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环形泰勒虫遗传多样性分析及其在感染过程中对牛TLRs和NLRs信号通路的影响

摘要第6-7页
abstract第7-8页
第一章 引言第14-27页
    1.1 环形泰勒虫概述第14-16页
        1.1.1 病原形态结构第14页
        1.1.2 环形泰勒虫的生活史第14-15页
        1.1.3 环形泰勒虫的分布和流行第15-16页
    1.2 环形泰勒虫的诊断方法第16页
    1.3 环形泰勒虫遗传多样性的研究现状第16-17页
    1.4 Toll样受体与寄生虫感染第17-22页
        1.4.1 TLRs概述第17-19页
        1.4.2 TLRs在抗寄生虫感染免疫中的作用第19-22页
            1.4.2.1 TLRs在抗弓形虫感染中的作用第19-20页
            1.4.2.2 TLRs在抗锥虫感染中的作用第20页
            1.4.2.3 TLRs在抗利什曼原虫感染中的作用第20-21页
            1.4.2.4 TLRs在抗蠕虫感染中的作用第21页
            1.4.2.5 TLRs在抗混合感染中的作用第21-22页
    1.5 NLR家族与寄生虫感染第22-25页
        1.5.1 NLRs概述第22-23页
        1.5.2 NLRs在抗寄生虫感染免疫中的作用第23-25页
            1.5.2.1 NLRs在抗弓形虫感染中的作用第23-24页
            1.5.2.2 NLRs在抗疟原虫感染中的作用第24页
            1.5.2.3 NLRs在抗锥虫感染中的作用第24-25页
            1.5.2.4 NLRs在抗利什曼原虫感染中的作用第25页
    1.6 研究目的与意义第25-27页
第二章 牛环形泰勒虫LF-RPA检测方法的建立第27-35页
    2.1 材料和方法第27-30页
        2.1.1 试验材料第27页
        2.1.2 仪器设备和试剂第27-28页
        2.1.3 动物感染和环形泰勒虫红细胞阶段裂殖子纯化第28页
        2.1.4 基因组DNA提取第28-29页
        2.1.5 LF-RPA反应引物和探针的设计第29页
        2.1.6 LF-RPA反应和检测结果的读取第29页
        2.1.7 PCR试验第29-30页
    2.2 结果与分析第30-33页
        2.2.1 试验动物第30页
        2.2.2 LF-RPA最佳反应温度和时间第30-31页
        2.2.3 LF-RPA反应的特异性分析第31-32页
        2.2.4 LF-RPA反应的敏感性分析第32-33页
        2.2.5 临床样品的检测第33页
    2.3 讨论第33-35页
第三章 中国地区环形泰勒虫遗传多样性的研究第35-45页
    3.1 材料和方法第35-38页
        3.1.1 试验材料第35-36页
        3.1.2 仪器设备和试剂第36页
        3.1.3 环形泰勒虫阳性样品的筛选第36页
        3.1.4 微卫星和小卫星的基因分型第36-37页
        3.1.5 数据分析第37-38页
    3.2 结果与分析第38-43页
        3.2.1 PCR检测阳性样品结果第38-39页
        3.2.2 种群多样性和MOI分析第39-40页
        3.2.3 种群连锁平衡分析第40-41页
        3.2.4 种群遗传分化分析第41页
        3.2.5 种群遗传结构分析第41-43页
    3.3 讨论第43-45页
第四章 环形泰勒虫体外刺激牛PBMC免疫相关基因的转录表达谱分析第45-64页
    4.1 材料和方法第45-51页
        4.1.1 试验材料第45-46页
        4.1.2 仪器设备和试剂第46页
        4.1.3 环形泰勒虫子孢子悬液的制备第46页
        4.1.4 牛PBMC的分离、感染和培养第46-47页
        4.1.5 环形泰勒虫子孢子感染后的牛PBMC鉴定和样品收集第47页
        4.1.6 RNA提取和质量鉴定第47页
        4.1.7 文库构建和测序第47-48页
        4.1.8 转录表达谱数据分析第48页
        4.1.9 差异表达基因分析第48页
        4.1.10 荧光定量PCR验证第48-50页
        4.1.11 细胞上清中细胞因子检测及数据分析第50-51页
    4.2 结果与分析第51-61页
        4.2.1 环形泰勒虫子孢子悬液鉴定结果第51页
        4.2.2 环形泰勒虫子孢子感染牛PBMC鉴定结果及RNA质量检测第51-52页
        4.2.3 RNA质量检测第52页
        4.2.4 转录组测序数据分析第52-53页
        4.2.5 差异表达基因的筛选第53-54页
        4.2.6 差异表达基因GO富集分析第54-56页
        4.2.7 差异表达基因KEGG富集分析第56-57页
        4.2.8 差异表达基因参与的免疫反应第57-60页
        4.2.9 荧光定量PCR验证差异基因的表达水平第60-61页
        4.2.10 细胞上清中细胞因子检测结果第61页
    4.3 讨论第61-64页
第五章 环形泰勒虫感染对牛TLRs和NLRs信号通路的影响第64-76页
    5.1 材料和方法第64-69页
        5.1.1 试验材料第64-65页
        5.1.2 仪器设备和试剂第65页
        5.1.3 环形泰勒虫子孢子悬液的制备及动物感染试验第65页
        5.1.4 血液样品的收集及处理第65页
        5.1.5 环形泰勒虫感染鉴定第65-66页
        5.1.6 牛PBMC的分离第66页
        5.1.7 RNA提取和质量鉴定第66页
        5.1.8 cDNA合成第66-67页
        5.1.9 PCRArray试验及数据分析第67-68页
        5.1.10 荧光定量PCR验证第68-69页
        5.1.11 血清中细胞因子检测及数据分析第69页
    5.2 结果与分析第69-73页
        5.2.1 环形泰勒虫感染鉴定结果第69-70页
        5.2.2 TLRs和NLRs信号通路相关基因的筛选结果第70-72页
        5.2.3 荧光定量PCR验证差异基因的表达水平第72-73页
        5.2.4 血清中细胞因子检测结果第73页
    5.3 讨论第73-76页
第六章 结论第76-77页
参考文献第77-90页
致谢第90-91页
作者简介第91页

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