函数 | 第18-19页 |
| ·语料及测评指标 | 第19-20页 |
| ·工具包 | 第20-26页 |
| ·SVM~(light)TK 1.2 | 第20-21页 |
| ·Stanford Parser | 第21-23页 |
| ·MeSH | 第23-24页 |
| ·WordNet | 第24-26页 |
| 3 基于树核的蛋白质交互关系抽取 | 第26-40页 |
| ·预处理 | 第26-27页 |
| ·特征向量的抽取 | 第27-29页 |
| ·词特征 | 第27-29页 |
| ·距离特征 | 第29页 |
| ·语法链接特征 | 第29页 |
| ·卷积树核 | 第29-30页 |
| ·卷积树核中句法树的剪裁及动态扩展 | 第30-35页 |
| ·卷积树核中句法树的剪裁 | 第30-34页 |
| ·卷积树核中句法树的动态扩展 | 第34-35页 |
| ·特征核与树核组合 | 第35-36页 |
| ·实验及结果 | 第36-40页 |
| ·基于特征向量的PPI抽取 | 第36-37页 |
| ·四种基本句法树的有效性验证实验 | 第37页 |
| ·三种SPT拓展树的有效性验证实验 | 第37-38页 |
| ·特征核与树核组合的有效性验证实验 | 第38-40页 |
| 4 基于语义核函数的蛋白质关系抽取 | 第40-48页 |
| ·蛋白质对语义相似度 | 第41-44页 |
| ·蛋白质名称匹配 | 第42-43页 |
| ·蛋白质对语义相似度的计算方法 | 第43-44页 |
| ·上下文语义相似度 | 第44-46页 |
| ·预处理 | 第45页 |
| ·上下文语义相似度的计算方法 | 第45-46页 |
| ·语义核函数 | 第46页 |
| ·实验及结果分析 | 第46-48页 |
| 5 基于多核组合的蛋白质关系抽取 | 第48-51页 |
| ·多核的结合方式 | 第48页 |
| ·实验与结果分析 | 第48-51页 |
| ·组合核有效性验证实验 | 第48-49页 |
| ·与其他先进方法比较 | 第49-51页 |
| 结论 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
