| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-21页 |
| 1.1 黄渤海概况 | 第13页 |
| 1.2 放线菌概述 | 第13-15页 |
| 1.2.1 放线菌 | 第13-14页 |
| 1.2.2 海洋放线菌的研究进展 | 第14页 |
| 1.2.3 放线菌的分离研究 | 第14-15页 |
| 1.3 分子生物学技术研究微生物多样性 | 第15-17页 |
| 1.3.1 16S rDNA 文库分析法 | 第15-16页 |
| 1.3.2 变性梯度凝胶电泳技术（DGGE） | 第16页 |
| 1.3.3 荧光原位杂交技术（FISH） | 第16页 |
| 1.3.4 其他多样性分析方法 | 第16-17页 |
| 1.4 功能基因研究现状 | 第17-19页 |
| 1.4.1 聚酮合酶基因研究现状 | 第17-18页 |
| 1.4.2 非核糖体肽合成酶（NRPS）基因研究现状 | 第18-19页 |
| 1.5 新种的分类鉴定方法 | 第19-20页 |
| 1.5.1 传统分类法 | 第19页 |
| 1.5.2 化学分类法 | 第19-20页 |
| 1.5.4 分子分类法 | 第20页 |
| 1.5.5 多相分类法 | 第20页 |
| 1.6 本论文研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 第二章 免培养技术分析黄渤海放线菌多样性 | 第21-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 黄渤海样品 | 第21-22页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-29页 |
| 2.2.1 沉积物宏基因组的提取及纯化 | 第22-24页 |
| 2.2.2 纯化产物的放线菌特异性引物扩增 | 第24-26页 |
| 2.2.3 16S rDNA 文库的构建及 RFLP 分析 | 第26-28页 |
| 2.2.4 16S rDNA 序列的测序 | 第28页 |
| 2.2.5 16S rDNA 文库的构建及多样性分析 | 第28-29页 |
| 2.3 实验结果及分析讨论 | 第29-42页 |
| 2.3.1 土壤 DNA 的提取及纯化 | 第29页 |
| 2.3.2 放线菌特异性引物扩增条件的探讨 | 第29-31页 |
| 2.3.3 16S rDNA 文库的构建及 RFLP 分析 | 第31-32页 |
| 2.3.5 16S rDNA 文库多样性指数分析 | 第32-33页 |
| 2.3.6 16S rDNA 文库的多样性分析 | 第33-42页 |
| 2.4 本章小结 | 第42-44页 |
| 第三章 纯培养技术分析黄渤海放线菌多样性 | 第44-58页 |
| 3.1 实验材料 | 第44-46页 |
| 3.1.1 土壤样品 | 第44-45页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器 | 第45-46页 |
| 3.2 实验方法 | 第46-48页 |
| 3.2.1 放线菌的分离培养 | 第46页 |
| 3.2.2 菌株的纯化和保藏 | 第46-47页 |
| 3.2.3 放线菌菌株基因组 DNA 的提取 | 第47页 |
| 3.2.4 放线菌菌株 DNA 的 16S rDNA 扩增 | 第47-48页 |
| 3.2.5 PCR 产物的纯化 | 第48页 |
| 3.2.6 胶回收产物与载体连接、转化 | 第48页 |
| 3.2.7 挑取阳性克隆子，验证，送测序 | 第48页 |
| 3.3 实验结果 | 第48-55页 |
| 3.3.1 黄渤海放线菌的分离纯化 | 第48-50页 |
| 3.3.2 纯化的放线菌菌株基因组 DNA 的提取 | 第50-51页 |
| 3.3.3 放线菌菌株 DNA 的 16S rDNA 的扩增及纯化 | 第51页 |
| 3.3.4 黄渤海纯培养放线菌多样性分析 | 第51-53页 |
| 3.3.5 构建 16S rDNA 系统发育树及分析 | 第53-55页 |
| 3.4 免培养与纯培养技术结果比较 | 第55-56页 |
| 3.5 本章小结 | 第56-58页 |
| 第四章 黄渤海纯培养放线菌功能基因的筛选 | 第58-66页 |
| 4.1 实验材料 | 第58-59页 |
| 4.1.1 样品 | 第58页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第58-59页 |
| 4.2 实验方法 | 第59-60页 |
| 4.2.1 放线菌基因组 DNA 的提取 | 第59页 |
| 4.2.2 放线菌功能基因扩增 | 第59-60页 |
| 4.3 实验结果及分析 | 第60-65页 |
| 4.3.0 PKS-I、PKS-II 和 NRPS 基因扩增结果 | 第60-61页 |
| 4.3.1 I 型聚酮合酶（PKSI）功能基因片段扩增结果分析 | 第61-62页 |
| 4.3.2 II 型聚酮合酶（PKSII）功能基因片段扩增结果分析 | 第62-64页 |
| 4.3.3 非核糖体肽合成酶（NRPS）功能基因片段扩增结果分析 | 第64-65页 |
| 4.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 第五章 南极一株放线菌新种的分离鉴定 | 第66-82页 |
| 5.1 实验材料 | 第66-68页 |
| 5.1.1 测试菌株 | 第66页 |
| 5.1.2 主要试剂及仪器 | 第66-67页 |
| 5.1.3 培养基 | 第67-68页 |
| 5.2 实验方法 | 第68-72页 |
| 5.2.1 GW92T基因组 DNA 的提取及 16S rDNA 的扩增[32] | 第68页 |
| 5.2.2 电镜 | 第68页 |
| 5.2.3 保藏号 | 第68页 |
| 5.2.4 (G+C)mol%含量测定及 DNA 杂交 | 第68-69页 |
| 5.2.5 菌株培养特征测定 | 第69页 |
| 5.2.6 生理生化实验的测定 | 第69-71页 |
| 5.2.7 菌株 GW92T细胞化学组分测定 | 第71-72页 |
| 5.3 实验结果 | 第72-80页 |
| 5.3.1 GW92T基因组提取及 PCR 扩增 | 第72-73页 |
| 5.3.2 16S rDNA 序列的比对及模式菌株的选取 | 第73-75页 |
| 5.3.3 GW92T的电镜形态观察 | 第75页 |
| 5.3.4 保藏号的收录 | 第75页 |
| 5.3.5 GW92T的(G+C)mol%含量测定及 DNADNA 杂交结果 | 第75-76页 |
| 5.3.6 GW92T的菌株培养特征测定结果 | 第76页 |
| 5.3.7 GW92T的生理生化实验的测定结果 | 第76-78页 |
| 5.3.8 GW92T的细胞化学组分的分析结果 | 第78-80页 |
| 5.4 本章小结 | 第80-82页 |
| 论文总结 | 第82-84页 |
| 研究展望 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 个人简历 | 第89-90页 |
| 发表的学术论文 | 第90-91页 |
