| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩写词及符号说明 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1. 稀有放线菌简介 | 第11-13页 |
| 2. 稀有放线菌中天然产物的研究进展 | 第13-18页 |
| 2.1 小单孢菌属中的天然产物 | 第13-15页 |
| 2.2 诺卡氏菌属中的天然产物 | 第15-16页 |
| 2.3 拟无枝酸菌属中的天然产物 | 第16-17页 |
| 2.4 其余稀有放线菌中的天然产物 | 第17-18页 |
| 3. 本学位论文研究目的和内容 | 第18-19页 |
| 参考文献 | 第19-23页 |
| 第二章 两株稀有放线菌中新五酮安莎霉素的定向挖掘 | 第23-50页 |
| 1. 引言 | 第23-24页 |
| 1.1 安莎霉素 | 第23页 |
| 1.2 安莎霉素类化合物的生物合成研究 | 第23-24页 |
| 2. 实验材料 | 第24-29页 |
| 2.1 菌株、质粒 | 第24-25页 |
| 2.2 培养基 | 第25-26页 |
| 2.3 常用试剂 | 第26-28页 |
| 2.4 主要仪器 | 第28-29页 |
| 3. 实验方法 | 第29-34页 |
| 3.1 菌株的活化与培养 | 第29页 |
| 3.2 两株稀有放线菌遗传操作条件摸索 | 第29-31页 |
| 3.3 基因组序列的生物信息学分析 | 第31页 |
| 3.4 组成型表达质粒的构建 | 第31-33页 |
| 3.5 稀有放线菌基因组DNA提取 | 第33页 |
| 3.6 突变株的验证与发酵产物的HPLC检测 | 第33-34页 |
| 4. 实验结果与讨论 | 第34-47页 |
| 4.1 Micromonospora sp.HK160111与Verrucosispora sp. NS0172中安莎霉素基因簇的序列注释与分析 | 第34-36页 |
| 4.2 稀有放线菌Micromonospora sp.HK160111与Verrucosispora sp. NS0172遗传操作体系的建立 | 第36-39页 |
| 4.3 小单孢菌HK160111中五酮安莎霉素的挖掘及生物合成研究 | 第39-45页 |
| 4.4 疣孢菌NS0172中五酮安莎霉素的挖掘 | 第45-47页 |
| 5. 本章小结 | 第47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 第三章 小单孢菌中AHPN基因簇的激活 | 第50-73页 |
| 1. 引言 | 第50-51页 |
| 2. 实验材料 | 第51-54页 |
| 2.1 菌株、质粒 | 第51-52页 |
| 2.2 培养基 | 第52-54页 |
| 2.3 常用试剂与主要仪器 | 第54页 |
| 2.4 主要仪器 | 第54页 |
| 3. 实验方法 | 第54-59页 |
| 3.1 十四株小单孢菌的遗传操作条件摸索 | 第54页 |
| 3.2 小单孢菌FXYA29 AHPN基因簇中NRPS基因的敲除 | 第54-55页 |
| 3.3 小单孢菌FXY120、NS0208AHPN基因簇AHBA基因的敲除（以小单孢菌120为例) | 第55-56页 |
| 3.4 小单孢菌FXYA29 AHPN基因簇中LAL调控基因的启动子评价 | 第56页 |
| 3.5 小单孢菌FXYA29 AHPN基因簇中LAL2调控基因的敲除 | 第56-57页 |
| 3.6 小单孢菌FXYA29 AHPN基因簇中LAL1与LAL2调控基因的组成型表达 | 第57-58页 |
| 3.7 AHPN基因簇启动子指示菌株的构建 | 第58-59页 |
| 3.8 AHPN基因簇启动子指示菌株的培养基筛选 | 第59页 |
| 4. 实验结果与讨论 | 第59-71页 |
| 4.1 AHPN生物合成基因簇分析及产物预测 | 第59-60页 |
| 4.2 14株小单孢菌遗传操作体系的建立 | 第60-62页 |
| 4.3 关键基因的缺失证实该基因簇处于沉默状态 | 第62-64页 |
| 4.4 操纵调控基因表达激活AHPN基因簇 | 第64-69页 |
| 4.5 双报告基因指示与培养基筛选策略激活AHPN基因簇 | 第69-71页 |
| 5. 本章小结 | 第71页 |
| 参考文献 | 第71-73页 |
| 第四章 小单孢菌FXY120中新颖次级代谢产物的挖掘 | 第73-86页 |
| 1. 引言 | 第73页 |
| 2. 实验材料 | 第73-74页 |
| 2.1 菌株、质粒及培养基 | 第73-74页 |
| 2.2 试剂与主要仪器 | 第74页 |
| 3. 实验方法 | 第74-75页 |
| 3.1 FXY120目标基因簇的Fosmid文库筛选 | 第74页 |
| 3.2 FXY120 GC1基因簇中NRPS-1基因的回补 | 第74页 |
| 3.3 FXY120 GC10基因簇中启动子置换突变株的构建 | 第74-75页 |
| 4. 实验结果与讨论 | 第75-84页 |
| 4.1 基因簇的序列注释与分析 | 第75-79页 |
| 4.2 小单孢菌FXY120 GC1新颖次级代谢产物的挖掘 | 第79-82页 |
| 4.4 小单孢菌FXY120 GC3沉默次级代谢基因簇的激活 | 第82-83页 |
| 4.5 小单孢菌FXY120 GC6沉默次级代谢基因簇的激活 | 第83页 |
| 4.6 小单孢菌FXY120 GC10沉默次级代谢基因簇的激活 | 第83-84页 |
| 5. 本章小结 | 第84页 |
| 参考文献 | 第84-86页 |
| 全文总结与展望 | 第86-88页 |
| 附录一: Streptomycete sp. S006次级代谢产物的挖掘 | 第88-90页 |
| 附录二: 所有引物信息列表 | 第90-92页 |
| 附录三: 稀有放线菌发酵提取物的HPLC检测条件 | 第92-94页 |
| 附录四: 基因簇注释表 | 第94-100页 |
| 附录五: Micromonospora spp.中AHPN基因簇启动子指示菌株培养基筛选结果 | 第100-103页 |
| 致谢 | 第103-105页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第105-107页 |
| 学位论文评阅及答辩情况 | 第107页 |
