| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 缩略语表 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-34页 |
| 1 鱼类群体遗传学 | 第15-24页 |
| ·遗传学与渔业资源的管理 | 第15-16页 |
| ·鱼类群体遗传学 | 第16-18页 |
| ·种群遗传分析中基本假设的检验 | 第18-24页 |
| ·哈迪-温伯格平衡 | 第18-19页 |
| ·连锁不平衡 | 第19-20页 |
| ·群体变异 | 第20-21页 |
| ·基因流的估算 | 第21页 |
| ·距离隔离 | 第21-22页 |
| ·遗传距离 | 第22-23页 |
| ·无效等位基因 | 第23-24页 |
| 2 微卫星标记及其开发和应用 | 第24-29页 |
| ·分子标记的种类 | 第25-26页 |
| ·微卫星标记的特点 | 第26-27页 |
| ·微卫星标记的开发 | 第27-29页 |
| ·微卫星标记在鱼类群体遗传学上的应用 | 第29页 |
| 3 AFLP标记及其在鱼类遗传连锁图谱构建中的应用 | 第29-32页 |
| ·AFLP标记的原理 | 第31-32页 |
| ·AFLP标记技术在鱼类遗传育种中的应用 | 第32页 |
| 4 黄颡鱼微卫星开发及其遗传背景的研究概况 | 第32-33页 |
| 5 本研究的内容及意义 | 第33-34页 |
| 第二章 FIASCO法开发黄颡鱼微卫星标记 | 第34-48页 |
| 1 前言 | 第34-35页 |
| 2 材料与方法 | 第35-40页 |
| ·黄颡鱼样本的采集 | 第35页 |
| ·DNA的提取 | 第35页 |
| ·基因组DNA的酶切、连接及特定大小DNA片段的获得 | 第35-36页 |
| ·生物素探针杂交 | 第36-37页 |
| ·磁珠富集微卫星DNA | 第37页 |
| ·磁珠富集后单链DNA的扩增 | 第37-38页 |
| ·构建微卫星富集文库 | 第38页 |
| ·PCR法筛选阳性克隆 | 第38-39页 |
| ·DNA测序结果的分析和微卫星引物的设计优化 | 第39页 |
| ·微卫星引物多态性的检测及主要遗传学参数的计算 | 第39-40页 |
| 3 结果 | 第40-43页 |
| ·DNA提取结果 | 第40页 |
| ·基因组DNA的酶切结果 | 第40-41页 |
| ·微卫星片段的富集 | 第41页 |
| ·PCR法筛选阳性克隆 | 第41-42页 |
| ·DNA测序结果的分析和微卫星引物的设计优化 | 第42-43页 |
| ·微卫星位点的多态性及主要遗传学参数 | 第43页 |
| 4 讨论 | 第43-48页 |
| 第三章 数据库搜索法筛选黄颡鱼微卫星标记 | 第48-54页 |
| 1 前言 | 第48页 |
| 2 材料与方法 | 第48-49页 |
| ·黄颡鱼样本的采集 | 第48页 |
| ·DNA的提取 | 第48-49页 |
| ·GenBank数据库中黄颡鱼核苷酸序列的搜索和微卫星序列的查找 | 第49页 |
| ·微卫星引物的设计及多态性检测 | 第49页 |
| 3 结果 | 第49-52页 |
| ·黄颡鱼微卫星序列搜索结果 | 第49页 |
| ·微卫星引物设计及优化 | 第49-52页 |
| ·微卫星位点的多态性检测 | 第52页 |
| 4 讨论 | 第52-54页 |
| 第四章 黄颡鱼野生群体遗传多样性和遗传结构的微卫星分析 | 第54-74页 |
| 1 前言 | 第54-55页 |
| 2 材料与方法 | 第55-58页 |
| ·样本的采集 | 第55-56页 |
| ·DNA的提取、PCR反应及PCR产物的检验分析 | 第56-58页 |
| ·数据的统计及分析 | 第58页 |
| 3 结果 | 第58-68页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡和连锁不平衡检验 | 第58-59页 |
| ·等位基因的变异 | 第59-62页 |
| ·群体间遗传距离和聚类分析 | 第62-64页 |
| ·群体遗传结构的STRUCTURE估测 | 第64-65页 |
| ·群体变异的AMOVA分析 | 第65-66页 |
| ·群体遗传距离与地理距离的Mantel检测 | 第66-68页 |
| 4 讨论 | 第68-74页 |
| ·哈温平衡 | 第68-69页 |
| ·黄颡鱼种群的遗传多样性 | 第69-70页 |
| ·西江黄颡鱼群体杂合体缺失现象的原因分析 | 第70-71页 |
| ·黄颡鱼种群间的遗传变异和地理分化 | 第71-74页 |
| 第五章 黄颡鱼遗传连锁图的构建 | 第74-103页 |
| 1 前言 | 第74-75页 |
| 2 材料与方法 | 第75-85页 |
| ·作图策略的选择和作图家系的构建 | 第75页 |
| ·作图群体的选择 | 第75-76页 |
| ·实验鱼基因组DNA的提取 | 第76页 |
| ·AFLP分析 | 第76-81页 |
| ·酶切 | 第77-78页 |
| ·连接反应 | 第78页 |
| ·预扩增 | 第78-79页 |
| ·选择性扩增 | 第79页 |
| ·AFLP产物的检测 | 第79-80页 |
| ·AFLP标记的鉴定及命名 | 第80-81页 |
| ·AFLP标记的赋值 | 第81页 |
| ·微卫星标记的分析 | 第81-84页 |
| ·微卫星标记的筛选 | 第81-82页 |
| ·微卫星标记分离方式的鉴定及命名 | 第82-84页 |
| ·微卫星标记的赋值 | 第84页 |
| ·构建连锁图谱 | 第84页 |
| ·基因组长度预测和图谱覆盖率 | 第84-85页 |
| 3 结果 | 第85-97页 |
| ·作图家系的建立及作图群体的选择 | 第85页 |
| ·AFLP分析结果 | 第85-89页 |
| ·酶切及预扩增结果 | 第85-86页 |
| ·AFLP引物组合的扩增效果 | 第86-89页 |
| ·微卫星分析结果 | 第89-93页 |
| ·遗传连锁图谱 | 第93-97页 |
| ·雄性遗传连锁图 | 第93-94页 |
| ·雌性遗传连锁图 | 第94-96页 |
| ·基因组长度和覆盖率 | 第96-97页 |
| 4 讨论 | 第97-103页 |
| ·拟测交策略 | 第97页 |
| ·作图标记的选择 | 第97-98页 |
| ·AFLP引物组合扩增效果 | 第98-99页 |
| ·作图标记的偏分离 | 第99-100页 |
| ·两性图谱的差异及图谱的长度和覆盖率 | 第100-101页 |
| ·与性别决定相关的分子标记 | 第101-103页 |
| 本论文主要研究结果及展望 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-121页 |
| 致谢 | 第121-123页 |
| 附录 | 第123页 |
