CNV区域周围的基因预测研究
| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-18页 |
| 1.1 引言 | 第8-9页 |
| 1.2 重复序列和拷贝数变异 | 第9-13页 |
| 1.2.1 重复序列 | 第9-11页 |
| 1.2.2 拷贝数变异 | 第11-13页 |
| 1.3 基因预测 | 第13-17页 |
| 1.3.1 基因组注释与基因预测 | 第13-14页 |
| 1.3.2 基因预测研究状况 | 第14-17页 |
| 1.4 本文主要内容 | 第17-18页 |
| 第二章 基因结构及预测原理 | 第18-37页 |
| 2.1 基因特征简介 | 第18-21页 |
| 2.1.1 基因基本概念 | 第18-19页 |
| 2.1.2 基因结构特征 | 第19-21页 |
| 2.2 真核生物基因预测原理 | 第21-27页 |
| 2.2.1 信号识别 | 第22-25页 |
| 2.2.2 区域识别 | 第25-27页 |
| 2.3 隐马尔可夫模型及其在基因预测中的应用 | 第27-36页 |
| 2.3.1 HMM 定义及类型 | 第28-29页 |
| 2.3.2 HMM 基本问题及解决算法 | 第29-34页 |
| 2.3.3 HMM 在基因预测中的应用 | 第34-36页 |
| 2.4 本章小结 | 第36-37页 |
| 第三章 基因预测系统实现 | 第37-45页 |
| 3.1 概述 | 第37-38页 |
| 3.2 基于混合方法的系统设计 | 第38-43页 |
| 3.2.1 系统总体设计 | 第38-39页 |
| 3.2.2 保守序列标记模块 | 第39页 |
| 3.2.3 EST 序列标记模块 | 第39-40页 |
| 3.2.4 基因识别模块 | 第40-43页 |
| 3.3 系统实现 | 第43-44页 |
| 3.3.1 系统平台 | 第43页 |
| 3.3.2 实现语言 | 第43页 |
| 3.3.3 数据结构 | 第43-44页 |
| 3.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第四章 230个CNV区域周围的基因预测 | 第45-58页 |
| 4.1 数据准备 | 第45-48页 |
| 4.1.1 目标预测区域选取 | 第45-47页 |
| 4.1.2 同源基因组数据准备 | 第47-48页 |
| 4.1.3 EST 数据准备 | 第48页 |
| 4.2 预测流程 | 第48-51页 |
| 4.3 预测结果及分析 | 第51-57页 |
| 4.3.1 预测结果总述 | 第51-53页 |
| 4.4.2 预测性能评估 | 第53-55页 |
| 4.3.3 预测结果分析 | 第55-57页 |
| 4.4 本章小结 | 第57-58页 |
| 第五章 总结和展望 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 附录 | 第65-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第71-73页 |
