摘要 | 第8-9页 |
ABSTRACT | 第9-10页 |
缩略词 | 第11-12页 |
第一章 绪论 | 第12-20页 |
1.1 生物信息学 | 第12-13页 |
1.2 转录组学 | 第13-15页 |
1.3 基因注释 | 第15-17页 |
1.4 脉红螺摄食过程 | 第17-19页 |
1.5 研究内容和意义 | 第19-20页 |
第二章 未注释序列来源及分析方法 | 第20-23页 |
2.1 材料与序列筛选 | 第20-21页 |
2.1.1 材料 | 第20页 |
2.1.2 未注释序列的筛选 | 第20-21页 |
2.2 分析方法 | 第21-23页 |
2.2.1 预测未注释序列的CDS区 | 第21页 |
2.2.2 预测未注释序列的蛋白质结构域 | 第21页 |
2.2.3 预测未注释序列的蛋白质功能 | 第21页 |
2.2.4 预测未注释序列的蛋白质二级结构 | 第21-23页 |
第三章 未注释序列分析结果 | 第23-42页 |
3.1 未注释序列的筛选 | 第23页 |
3.2 未注释序列的CDS区识别 | 第23-24页 |
3.3 未注释序列的蛋白质结构域分析 | 第24-29页 |
3.3.1 S1-S2样本间序列的InterProScan分析 | 第25-27页 |
3.3.2 S1-S3样本间序列的InterProScan分析 | 第27页 |
3.3.3 S1-S4样本间序列的InterProScan分析 | 第27-29页 |
3.4 未注释序列的蛋白质功能分析 | 第29-40页 |
3.4.1 S1-S2样本间序列的蛋白质功能分析 | 第30-33页 |
3.4.2 S1-S3样本间序列的蛋白质功能分析 | 第33-36页 |
3.4.3 S1-S4样本间序列的蛋白质功能分析 | 第36-39页 |
3.4.4 蛋白质功能预测总结 | 第39-40页 |
3.5 未注释序列的蛋白质二级结构 | 第40-42页 |
第四章 讨论 | 第42-48页 |
4.1 分析预测方法的选择 | 第42-46页 |
4.2 本文总结及展望 | 第46-48页 |
附录 | 第48-90页 |
附录一 CDS区可视化处理 | 第48-52页 |
附录二 预测的蛋白二级结构平面图 | 第52-58页 |
附录三 蛋白预测信息汇总 | 第58-76页 |
附表一 S1-S2蛋白预测信息汇总 | 第58-66页 |
附表二 S1-S3蛋白预测信息汇总 | 第66-72页 |
附表三 S1-S4蛋白预测信息汇总 | 第72-76页 |
附录四 测序后获得的转录本序列 | 第76-90页 |
参考文献 | 第90-99页 |
致谢 | 第99-100页 |
附件 | 第100页 |