| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 概述 | 第10-16页 |
| 1 植物内生细菌概述 | 第10-11页 |
| 2 土壤重金属污染及生物修复 | 第11-13页 |
| 3 研究背景、内容及意义 | 第13-16页 |
| 第二章 募乃铅锌矿渣堆三种优势植物根内生细菌多样性初探 | 第16-32页 |
| 1 样地介绍 | 第16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-24页 |
| 2.1 样品采集 | 第16-17页 |
| 2.2 样品处理 | 第17-19页 |
| 2.2.1 根际土样的处理 | 第17-18页 |
| 2.2.1.1 根际土样重金属含量测定 | 第17页 |
| 2.2.1.2 根际土样理化性质的测定 | 第17-18页 |
| 2.2.2 根样处理 | 第18-19页 |
| 2.3 根内生细菌16S rDNA基因片段的扩增及产物纯化 | 第19-21页 |
| 2.3.1 根内生细菌16S rDNA基因片段的PCR扩增 | 第19-20页 |
| 2.3.2 PCR产物的回收纯化 | 第20-21页 |
| 2.4 根内生细菌16S rDNA克隆文库的构建 | 第21-23页 |
| 2.4.1 目的基因片段与载体的连接 | 第21页 |
| 2.4.2 感受态细胞的制备 | 第21-22页 |
| 2.4.3 感受态细胞的转化 | 第22页 |
| 2.4.4 阳性克隆的筛选 | 第22-23页 |
| 2.4.5 阳性克隆测序 | 第23页 |
| 2.5 根内生细菌16S rDNA克隆文库的初步分析 | 第23-24页 |
| 2.5.1 测序结果处理和嵌合序列检测 | 第23页 |
| 2.5.2 文库OTU的划分和稀疏曲线 | 第23-24页 |
| 2.5.3 文库内细菌多样性指数分析 | 第24页 |
| 3 结果 | 第24-30页 |
| 3.1 根际土壤重金属含量和理化性质测定 | 第24-27页 |
| 3.2 根内总DNA的提取 | 第27页 |
| 3.3 根内生细菌16S rDNA基因的扩增及纯化 | 第27-29页 |
| 3.4 克隆文库的构建及初步分析 | 第29-30页 |
| 4 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 三种优势植物根内生细菌分子多样性比较 | 第32-49页 |
| 1 材料和方法 | 第32-34页 |
| 1.1 材料 | 第32页 |
| 1.2 方法 | 第32-34页 |
| 1.2.1 所有序列划分OTU | 第32页 |
| 1.2.2 四个文库间OTU的共享 | 第32页 |
| 1.2.3 四个文库间细菌群落结构相似性 | 第32-33页 |
| 1.2.4 四个文库细菌群落相似性树形图 | 第33页 |
| 1.2.5 根内生细菌同源性分析 | 第33-34页 |
| 1.2.6 系统发育树的构建 | 第34页 |
| 2 结果 | 第34-46页 |
| 2.1 四个文库间OTU的共享 | 第34页 |
| 2.2 文库间细菌群落结果相似性比较 | 第34-36页 |
| 2.3 序列同源性分析 | 第36页 |
| 2.4 系统进化分析 | 第36-37页 |
| 2.5 各文库根内生细菌类群的多样性 | 第37-46页 |
| 3 讨论 | 第46-49页 |
| 小结与展望 | 第49-51页 |
| 附录 | 第51-75页 |
| 参考文献 | 第75-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
