摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 绪论 | 第12-18页 |
1.1 研究背景和意义 | 第12-13页 |
1.2 国内外研究现状 | 第13-16页 |
1.2.1 基于序列的miRNA-靶基因关系预测方法 | 第14页 |
1.2.2 基于多信息融合的miRNA-靶基因关系预测方法 | 第14-16页 |
1.3 本文主要工作 | 第16-17页 |
1.4 本文组织结构 | 第17-18页 |
第2章 miRNA及其靶基因关系预测方法概述 | 第18-26页 |
2.1 引言 | 第18页 |
2.2 miRNA-miRNA功能相似性矩阵的计算 | 第18-22页 |
2.2.1 基于目标基因计算miRNA-miRNA功能相似性矩阵 | 第19-20页 |
2.2.2 基于关联疾病计算miRNA-miRNA功能相似性矩阵 | 第20-22页 |
2.3 miRNA-target关系预测方法 | 第22-25页 |
2.3.1 基于序列信息预测miRNA-target关系 | 第22页 |
2.3.2 基于表达谱数据预测miRNA-target关系 | 第22-25页 |
2.4 结论 | 第25-26页 |
第3章 基于元路径预测miRNA-target调控关系 | 第26-41页 |
3.1 引言 | 第26-27页 |
3.2 相关概念 | 第27-29页 |
3.2.1 异构信息网络 | 第27-28页 |
3.2.2 元路径 | 第28-29页 |
3.3 RMLM及RMLMSe算法描述 | 第29-34页 |
3.3.1 算法框架 | 第29页 |
3.3.2 算法步骤 | 第29-34页 |
3.4 实验及结果分析 | 第34-39页 |
3.4.1 实验数据 | 第34-35页 |
3.4.2 实验结果及分析 | 第35-39页 |
3.5 本章小结 | 第39-41页 |
第4章 基于双层网络随机游走预测miRNA-target关系 | 第41-54页 |
4.1 引言 | 第41页 |
4.2 算法描述 | 第41-46页 |
4.2.1 算法框架 | 第41页 |
4.2.2 算法步骤 | 第41-46页 |
4.3 实验结果及分析 | 第46-53页 |
4.3.1 实验数据 | 第46页 |
4.3.2 实验结果及分析 | 第46-53页 |
4.4 本章小结 | 第53-54页 |
结论 | 第54-56页 |
参考文献 | 第56-65页 |
附录A 攻读学位期间发表的学术论文 | 第65-66页 |
附录B 攻读学位期间参加的科研项目 | 第66-67页 |
致谢 | 第67页 |