| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第1章 文献综述 | 第14-28页 |
| 1.1 我国鲫鱼生物学分类、地理种群、养殖品种与养殖概况 | 第14-18页 |
| 1.1.1 我国鲫鱼生物学分类 | 第14页 |
| 1.1.2 我国鲫鱼地理种群 | 第14-15页 |
| 1.1.3 养殖品种与养殖概况 | 第15-17页 |
| 1.1.4 小结 | 第17-18页 |
| 1.2 鲫鱼病毒性病害种类及研究进展 | 第18-24页 |
| 1.2.1 鲫鱼病毒性病害种类 | 第18页 |
| 1.2.2 鲫鱼病毒性病害研究进展 | 第18-23页 |
| 1.2.3 小结 | 第23-24页 |
| 1.3 异育银鲫鳃出血病的发现 | 第24-26页 |
| 1.4 本论文的研究目的、意义、内容和技术路线 | 第26-28页 |
| 1.4.1 本论文研究目的和意义 | 第26-27页 |
| 1.4.2 本论文研究内容 | 第27页 |
| 1.4.3 本论文技术路线 | 第27-28页 |
| 第2章 鳃出血病流行病学调查 | 第28-36页 |
| 2.1 调查方法 | 第28-30页 |
| 2.2 调查用仪器设备 | 第30页 |
| 2.3 结果 | 第30-34页 |
| 2.3.1 发病历史 | 第30-31页 |
| 2.3.2 发病季节 | 第31页 |
| 2.3.3 发病症状 | 第31-32页 |
| 2.3.4 主要危害对象 | 第32-33页 |
| 2.3.5 苗种来源及养殖管理(苗种来源、养殖模式、养殖水质状况、饲料种类) | 第33-34页 |
| 2.4 分析与讨论 | 第34-36页 |
| 第3章 鳃出血病的病理学研究及病原鉴定 | 第36-61页 |
| 3.1 材料 | 第36-39页 |
| 3.1.1 主要仪器设备 | 第36页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第36-38页 |
| 3.1.3 样品采集 | 第38-39页 |
| 3.2 方法 | 第39-41页 |
| 3.2.1 光镜样品的制作与处理 | 第39-40页 |
| 3.2.2 电子显微镜样品制作与处理 | 第40页 |
| 3.2.3 PCR扩增与序列测定 | 第40页 |
| 3.2.4 柯赫氏法验证的回归感染实验 | 第40-41页 |
| 3.3 结果 | 第41-57页 |
| 3.3.1 组织病理观察 | 第41-47页 |
| 3.3.2 病理损伤评价 | 第47-49页 |
| 3.3.3 超微病理观察 | 第49-53页 |
| 3.3.4 PCR扩增与序列测定 | 第53-54页 |
| 3.3.5 回归感染试验 | 第54-55页 |
| 3.3.6 回归感染试验后的超微病理学验证 | 第55-57页 |
| 3.4 讨论 | 第57-61页 |
| 第4章 CyHV-2荧光原位杂交检测方法的建立 | 第61-68页 |
| 4.1 主要试剂与仪器 | 第61-62页 |
| 4.2 实验方法 | 第62-64页 |
| 4.2.1 CyHV-2的PCR检测 | 第62页 |
| 4.2.2 样品固定及切片制备 | 第62页 |
| 4.2.3 探针合成与标记 | 第62-63页 |
| 4.2.4 原位杂交 | 第63-64页 |
| 4.3 结果 | 第64-67页 |
| 4.4 讨论 | 第67-68页 |
| 第5章 基于转录组和蛋白组学研究CYHV-2的致病机理 | 第68-112页 |
| 5.1 实验材料 | 第68-69页 |
| 5.1.1 实验动物和病毒 | 第68页 |
| 5.1.2 主要器材及设备 | 第68-69页 |
| 5.1.3 主要试剂 | 第69页 |
| 5.2 实验方法 | 第69-77页 |
| 5.2.1 CyHV-2感染异育银鲫及头肾组织的取样 | 第69-70页 |
| 5.2.2 异育银鲫头肾总RNA的提取及浓度测定 | 第70-71页 |
| 5.2.3 Oligo dT富集异育银鲫头肾mRNA、片段化mRNA、反转录合成cDNA、连接adaptor | 第71页 |
| 5.2.4 异育银鲫头肾转录组Illumina Hiseq上机测序、数据质量剪切及统计 | 第71页 |
| 5.2.5 异育银鲫头肾转录组从头组装及注释 | 第71-73页 |
| 5.2.6 异育银鲫头肾转录组基因表达差异分析 | 第73-74页 |
| 5.2.7 异育银鲫头肾总蛋白的提取、浓度测定及胰酶酶解 | 第74页 |
| 5.2.8 异育银鲫头肾总蛋白TMT标记、HPLC分级、液相色谱-质谱联用分析 | 第74-75页 |
| 5.2.9 异育银鲫头肾总蛋白数据库搜索 | 第75页 |
| 5.2.10 异育银鲫头肾总蛋白生物信息学分析 | 第75-76页 |
| 5.2.11 实时荧光定量PCR检测差异表达蛋白基因水平表达变化 | 第76-77页 |
| 5.3 实验结果 | 第77-109页 |
| 5.3.1 异育银鲫头肾转录组测序试验结果与分析 | 第77-87页 |
| 5.3.2 异育银鲫头肾蛋白质组结果与分析 | 第87-93页 |
| 5.3.3 异育银鲫头肾转录组与蛋白质组联合分析 | 第93-107页 |
| 5.3.4 qRT-PCR验证差异基因的表达变化 | 第107-109页 |
| 5.4 讨论 | 第109-112页 |
| 第6章 基于代谢组学研究CYHV-2对异育银鲫代谢的影响 | 第112-130页 |
| 6.1 实验材料 | 第112页 |
| 6.1.1 主要器材及设备 | 第112页 |
| 6.1.2 主要试剂 | 第112页 |
| 6.2 实验方法 | 第112-116页 |
| 6.2.1 CyHV-2感染异育银鲫血清取样 | 第112-113页 |
| 6.2.2 异育银鲫血清代谢组样品处理方法 | 第113-114页 |
| 6.2.3 色谱-质谱分析 | 第114页 |
| 6.2.4 数据处理 | 第114-115页 |
| 6.2.5 差异代谢物的筛选 | 第115页 |
| 6.2.6 差异代谢物的生物信息学分析 | 第115-116页 |
| 6.3 实验结果 | 第116-128页 |
| 6.3.1 异育银鲫血清代谢组质量控制 | 第116-117页 |
| 6.3.2 异育银鲫血清代谢组数据分析 | 第117-121页 |
| 6.3.3 感染CyHV-2过程中异育银鲫血清代谢 | 第121-128页 |
| 6.3.4 差异代谢物生物信息学分析 | 第128页 |
| 6.4 讨论 | 第128-130页 |
| 全文小结 | 第130-133页 |
| 参考文献 | 第133-143页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第143-144页 |
| 致谢 | 第144页 |
