| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 综述 | 第11-20页 |
| ·草菇概述 | 第11-12页 |
| ·草菇分类 | 第11页 |
| ·草菇的生物学特性 | 第11-12页 |
| ·草菇的营养价值 | 第12页 |
| ·淀粉酶概述 | 第12-15页 |
| ·淀粉酶分类 | 第12-13页 |
| ·淀粉酶的结构特点及分子大小 | 第13-14页 |
| ·影响淀粉酶活性的因素 | 第14页 |
| ·淀粉酶的应用 | 第14-15页 |
| ·荧光定量 PCR 概述 | 第15-18页 |
| ·荧光定量 PCR 的原理 | 第15页 |
| ·荧光定量 PCR 的种类 | 第15-17页 |
| ·荧光定量 PCR 的定量方法 | 第17-18页 |
| ·荧光定量技术的应用 | 第18页 |
| ·生物信息学的应用 | 第18-19页 |
| ·本课题研究的目的与意义 | 第19-20页 |
| 第二章 草菇淀粉酶基因结构分析 | 第20-33页 |
| ·实验材料 | 第20页 |
| ·实验方法 | 第20页 |
| ·基因去冗余 | 第20页 |
| ·内含子与外显子的确定 | 第20页 |
| ·构建进化树 | 第20页 |
| ·实验结果 | 第20-32页 |
| ·淀粉酶基因的确定 | 第20-22页 |
| ·淀粉酶基因基因结构分析 | 第22-30页 |
| ·进化树构建 | 第30-32页 |
| ·小结与讨论 | 第32-33页 |
| 第三章 淀粉酶生物信息学分析 | 第33-48页 |
| ·实验材料 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-34页 |
| ·实验结果 | 第34-46页 |
| ·基本理化性质预测和分析 | 第34-35页 |
| ·信号肽分析 | 第35-38页 |
| ·亚细胞定位和跨膜结构预测 | 第38-40页 |
| ·淀粉酶磷酸化位点预测 | 第40-42页 |
| ·其它功能位点预测 | 第42-43页 |
| ·淀粉酶蛋白的保守结构域 | 第43-44页 |
| ·蛋白二级结构预测 | 第44-45页 |
| ·三维结构预测与分析 | 第45-46页 |
| ·小结与讨论 | 第46-48页 |
| 第四章 荧光定量 PCR 分析淀粉酶基因的差异表达 | 第48-62页 |
| ·实验材料 | 第48-49页 |
| ·准备工作 | 第48页 |
| ·主要实验试剂及耗材 | 第48-49页 |
| ·内参基因及引物 | 第49页 |
| ·实验方法 | 第49-51页 |
| ·RNA 提取操作步骤 | 第49页 |
| ·去基因组 DNA | 第49页 |
| ·RNA 质量的检测 | 第49-50页 |
| ·RT-PCR 反应 | 第50页 |
| ·定量 PCR 反应 | 第50-51页 |
| ·实验结果与分析 | 第51-60页 |
| ·RNA 的提取及纯化 | 第51页 |
| ·RT-PCR | 第51页 |
| ·引物特异性分析 | 第51-56页 |
| ·定量 PCR | 第56页 |
| ·目标基因和内参扩增效率一致性检测 | 第56-59页 |
| ·结果与分析 | 第59-60页 |
| ·小结与讨论 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-69页 |
| 附录 | 第69-76页 |
| 附录 1 RNA 提取方法 | 第69-70页 |
| 附录 2 基因组 DNA 的去除方法 | 第70页 |
| 附录 3 内参基因和 8 个淀粉酶基因在制作标准曲线时的扩增曲线图 | 第70-73页 |
| 附录 4 NCBI 网站预测淀粉酶基因的保守结构域的结果 | 第73-75页 |
| 附录 5 淀粉和蔗糖代谢通路（KEGG,map00500） | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
