| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-17页 |
| 1.1 原核生物热胁迫响应研究进展 | 第10-12页 |
| 1.1.1 生物应激概述 | 第10页 |
| 1.1.2 温度对原核生物生理的影响 | 第10-11页 |
| 1.1.3 原核生物热胁迫响应机制研究进展 | 第11-12页 |
| 1.2 转录组学概述 | 第12-13页 |
| 1.3 转录组学在原核生物胁迫（或热胁迫）响应研究中的应用 | 第13页 |
| 1.4 蛋白互作网络概述 | 第13-15页 |
| 1.5 蛋白互作网络在原核生物胁迫（或热胁迫）响应研究中的应用 | 第15-16页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-24页 |
| 2.1 实验材料 | 第17-18页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第17页 |
| 2.1.2 培养基 | 第17页 |
| 2.1.3 实验试剂与仪器设备 | 第17-18页 |
| 2.2 实验方法 | 第18-21页 |
| 2.2.1 大肠杆菌正常环境和热胁迫环境下生长曲线的测定 | 第18-19页 |
| 2.2.2 活菌计数 | 第19页 |
| 2.2.3 RNA样品的准备 | 第19-20页 |
| 2.2.4 总RNA的提取和质量检测 | 第20-21页 |
| 2.3 生物信息学分析方法 | 第21-24页 |
| 2.3.1 RNA-Seq数据获得及预处理 | 第21-22页 |
| 2.3.2 不同培养条件下差异表达基因的筛选 | 第22页 |
| 2.3.3 差异表达基因的GO功能富集分析及KEGG通路富集分析 | 第22页 |
| 2.3.4 差异表达基因蛋白互作网络的构建及分析 | 第22-23页 |
| 2.3.5 正常环境和热胁迫环境下蛋白互作网络的分析 | 第23-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-43页 |
| 3.1 实验结果 | 第24-28页 |
| 3.1.1 正常环境和热胁迫环境下的生长曲线 | 第24-25页 |
| 3.1.2 活菌计数 | 第25-26页 |
| 3.1.3 总RNA的质量检测 | 第26-28页 |
| 3.2 RNA-Seq数据分析 | 第28-35页 |
| 3.2.1 RNA-Seq数据初步处理 | 第28-29页 |
| 3.2.2 热胁迫环境下的差异表达基因 | 第29-31页 |
| 3.2.3 差异表达基因的GO功能富集分析 | 第31-34页 |
| 3.2.4 差异表达基因的KEGG通路富集分析 | 第34-35页 |
| 3.3 蛋白互作网络分析 | 第35-43页 |
| 3.3.1 差异表达基因蛋白互作网络的构建及拓扑属性分析 | 第35-36页 |
| 3.3.2 蛋白互作网络的枢纽蛋白和网络模块分析 | 第36-41页 |
| 3.3.3 正常环境和热胁迫环境下蛋白互作网络的分析比较 | 第41-43页 |
| 4、讨论与展望 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-50页 |
| 附录 | 第50-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
