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猪圆环病毒2型遗传进化及影响PK15细胞microRNA差异表达的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第11-26页
    1.1 研究背景第11-24页
        1.1.1 猪圆环病毒概述第11页
        1.1.2 猪圆环病毒的病原学第11-12页
        1.1.3 猪圆环病毒的基因和蛋白第12-15页
        1.1.4 猪圆环病毒的流行情况第15-16页
        1.1.5 猪圆环病毒2型的危害第16-19页
        1.1.6 密码子偏性分析第19-20页
        1.1.7 MicroRNA分析第20-22页
        1.1.8 猪抗病育种第22-24页
    1.2 研究目的和意义第24-25页
    1.3 研究技术路线第25-26页
第2章 广东省猪群PCV2流行病学调查及PCV密码子偏向性分析第26-59页
    2.1 引言第26页
    2.2 材料和方法第26-34页
        2.2.1 材料第26-28页
        2.2.2 方法第28-34页
    2.3 结果第34-58页
        2.3.1 广东省猪群PCV2血清学调查结果第34页
        2.3.2 PCV2抗原检测结果第34-35页
        2.3.3 PCV2分离鉴定第35-37页
        2.3.4 PCV2分离株的序列分析第37-42页
        2.3.5 PCV2分离株ORF2基因核苷酸同源性分析第42-51页
        2.3.6 PCV密码子分析第51-58页
    2.4 小结第58-59页
第3章 PCV2感染PK-15细胞前后microRNA的差异表达分析第59-100页
    3.1 引言第59页
    3.2 材料和方法第59-67页
        3.2.1 材料第59-61页
        3.2.2 方法第61-67页
    3.3 结果与分析第67-99页
        3.3.1 总RNA的质量检测第67-68页
        3.3.2 高通量测序和生物信息学分析第68-99页
    3.4 小结第99-100页
第4章 全文讨论与结论第100-111页
    4.1 全文讨论第100-108页
        4.1.1 流行病学调查及密码子分析第100-103页
        4.1.2 microRNA差异表达分析第103-108页
    4.2 本文创新点第108-110页
    4.3 全文结论第110-111页
致谢第111-112页
参考文献第112-122页
附录A: 分析密码子偏向性时使用的PCV毒株第122-125页
附录B: 感染组和对照组已知miRNA的差异表达第125-133页
附录C: 感染组和对照组新miRNA的差异表达第133-137页
附录D: 上调miRNA的GO分析结果第137-140页
附录E: 下调mi RNA的GO分析结果第140-143页
附录F: 上调miRNA的KEGG分析结果第143-144页
附录G: 下调miRNA的KEGG分析结果第144-145页
附录H: 攻读博士期间发表文章第145页

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