摘要 | 第4-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
缩略语 | 第10-17页 |
前言 | 第17-20页 |
技术路线图 | 第20-21页 |
第一部分 产前乙肝病毒感染对胎儿全基因组DNA甲基化的影响 | 第21-47页 |
1.1 前言 | 第21-22页 |
1.2 研究方法 | 第22-31页 |
1.2.1 研究对象的选择 | 第22页 |
1.2.2 候选基因的选择 | 第22-23页 |
1.2.3 全基因组甲基化检测 | 第23-28页 |
1.2.3.1 主要仪器与试剂 | 第23-24页 |
1.2.3.2 实验方法 | 第24-28页 |
1.2.4 数据整理与统计分析 | 第28-31页 |
1.2.4.1 甲基化芯片检测数据的分析 | 第28-31页 |
1.2.4.2 数据统计分析 | 第31页 |
1.3 研究结果 | 第31-43页 |
1.3.1 研究对象基本资料 | 第31-32页 |
1.3.2 甲基化芯片数据预处理 | 第32-37页 |
1.3.2.1 芯片数据质量控制及数据过滤 | 第32-34页 |
1.3.2.2 数据归一化、板间效应矫正 | 第34-36页 |
1.3.2.3 不同种类白细胞比例异质性矫正 | 第36-37页 |
1.3.3 区域水平甲基化差异分析 | 第37-40页 |
1.3.4 差异甲基化位点分析 | 第40-41页 |
1.3.5 候选基因的芯片检测结果 | 第41-42页 |
1.3.6 GO分析 | 第42-43页 |
1.4 讨论 | 第43-46页 |
1.4.1 产前HBV感染对胎儿基因组甲基化的影响 | 第43-45页 |
1.4.2 研究中所涉及的一些方法 | 第45-46页 |
1.5 小结 | 第46-47页 |
第二部分 产前乙肝病毒感染对胎儿KLHL35及CPT1B基因甲基化及表达的影响 | 第47-75页 |
2.1 前言 | 第47-48页 |
2.2 研究方法 | 第48-61页 |
2.2.1 研究对象的选择 | 第48页 |
2.2.2 验证位点的选择 | 第48-51页 |
2.2.3 焦磷酸测序 | 第51-54页 |
2.2.3.1 主要仪器与试剂 | 第51-52页 |
2.2.3.2 实验方法 | 第52-54页 |
2.2.4 RT-qPCR(双标准曲线法) | 第54-60页 |
2.2.4.1 主要仪器与试剂 | 第54-55页 |
2.2.4.2 实验方法 | 第55-60页 |
2.2.5 数据整理与统计分析 | 第60-61页 |
2.3 研究结果 | 第61-71页 |
2.3.1 研究对象基本资料 | 第61-62页 |
2.3.2 验证位点的焦磷酸测序结果 | 第62-68页 |
2.3.2.1 甲基化芯片和焦磷酸测序结果的一致性分析 | 第62-63页 |
2.3.2.2 验证样本的焦磷酸测序结果 | 第63-68页 |
2.3.3 KLHL35及CPT1B的mRNA相对表达量 | 第68-70页 |
2.3.4 位点甲基化与基因mRNA相对表达量的相关性 | 第70-71页 |
2.4 讨论 | 第71-73页 |
2.4.1 产前HBV感染对胎儿KLHL35及CPT1B的甲基化和表达的影响 | 第71-73页 |
2.4.2 研究中所涉及的一些方法 | 第73页 |
2.5 小结 | 第73-75页 |
总结及展望 | 第75-77页 |
创新与不足 | 第77-78页 |
附录 | 第78-80页 |
参考文献 | 第80-90页 |
在学期间的研究成果 | 第90-92页 |
致谢 | 第92-93页 |