ABSTRACT | 第5-6页 |
摘要 | 第7-8页 |
Abbreviations | 第8-13页 |
1 Introduction | 第13-16页 |
2 Review of the literature | 第16-47页 |
2.1 | 第16-20页 |
2.1.1 Developmental stages of the epididymis | 第16页 |
2.1.2 Embryonic stage of epididymal development | 第16页 |
2.1.3 The efferent ducts | 第16-17页 |
2.1.4 Segment formation | 第17-18页 |
2.1.5 The expression of androgen receptor (Ar) | 第18-20页 |
2.1.6 Postnatal development | 第20页 |
2.2 Epithelium structure of the epididymis | 第20-25页 |
2.2.1 Principal cells | 第22页 |
2.2.2 Epididymal narrow and clear cells | 第22-23页 |
2.2.3 Epididymal apical cells | 第23页 |
2.2.4 Epididymal basal cells | 第23-24页 |
2.2.5 Epididymal halo cells | 第24-25页 |
2.2.6 Epididymal smooth muscle cells | 第25页 |
2.3 Epididymal maturation of sperm in the luminal fluid | 第25-37页 |
2.3.1 Ions | 第26-30页 |
2.3.2 Lipids | 第30-33页 |
2.3.3 Proteins | 第33-37页 |
2.4 Steroids and Lumicrine factors regulation of epididymal function | 第37-39页 |
2.4.1 Steroids | 第37-38页 |
2.4.2 Lumicrine factors | 第38-39页 |
2.5 Epididymal gene expression Regulation | 第39-44页 |
2.5.1 Beta-defensins | 第39-40页 |
2.5.2 Lipocalins | 第40-42页 |
2.5.3 Aquaporins | 第42-44页 |
2.6 Research technical route | 第44-45页 |
2.6.1 Experimental process | 第44-45页 |
2.6.2 Bioinformatics analysis | 第45页 |
2.7 Objectives of this study | 第45-47页 |
3 Materials and methods | 第47-57页 |
3.1 Epididymal sample collection and Animals | 第48-49页 |
3.2 RNA extraction, library preparation, and sequencing | 第49-50页 |
3.3 Data Processing, and assembly of yak and cattleyaktranscriptome | 第50-52页 |
3.4 Functional annotation and functional enrichment analysis DEGs | 第52页 |
3.5 Gene Ontology (GO) enrichment analysis of DEGs | 第52-53页 |
3.6 KEGG pathway enrichment analysis of DEGs | 第53-54页 |
3.7 qRT-PCR Validation of m RNA-Seq data | 第54-57页 |
4 Results | 第57-76页 |
4.1 Sequencing and assembly of yak and cattleyak transcriptome | 第57-58页 |
4.2 Comparative analysis of gene expression | 第58-59页 |
4.3 (GO) enrichment analysis of DEGs | 第59-61页 |
4.4 KEGG Pathway enrichment analysis of DEGs | 第61-73页 |
4.5 qRT-PCR Validation of Illumina RNA-Seq data | 第73-76页 |
5 Discussion and conclusion | 第76-85页 |
5.1 Discussion | 第76-79页 |
5.1.1 Use of m RNA-Seq in male cattleyak infertility Research | 第76-79页 |
5.2 KEGG functional enrichment analysis of the DEGs | 第79-83页 |
5.3 Conclusion | 第83-85页 |
6 Acknowledgments | 第85-87页 |
7 Reference | 第87-102页 |
8 Appendix A | 第102-118页 |
8.1 Table 8-1 S1 List of top enriched GO terms for biological function | 第102-108页 |
8.2 Table 8-2 S2 List of 271 KEGG enriched pathway of DEGs inYK and CY | 第108-118页 |