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产前乙肝病毒感染对胎儿脐带血全基因组DNA甲基化影响及重要功能基因的验证

摘要第4-7页
Abstract第7-9页
缩略语第10-17页
前言第17-20页
技术路线图第20-21页
第一部分 产前乙肝病毒感染对胎儿全基因组DNA甲基化的影响第21-47页
    1.1 前言第21-22页
    1.2 研究方法第22-31页
        1.2.1 研究对象的选择第22页
        1.2.2 候选基因的选择第22-23页
        1.2.3 全基因组甲基化检测第23-28页
            1.2.3.1 主要仪器与试剂第23-24页
            1.2.3.2 实验方法第24-28页
        1.2.4 数据整理与统计分析第28-31页
            1.2.4.1 甲基化芯片检测数据的分析第28-31页
            1.2.4.2 数据统计分析第31页
    1.3 研究结果第31-43页
        1.3.1 研究对象基本资料第31-32页
        1.3.2 甲基化芯片数据预处理第32-37页
            1.3.2.1 芯片数据质量控制及数据过滤第32-34页
            1.3.2.2 数据归一化、板间效应矫正第34-36页
            1.3.2.3 不同种类白细胞比例异质性矫正第36-37页
        1.3.3 区域水平甲基化差异分析第37-40页
        1.3.4 差异甲基化位点分析第40-41页
        1.3.5 候选基因的芯片检测结果第41-42页
        1.3.6 GO分析第42-43页
    1.4 讨论第43-46页
        1.4.1 产前HBV感染对胎儿基因组甲基化的影响第43-45页
        1.4.2 研究中所涉及的一些方法第45-46页
    1.5 小结第46-47页
第二部分 产前乙肝病毒感染对胎儿KLHL35及CPT1B基因甲基化及表达的影响第47-75页
    2.1 前言第47-48页
    2.2 研究方法第48-61页
        2.2.1 研究对象的选择第48页
        2.2.2 验证位点的选择第48-51页
        2.2.3 焦磷酸测序第51-54页
            2.2.3.1 主要仪器与试剂第51-52页
            2.2.3.2 实验方法第52-54页
        2.2.4 RT-qPCR(双标准曲线法)第54-60页
            2.2.4.1 主要仪器与试剂第54-55页
            2.2.4.2 实验方法第55-60页
        2.2.5 数据整理与统计分析第60-61页
    2.3 研究结果第61-71页
        2.3.1 研究对象基本资料第61-62页
        2.3.2 验证位点的焦磷酸测序结果第62-68页
            2.3.2.1 甲基化芯片和焦磷酸测序结果的一致性分析第62-63页
            2.3.2.2 验证样本的焦磷酸测序结果第63-68页
        2.3.3 KLHL35及CPT1B的mRNA相对表达量第68-70页
        2.3.4 位点甲基化与基因mRNA相对表达量的相关性第70-71页
    2.4 讨论第71-73页
        2.4.1 产前HBV感染对胎儿KLHL35及CPT1B的甲基化和表达的影响第71-73页
        2.4.2 研究中所涉及的一些方法第73页
    2.5 小结第73-75页
总结及展望第75-77页
创新与不足第77-78页
附录第78-80页
参考文献第80-90页
在学期间的研究成果第90-92页
致谢第92-93页

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