摘要 | 第3-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
第1章 前言 | 第11-26页 |
1.1 研究背景 | 第11-24页 |
1.1.1 猪圆环病毒概述 | 第11页 |
1.1.2 猪圆环病毒的病原学 | 第11-12页 |
1.1.3 猪圆环病毒的基因和蛋白 | 第12-15页 |
1.1.4 猪圆环病毒的流行情况 | 第15-16页 |
1.1.5 猪圆环病毒2型的危害 | 第16-19页 |
1.1.6 密码子偏性分析 | 第19-20页 |
1.1.7 MicroRNA分析 | 第20-22页 |
1.1.8 猪抗病育种 | 第22-24页 |
1.2 研究目的和意义 | 第24-25页 |
1.3 研究技术路线 | 第25-26页 |
第2章 广东省猪群PCV2流行病学调查及PCV密码子偏向性分析 | 第26-59页 |
2.1 引言 | 第26页 |
2.2 材料和方法 | 第26-34页 |
2.2.1 材料 | 第26-28页 |
2.2.2 方法 | 第28-34页 |
2.3 结果 | 第34-58页 |
2.3.1 广东省猪群PCV2血清学调查结果 | 第34页 |
2.3.2 PCV2抗原检测结果 | 第34-35页 |
2.3.3 PCV2分离鉴定 | 第35-37页 |
2.3.4 PCV2分离株的序列分析 | 第37-42页 |
2.3.5 PCV2分离株ORF2基因核苷酸同源性分析 | 第42-51页 |
2.3.6 PCV密码子分析 | 第51-58页 |
2.4 小结 | 第58-59页 |
第3章 PCV2感染PK-15细胞前后microRNA的差异表达分析 | 第59-100页 |
3.1 引言 | 第59页 |
3.2 材料和方法 | 第59-67页 |
3.2.1 材料 | 第59-61页 |
3.2.2 方法 | 第61-67页 |
3.3 结果与分析 | 第67-99页 |
3.3.1 总RNA的质量检测 | 第67-68页 |
3.3.2 高通量测序和生物信息学分析 | 第68-99页 |
3.4 小结 | 第99-100页 |
第4章 全文讨论与结论 | 第100-111页 |
4.1 全文讨论 | 第100-108页 |
4.1.1 流行病学调查及密码子分析 | 第100-103页 |
4.1.2 microRNA差异表达分析 | 第103-108页 |
4.2 本文创新点 | 第108-110页 |
4.3 全文结论 | 第110-111页 |
致谢 | 第111-112页 |
参考文献 | 第112-122页 |
附录A: 分析密码子偏向性时使用的PCV毒株 | 第122-125页 |
附录B: 感染组和对照组已知miRNA的差异表达 | 第125-133页 |
附录C: 感染组和对照组新miRNA的差异表达 | 第133-137页 |
附录D: 上调miRNA的GO分析结果 | 第137-140页 |
附录E: 下调mi RNA的GO分析结果 | 第140-143页 |
附录F: 上调miRNA的KEGG分析结果 | 第143-144页 |
附录G: 下调miRNA的KEGG分析结果 | 第144-145页 |
附录H: 攻读博士期间发表文章 | 第145页 |