| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-13页 |
| 前言 | 第13-15页 |
| 第一篇 文献综述 | 第15-85页 |
| 第一章 传染性支气管炎病毒分子生物学研究进展 | 第15-49页 |
| 1 毒粒结构 | 第15-16页 |
| 2 基因组结构 | 第16-18页 |
| 3 病毒的复制 | 第18-21页 |
| 4 病毒RNA转录 | 第21-25页 |
| 4．1 基因组RNA的转录合成 | 第21-23页 |
| 4．2 负链RNA的合成 | 第23页 |
| 4．3 亚基因组RNA的合成 | 第23-24页 |
| 4．4 RNA合成的酶学基础 | 第24-25页 |
| 5 病毒基因组编码的蛋白质 | 第25-31页 |
| 5．1 结构蛋白 | 第25-29页 |
| 5．2 非结构蛋白 | 第29-31页 |
| 6 S1基因及S1蛋白的研究进展 | 第31-33页 |
| 6．1 S1基因变异区与保守区 | 第31-32页 |
| 6．2 利用单抗技术对病毒进行血清分型及抗原位点分析 | 第32页 |
| 6．3 利用RT-PCR技术对S1基因的研究 | 第32-33页 |
| 7 IBV分型研究进展 | 第33-37页 |
| 7．1 免疫型（或保护型） | 第34页 |
| 7．2 抗原分型 | 第34-37页 |
| 参考文献 | 第37-49页 |
| 第二章 传染性腺胃炎病原学研究进展 | 第49-56页 |
| 1 禽呼肠孤病毒 | 第50-51页 |
| 2 禽网状内皮增生症病毒 | 第51-52页 |
| 3 冠状病毒 | 第52页 |
| 4 其它病原 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-56页 |
| 第三章 传染性支气管炎病毒分子流行病学研究进展 | 第56-85页 |
| 1 定义及应用范围 | 第56-57页 |
| 1．1 分子流行病学定义的形成 | 第56-57页 |
| 1．2 分子流行病学的应用范围 | 第57页 |
| 2 生物学标志（BIOMARKER） | 第57-61页 |
| 2．1 生物学标志的分类及意义 | 第58-59页 |
| 2．2 生物材料的选择 | 第59页 |
| 2．3 设计方法 | 第59-61页 |
| 3 分子流行病学的检测技术 | 第61-68页 |
| 3．1 质粒图谱分析（Plasmid profile） | 第62-63页 |
| 3．2 限制性内切酶图谱分析（restriction endonuclease pattern） | 第63-64页 |
| 3．3 核酸杂交（或基因探针）技术 | 第64-65页 |
| 3．4 聚丙烯酰胺凝肢电泳分析（PAGE） | 第65页 |
| 3．5 聚合酶链反应技术（PCR） | 第65-66页 |
| 3．6 寡核苷酸图谱分析 | 第66-67页 |
| 3．7 RNA病毒节段电泳分析 | 第67页 |
| 3．8 杂交瘤技术 | 第67-68页 |
| 4 分子流行病学的应用 | 第68-71页 |
| 4．1 对病原微生物的检测 | 第69页 |
| 4．2 对病原微生物的分子遗传学分型和分类 | 第69-70页 |
| 4．3 对传染源和传播途径的分析 | 第70页 |
| 4．4 对传染病进行监测 | 第70-71页 |
| 5 分子流行病学的现代应用 | 第71-74页 |
| 5．1 传染病研究 | 第71页 |
| 5．2 非传染病研究 | 第71-73页 |
| 5．3 健康及医学事件研究 | 第73-74页 |
| 6 动物分子流行病学的研究及其应用概况 | 第74-81页 |
| 6．1 病原体的起源和进化研究 | 第74-76页 |
| 6．2 病原体的分型研究 | 第76-77页 |
| 6．3 鉴别强毒与弱毒株，疫苗免疫动物和自然感染动物 | 第77页 |
| 6．4 阐明疫病的分布和流行规律 | 第77-79页 |
| 6．5 用于耐药性的研究 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-85页 |
| 第二篇 研究报告 | 第85-132页 |
| 第四章 传染性支气管炎病毒致腺胃病变毒株生物学特性的研究 | 第85-101页 |
| 1 材料和方法 | 第86-89页 |
| 1．1 鸡胚和雏鸡 | 第86页 |
| 1．2 毒株 | 第86页 |
| 1．3 病毒分离 | 第86-87页 |
| 1．4 免疫保护试验 | 第87页 |
| 1．5 病毒理化特性测定 | 第87-88页 |
| 1．6 病毒的生长、滴定和形态学观察 | 第88页 |
| 1．7 致病试验 | 第88页 |
| 1．8 抗血清制备 | 第88-89页 |
| 1．9 ELISA | 第89页 |
| 1．10 鸡胚VN试验 | 第89页 |
| 2 结果 | 第89-98页 |
| 2．1 病毒分离和鸡胚接种 | 第89-90页 |
| 2．2 免疫保护试验 | 第90-91页 |
| 2．3 病毒毒力测定 | 第91页 |
| 2．4 理化特性的测定 | 第91-93页 |
| 2．5 中和试验 | 第93-94页 |
| 2．6 鸡胚中病毒的生长状况 | 第94-95页 |
| 2．7 病毒回归试验 | 第95-97页 |
| 2．8 ELISA | 第97-98页 |
| 3 讨论 | 第98-99页 |
| 本章小结 | 第99页 |
| 参考文献 | 第99-101页 |
| 第五章 致腺胃病变传染性支气管炎病毒株S1基因变异的分子流行病学证据 | 第101-114页 |
| 1 材料和方法 | 第101-103页 |
| 1．1 鸡胚 | 第101-102页 |
| 1．2 病毒来源 | 第102页 |
| 1．3 病毒RNA提纯和反转录-聚合酶链反应（RT-PCR） | 第102-103页 |
| 1．4 S1基因的克隆和测序 | 第103页 |
| 1．5 序列分析 | 第103页 |
| 2 结果 | 第103-105页 |
| 2．1 RT-PCR | 第103-104页 |
| 2．2 序列测定与分析 | 第104-105页 |
| 3 讨论 | 第105-109页 |
| 本章小结 | 第109-110页 |
| 参考文献 | 第110-114页 |
| 第六章 传染性支气管炎病毒中国和东南亚分离株分子流行病学研究 | 第114-132页 |
| 1 材料和方法 | 第115-117页 |
| 1．1 鸡胚 | 第115页 |
| 1．2 病毒来源 | 第115-116页 |
| 1．3 病毒分离 | 第116页 |
| 1．4 病毒增殖、RNA提取、反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）和序列测定 | 第116页 |
| 1．5 序列分析 | 第116-117页 |
| 2 结果 | 第117-125页 |
| 2．1 序列分析 | 第117页 |
| 2．2 分离毒株的系统发生位置 | 第117-118页 |
| 2．3 毒株间重组的序列证据 | 第118-125页 |
| 3 讨论 | 第125-127页 |
| 本章小结 | 第127-128页 |
| 参考文献 | 第128-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
| 发表的与本论文有关的文章 | 第133-134页 |
