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猪皮下和内脏脂肪组织microRNA转录组的鉴定与差异表达分析

摘要第1-7页
Abstract第7-10页
高频词对照表第10-15页
第一章 文献综述第15-44页
 第一节 脂肪组织的新认识第15-18页
   ·脂肪组织的分类第16-17页
   ·脂肪组织——重要的内分泌器官第17-18页
 第二节 不同部位脂肪组织与代谢疾病的关系第18-23页
   ·皮下脂肪与内脏脂肪在生理代谢上的差异第20-21页
   ·皮下脂肪和内脏脂肪与代谢疾病的关系第21-22页
   ·脂肪细胞因子的组织表达特异性第22-23页
 第三节 miRNA与脂肪沉积第23-34页
   ·miRNA简述第23页
   ·miRNA的生成及调控机制第23-24页
   ·miRNAs与肥胖的关系第24-25页
   ·miRNAs在脂肪生成中的角色第25-33页
   ·肥胖引起的miRNAs异常表达第33-34页
 第四节 miRNAs调控的脂肪细胞生物学过程第34-40页
   ·miRNAs与脂肪细胞的分化第34-37页
   ·miRNAs调控多能干细胞甘油三酯的沉积第37-38页
   ·miRNA调节脂肪细胞分化的分子途径第38-40页
 第五节 调控miRNAs表达的因素第40-41页
   ·细胞因子第40页
   ·葡萄糖第40-41页
   ·高脂饮食第41页
 第六节 脂肪组织miRNA表达谱研究的重要性第41-44页
第二章 本研究选题背景与目的意义第44-46页
 第一节 选题背景第44-45页
 第二节 主要研究内容及目的意义第45-46页
第三章 不同部位脂肪组织表型差异分析第46-57页
 第一节 前言第46-47页
 第二节 材料方法第47-53页
   ·实验动物第47-48页
   ·试剂与仪器第48-49页
   ·脂肪细胞体积测定第49-50页
   ·脂肪组织中炎症相关基因的表达量第50-52页
   ·结果统计第52-53页
 第三节 结果分析第53-55页
   ·脂肪组织石蜡切片第53页
   ·脂肪细胞体积测定第53-54页
   ·脂肪组织炎症相关基因定量第54-55页
 第四节 讨论第55-57页
   ·猪作为模式动物研究的重要性第55页
   ·不同部位猪脂肪细胞的体积差异第55-56页
   ·炎症相关因子与脂肪沉积第56-57页
第四章 不同部位脂肪组织miRNAs文库构建第57-72页
 第一节 前言第57-59页
 第二节 材料与方法第59-64页
   ·实验材料第59页
   ·实验试剂与仪器第59-60页
   ·实验方法第60-64页
 第三节 结果与分析第64-70页
   ·总RNA质检结果第64-65页
   ·测序数据特征第65-70页
 第四节 讨论第70-72页
   ·miRNA-seq的优点第70-71页
   ·脂肪组织small RNA文库特征分析第71-72页
第五章 不同部位脂肪组织miRNAs表达谱特征第72-83页
 第一节 前言第72-74页
 第二节 材料方法第74-76页
   ·数据来源第74-75页
   ·参考数据库第75页
   ·方法步骤第75-76页
 第三节 结果与分析第76-81页
   ·miRNAs变异体第76-77页
   ·miRNA分类及命名第77-78页
   ·miRNAs文库分组差异比较第78-81页
 第四节 讨论第81-83页
   ·基于高通量测序技术的miRNA研究第81页
   ·脂肪组织miRNAs文库表达谱特征第81-83页
第六章 皮下与内脏脂肪miRNA表达谱差异分析第83-100页
 第一节 前言第83-84页
 第二节 方法步骤第84-85页
   ·分析方法第84-85页
   ·分析软件第85页
 第三节 结果第85-97页
   ·文库间miRNAs表达个数差异第85-87页
   ·文库高丰度miRNA的分析第87-88页
   ·miRNA的组织表达模式归类第88-90页
   ·共表达miRNAs的聚类研究第90-94页
   ·SATs与VATs差异表达miRNAs第94-97页
 第四节 讨论第97-100页
   ·不同部位脂肪组织miRNAs的表达数量差异第97-98页
   ·猪脂肪组织miRNAs聚类分析第98页
   ·高丰度差异miRNAs的种类第98-100页
第七章 皮下与内脏脂肪差异表达miRNAs的生物信息学分析第100-125页
 第一节 前言第100-101页
 第二节 分析策略及方法第101-102页
   ·miRNA靶基因预测第101页
   ·miRNA靶基因GO(Gene Ontology)分析第101页
   ·miRNA靶基因Pathway分析第101-102页
 第三节 结果第102-121页
   ·差异表达miRNA的相似性比较第102-103页
   ·差异表达miRNAs的靶基因预测第103-104页
   ·GO和Pathway term分类结果第104-106页
   ·皮下脂肪与内脏脂肪差异表达miRNAs的Pathway映射第106-121页
 第四节 讨论第121-125页
   ·皮下脂肪中高表达的miRNAs与脂肪代谢密切相关第121-122页
   ·内脏脂肪中高表达的miRNAs的生物学功能分析第122-123页
   ·皮下脂肪与内脏脂肪的生物学功能差异第123-125页
第八章 结论第125-126页
参考文献第126-147页
致谢第147-148页
附件第148-211页
 附件1 鉴定的Unique miRNA总表第148-166页
 附件2 miRNAs组织表达模式归类总表第166-201页
 附件3 差异表达miRNAs总表第201-204页
 附件4 富集的GO和Pathway总表(p<0.05)第204-211页
博士在读期间发表论文情况第211页

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