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硫化叶菌Cdc6-2蛋白在DNA损伤应答中的功能研究

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略语表(Abbribiations)第11-12页
1 前言第12-20页
    1.1 古菌概述第12-13页
    1.2 硫化叶菌第13-14页
    1.3 真核生物的ORC复合物第14-15页
    1.4 真核生物的Cdc6蛋白第15-17页
    1.5 古菌的ORC 1/Cdc6第17-19页
    1.6 研究的目的和意义第19-20页
2 材料与方法第20-36页
    2.1 菌株与质粒第20页
    2.2 培养基及培养条件第20-23页
        2.2.1 大肠杆菌的培养基及培养条件第20-21页
        2.2.2 硫化叶菌的培养基及培养条件第21-23页
    2.3 主要仪器及分子生物学试剂第23-24页
        2.3.1 主要化学药品第23-24页
        2.3.2 主要实验仪器第24页
    2.4 实验方法第24-36页
        2.4.1 冰岛硫化叶菌生长曲线的绘制第24-25页
            2.4.1.1 冰岛硫化叶菌的活化第24-25页
            2.4.1.2 生长曲线的绘制第25页
        2.4.2 E.coli JM109感受态细胞的制备及转化第25-26页
            2.4.2.1 E.coli JM109感受态细胞的制备第25-26页
            2.4.2.2 E.coli JM109的转化第26页
        2.4.3 冰岛硫化叶菌感受态制备及转化第26-27页
            2.4.3.1 冰岛硫化叶菌感受态细胞的制备第26-27页
            2.4.3.2 冰岛硫化叶菌的转化第27页
        2.4.4 质粒的提取和基因组DNA的制备第27-28页
        2.4.5 Cdc6-2蛋白回补质粒与超表达质粒的构建第28页
            2.4.5.1 回补质粒ds-Cdc6-2的构建第28页
            2.4.5.2 超表达质粒ds-50/2-Cdc6-2的构建第28页
        2.4.6 Bradford法测定蛋白浓度第28-29页
        2.4.7 SDS-PAGE电泳和Western-blot实验第29-31页
            2.4.7.1 细胞处理和SDS-PAGE电泳第29-30页
            2.4.7.2 蛋白质的转膜第30页
            2.4.7.3 Western-blot实验第30-31页
        2.4.8 冰岛硫化叶菌总RNA的提取以及RT-qPCR第31-32页
            2.4.8.1 冰岛硫化叶菌总RNA的提取第31页
            2.4.8.2 RT-qPCR第31-32页
        2.4.9 cdc6-2启动子报告基因质粒的构建及β-半乳糖苷酶活性测定第32-33页
            2.4.9.1 cdc6-2启动子报告基因质粒的构建第32页
            2.4.9.2 β-半乳糖苷酶活性测定第32-33页
        2.4.10 cdc6-2基因在大肠杆菌中表达、EMSA实验第33-34页
            2.4.10.1 cdc6-2基因在大肠杆菌中的表达第33-34页
            2.4.10.2 EMSA实验第34页
        2.4.11 DNase I足迹分析实验(DNase I footprinting assay)第34-35页
        2.4.12 D-188-pSeSD-LacS质粒定点突变第35-36页
3 结果与分析第36-66页
    3.1 古菌中部分菌株Cdc6蛋白的同源性分析第36-38页
    3.2 DNA损伤试剂对cdc6-2缺失株生长的影响第38-39页
    3.3 cdc6-2蛋白的回补与超表达第39-47页
        3.3.1 将cdc6-2基因回补至cdc6-2基因缺失菌株中第39-43页
        3.3.2 Cdc6-2蛋白的超表达第43-47页
    3.4 DNA损伤剂4-NQO处理对E233S中cdc6-2基因转录与表达的影响第47-52页
        3.4.1 4-NQO处理对E233S中cdc6-2基因转录的影响第47-50页
        3.4.2 4-NQO处理对E233S中cdc6-2基因表达量的影响第50-52页
    3.5 报告基因体系分析cdc6-2基因启动子第52-57页
        3.5.1 cdc6-2基因启动子报告基因质粒的构建第52-55页
        3.5.2 报告基因质粒在不同宿主菌中LacS酶活的检测第55-57页
    3.6 Cdc6-2蛋白结合自身启动子并调控自身基因的表达第57-66页
        3.6.1 Cdc6-2蛋白的大肠杆菌表达第57-59页
        3.6.2 Cdc6-2蛋白与cdc6-2启动子的EMSA实验第59-60页
        3.6.3 Cdc6-2蛋白与cdc6-2基因启动子的DNase I footprinting实验第60-64页
        3.6.4 含有cdc6-2突变启动子的报告基因质粒在不同宿主菌中LacS酶活检测第64-66页
4 讨论第66-68页
    4.1 冰岛硫化叶菌Cdc6-2的分类第66页
    4.2 冰岛硫化叶菌Cdc6-2的功能研究第66-68页
参考文献第68-74页
附录第74-76页
致谢第76页

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