| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 符号说明及缩略词 | 第7-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-37页 |
| 1 叶绿体简介 | 第11-13页 |
| 1.1 叶绿体的内共生学说 | 第11页 |
| 1.2 叶绿体的形态和结构 | 第11-12页 |
| 1.3 叶绿体基因组结构 | 第12-13页 |
| 2 叶绿体基因表达和调控 | 第13-31页 |
| 2.1 叶绿体基因转录 | 第13-17页 |
| 2.2 mRNA剪切 | 第17-18页 |
| 2.3 mRNA剪接 | 第18-19页 |
| 2.4 mRNA编辑 | 第19-31页 |
| 2.4.1 PPR蛋白 | 第21-24页 |
| 2.4.2 非PPR蛋白 | 第24-31页 |
| 3 叶绿体PPR蛋白AtECB2 | 第31-35页 |
| 3.1 AtECB2功能缺失突变体atecb2的发现 | 第31-32页 |
| 3.2 AtECB2蛋白的功能 | 第32-35页 |
| 3.2.1 AtECB2影响叶绿体基因的转录后加工 | 第32-33页 |
| 3.2.2 AtECB2影响PEP聚合酶依赖的叶绿体基因的转录 | 第33-34页 |
| 3.2.3 AtECB2可能参与核质逆行信号对ZAT10转录因子的调控 | 第34-35页 |
| 4 本课题的研究目的和意义 | 第35-37页 |
| 第二章 材料与方法 | 第37-63页 |
| 第一节 实验材料及设备 | 第37-41页 |
| 1.1 植物材料 | 第37页 |
| 1.2 菌株和质粒 | 第37-38页 |
| 1.2.1 菌株 | 第37-38页 |
| 1.2.2 质粒 | 第38页 |
| 1.3 培养基及抗生素 | 第38-39页 |
| 1.3.1 培养基 | 第38-39页 |
| 1.3.2 抗生素 | 第39页 |
| 1.4 工具酶及试剂 | 第39-40页 |
| 1.4.1 工具酶类 | 第39-40页 |
| 1.4.2 实验试剂 | 第40页 |
| 1.5 实验仪器 | 第40-41页 |
| 第二节 实验方法 | 第41-63页 |
| 2.1 拟南芥培养 | 第41页 |
| 2.1.1 拟南芥土壤种植方法 | 第41页 |
| 2.1.2 平皿上种植拟南芥的方法 | 第41页 |
| 2.2 拟南芥基因组的提取 | 第41-42页 |
| 2.3 拟南芥突变体的鉴定 | 第42-43页 |
| 2.3.1 atecb2突变体的鉴定 | 第42页 |
| 2.3.2 hemc-1突变体的鉴定 | 第42页 |
| 2.3.3 morf9突变体的鉴定 | 第42-43页 |
| 2.4 载体的构建 | 第43-44页 |
| 2.4.1 载体的常规酶切构建 | 第43页 |
| 2.4.2 同源重组 | 第43页 |
| 2.4.3 载体构建所用到的引物 | 第43-44页 |
| 2.5 大肠杆菌转化 | 第44-45页 |
| 2.6 农杆菌感受态的制备和转化 | 第45-46页 |
| 2.6.1 感受态的制备 | 第45-46页 |
| 2.6.2 农杆菌转化 | 第46页 |
| 2.7 蛋白表达 | 第46-47页 |
| 2.8 电感耦合等离子体原子发射光谱法(ICP)测定Zn~(2+)的含量 | 第47-49页 |
| 2.8.1 前期蛋白样品制备 | 第47-48页 |
| 2.8.2 蛋白样品处理 | 第48页 |
| 2.8.3 样品分析 | 第48-49页 |
| 2.9 RNA编辑效率检测 | 第49-51页 |
| 2.9.1 RNA的提取 | 第49-50页 |
| 2.9.2 RNA的纯化 | 第50页 |
| 2.9.3 cDNA合成 | 第50页 |
| 2.9.4 样品扩增 | 第50-51页 |
| 2.10 叶绿体蛋白各组分的分离 | 第51-53页 |
| 2.11 酵母双杂交 | 第53-55页 |
| 2.12 植物体内免疫共沉淀以及质谱实验 | 第55-57页 |
| 2.12.1 植物体内免疫共沉淀(Co-IP) | 第55-56页 |
| 2.12.2 质谱分析Co-IP样品组分 | 第56-57页 |
| 2.13 Blue-Native实验 | 第57-60页 |
| 2.13.1 Bule-Native蛋白样品的制备 | 第57-58页 |
| 2.13.2 蛋白样品的双向电泳及Western实验 | 第58-60页 |
| 2.14 RNA免疫共沉淀(RNA-chip) | 第60-63页 |
| 第三章 结果 | 第63-87页 |
| 1 AtECB2蛋白直接参与质体基因转录本的RNA编辑过程 | 第63-66页 |
| 2 植物体内与AtECB2相关蛋白的分离与鉴定 | 第66-70页 |
| 3 AtECB2蛋白与HEMC蛋白在体外能够互作 | 第70-73页 |
| 4 AtECB2蛋白E结构域介导的蛋白互作对于RNA编辑是必须的 | 第73-75页 |
| 5 hemc突变体中质体基因RNA编辑受到影响 | 第75-77页 |
| 6 AtECB2以及MORF蛋白在植物体内的精细定位 | 第77-79页 |
| 7 MORF蛋白在7个编辑位点附近的结合情况 | 第79-81页 |
| 8 AtECB2蛋白的DYW结构域具有结合锌离子的能力 | 第81-83页 |
| 9 PPR蛋白的DYW结构域功能保守性分析 | 第83-85页 |
| 10 AtECB2蛋白与pTAC8蛋白存在互作 | 第85-87页 |
| 第四章 讨论 | 第87-94页 |
| 1 AtECB2与MORF蛋白一起共同参与RNA的编辑过程 | 第87-89页 |
| 2 编辑体是一个动态的复合物 | 第89-91页 |
| 3 AtECB2蛋白与质体基因转录的关系 | 第91-94页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第94-99页 |
| 1 全文总结 | 第94-96页 |
| 2 展望 | 第96-99页 |
| 参考文献 | 第99-108页 |
| 作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第108-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
