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用于蛋白质二维HP结构分析的一种遗传算法

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
1 绪论第8-16页
   ·分子生物信息学技术第8-11页
     ·分子生物信息学技术的简单介绍第8页
     ·生物信息学的重要性第8-9页
     ·分子生物信息学技术的研究内容第9-11页
   ·蛋白质折叠第11-13页
     ·蛋白质的结构及其预测方法第11-12页
     ·蛋白质结构预测的两个难题第12-13页
   ·研究蛋白质折叠的相关简化数学模型第13-14页
     ·AB非格点模型第13-14页
     ·二维HP格点模型第14页
   ·本文的主要工作第14-16页
2 Monte Carlo方法在蛋白质二维HP模型中的应用第16-26页
   ·基本Monte Carlo方法概述第16-19页
   ·HP模型(Hydrophobic-Polar)第19-22页
     ·二维HP格点模型及其能量表示第19-21页
     ·求解HP模型是NP问题第21-22页
   ·Monte Carlo在求解蛋白质HP结构中的应用第22-26页
     ·蛋白质折叠方向的表示方法第22-23页
     ·蛋白质HP模型及其能量的算法描述第23-24页
     ·基于Monte Carlo方法的蛋白质HP模型的预测第24-26页
3 遗传算法在蛋白质二维HP模型中的应用第26-34页
   ·基本的GA概述第26-27页
   ·GA在求解蛋白质HP结构中的应用第27-34页
     ·GA求解蛋白质HP模型是一个NP问题第27-28页
     ·GA用于蛋白质HP模型的算法设计第28-34页
4 改进的算法及数值实验第34-39页
   ·平行线-垂直线变异(Parallel-Vertical Variation)第34-35页
   ·数值试验及其结果第35-39页
结论第39-40页
参考文献第40-42页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第42-43页
致谢第43-44页

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