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大肠杆菌5-氨基乙酰丙酸合成途径的改造及其对菌体代谢影响的初步研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略词表第10-11页
第一章 绪论第11-16页
 1. 5-氨基乙酰丙酸(5-aminolevulinic acid,ALA)第11-16页
   ·ALA简介第11-12页
     ·ALA的合成第11-12页
     ·ALA C5合成途径的调控第12页
   ·血红素第12-14页
     ·血红素的生物功能第12-13页
     ·血红素的生物合成途径与代谢第13-14页
   ·大肠杆菌氨基酸转运体系第14-15页
     ·大肠杆菌氨基酸的转运第14页
     ·知的大肠杆菌ALA转运系统第14-15页
   ·HemB的抑制因子YicL第15页
   ·SsrA(tmRNA)蛋白降解标签第15页
   ·转录组学分析技术第15-16页
第二章 ALA产量提高的多点尝试第16-40页
 1. 引言第16-17页
 2. 实验材料第17-21页
   ·菌株与质粒第17-18页
   ·引物第18-19页
   ·生化试剂及试剂盒第19-20页
   ·仪器与设备第20页
   ·培养基及组成第20-21页
 3. 实验方法第21-30页
   ·构建表达rhtA和yeaS的质粒第21-25页
     ·引物设计第21页
     ·大肠杆菌基因组的提取第21页
     ·扩增rhtA和yeaS基因第21-22页
     ·PCR产物的纯化第22页
     ·pCL1920载体质粒的提取第22页
     ·限制酶切目的基因和质粒载体第22-23页
     ·体外连接目的基因和质粒载体第23页
     ·大肠杆菌化学感受态的制备第23页
     ·大肠杆菌的化学转化第23-24页
     ·重组子的筛选与鉴定第24-25页
   ·mppA及dppA基因的敲除第25-26页
     ·敲除引物的设计与基因敲除片段的扩增第25页
     ·大肠杆菌基因敲除感受态的制备第25页
     ·大肠杆菌电转化基因敲除第25页
     ·阳性克隆的筛选第25-26页
     ·pDK46质粒与筛选抗性基因的消除第26页
   ·构建过表达yicL的质粒菌株与质粒第26-27页
   ·构建表达hmuO_(c.g)的大肠杆菌菌株第27页
   ·HemB蛋白弱化菌株的构建第27-29页
     ·构建HemB蛋白弱化的菌株第27-28页
     ·敲除sspB基因第28-29页
   ·菌株的构建与保存第29页
   ·ALA发酵的控制与产物的检测第29-30页
     ·发酵培养控制流程第29页
     ·发酵产物的检测第29-30页
 4. 实验结果第30-38页
   ·敲除ALA吸收系统不能促进ALA的积累第30-31页
   ·RhtA可以分泌ALA,促进ALA生产菌株积累ALA第31-32页
   ·YeaS不能分泌ALA第32-33页
   ·YeaS和RhtA的二级结构第33-35页
   ·表达HemB抑制因子不能促进ALA的积累第35页
   ·表达谷氨酸棒杆菌的血红素氧化酶编码基因不能促进ALA的积累第35-36页
   ·大肠杆菌HemB蛋白的弱化引起ALA产量的降低第36-37页
   ·sspB基因的敲除可以部分回补HemB蛋白弱化引起的ALA产量的降低第37-38页
   ·低拷贝表达hemB基因不能促进ALA的积累第38页
 5. 讨论与总结第38-40页
第三章 C5途径加强对大肠杆菌及谷氨酸棒杆菌部分主要代谢产物的影响第40-53页
 1. 引言第40页
 2. 实验材料第40-42页
   ·引物第41页
   ·培养基第41-42页
 3. 实验方法第42-46页
   ·相关代谢产物的分析方法第42-44页
     ·乙酸,丙酮酸等有机酸的分析第42页
     ·谷氨酸的分析第42页
     ·血红素的测定方法第42-44页
   ·构建表达粘质沙雷氏菌血红素外膜受体蛋白的质粒第44-45页
   ·谷氨酸棒杆菌感受态制备以及转化第45-46页
   ·谷氨酸棒杆菌发酵ALA的实验操作第46页
 4. 结果第46-52页
   ·在大肠杆菌中过表达hemA,hemL基因引起乙酸积累,生长及耗糖的变化第46-47页
   ·大肠杆菌中过表达hemA,hemL基因引血红素含量的增多第47-48页
   ·在大肠杆菌中过表达hemA,hemL基因引呼吸速率的加快第48页
   ·在谷氨酸棒杆菌中过表达hemA,hemL引起谷氨酸的积累第48-50页
   ·在谷氨酸棒杆菌表达hemA,hemL引起卟啉类物质的积累第50页
   ·外源添加氯高铁血红素引起大肠杆菌乙酸积累的变化第50-51页
   ·外源添加ALA与氯高铁血红素不能促进谷氨酸的积累第51-52页
 5. 总结与讨论第52-53页
第四章 HemB蛋白弱化对菌体全局转录水平的影响第53-79页
 1. 引言第53-55页
 2 实验材料第55-56页
 3 实验方法第56-62页
   ·提取大肠杆菌总RNA用于转录组测序分析第56-57页
   ·华大基因转录组分析的流程第57-61页
   ·大肠杆菌总tRNA的提取方法第61-62页
 4 实验结果第62-77页
   ·DAL及DsAL合成ALA能力的体外测定第62-64页
   ·转录组学分析结果第64-69页
   ·大肠杆菌HemB弱化前后生长状态,耗糖及产乙酸的差别第69-71页
   ·大肠杆菌产谷氨酸能力的差别第71-72页
   ·大肠杆菌血红素含量的差别第72页
   ·HemB弱化对外源C4途径生产ALA能力的影响第72-73页
   ·添加氯高铁血红素对ALA积累的影响第73-74页
   ·添加氯高铁血红素对菌体生长及葡萄糖消耗的影响第74-75页
   ·添加氯高铁血红素对菌体乙酸积累的影响第75-76页
   ·DH5α,DBs,DAL及DsAL呼吸速率的测定第76-77页
 5 讨论与总结第77-79页
全文总结第79-80页
参考文献第80-84页
致谢第84-85页
攻读学位期间发表的论文第85-86页
学位论文评阅及答辩情况表第86页

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