| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-36页 |
| ·前言 | 第14页 |
| ·生物信息学——分子信息挖掘 | 第14-15页 |
| ·功能基因组生物信息的挖掘 | 第15-19页 |
| ·基因图谱的构建研究概况 | 第15-17页 |
| ·QTL 定位的研究进展 | 第17-19页 |
| ·基因聚合育种原理和在作物育种中的应用 | 第19-21页 |
| ·基因聚合设计育种与其应用条件 | 第19-20页 |
| ·植物基因聚合育种的研究进展 | 第20页 |
| ·植物中的基因聚合模拟育种 | 第20-21页 |
| ·基因聚合研究视角与理论方法 | 第21-24页 |
| ·多基因结构聚合与理论基础 | 第21-23页 |
| ·多基因功能聚合 | 第23-24页 |
| ·生物信息整合利用——工程学、设计、优化 | 第24-34页 |
| ·工程学——设计 | 第24-26页 |
| ·设计——分子设计在各学科的应用 | 第26-27页 |
| ·设计之核心——优化 | 第27-29页 |
| ·智能优化方法之遗传算法 | 第29-31页 |
| ·基于优化理论的基因聚合 | 第31-32页 |
| ·多基因聚合由科学向工程学的跃迁 | 第32-34页 |
| ·研究目的意义与本研究主要内容 | 第34-36页 |
| ·本研究的意义 | 第34页 |
| ·本研究的主要内容 | 第34-36页 |
| 第二章 混合群体中标记辅助选择基因聚合优化设计 | 第36-50页 |
| ·前言 | 第36-37页 |
| ·材料与方法 | 第37-40页 |
| ·个体基因型和群体基因型模拟 | 第37页 |
| ·基因型选择与表型选择策略 | 第37-38页 |
| ·优势基因型频率和群体的海明距离 | 第38-39页 |
| ·固定步骤的基因聚合 | 第39-40页 |
| ·结果 | 第40-49页 |
| ·基因型选择聚合不同数目的目标基因 | 第40-41页 |
| ·表型选择策略 | 第41-49页 |
| ·讨论 | 第49-50页 |
| ·基因型选择策略 | 第49-50页 |
| ·表型选择运用简单基因型-表型模型和整合模型 | 第50页 |
| 第三章 杂交群体中标记辅助基因聚合优化设计 | 第50-65页 |
| ·前言 | 第50-51页 |
| ·理论方法 | 第51-54页 |
| ·基因聚合育种概念 | 第51-52页 |
| ·群体与个体基因型的模拟 | 第52页 |
| ·基因型选择与表型选择策略 | 第52-53页 |
| ·杂交方案与聚合设计育种 | 第53-54页 |
| ·实验结果 | 第54-63页 |
| ·基因型选择聚合基因 | 第54-58页 |
| ·表型选择基因聚合 | 第58-63页 |
| ·基因型和表型选择策略的平均表型进展 | 第63页 |
| ·讨论 | 第63-65页 |
| ·基因型选择聚合两个、三个、四个基因 | 第63-64页 |
| ·不同杂交方案的基因聚合 | 第64页 |
| ·基于进化的基因聚合育种研究 | 第64-65页 |
| 第四章 AGPBSimu——动物基因聚合育种模拟平台 | 第65-87页 |
| ·MATLAB 语言简介 | 第65-66页 |
| ·MATLAB 特点与优势 | 第66-68页 |
| ·工作平台友好与编程环境高效 | 第66页 |
| ·程序语言简单易用 | 第66页 |
| ·科学计算与数据处理功能强大 | 第66-67页 |
| ·绘图功能便捷和图形处理功能出色 | 第67页 |
| ·应用广泛功能强大的工具箱 | 第67页 |
| ·移植性好，开放性好，扩充能力强，交互性好 | 第67-68页 |
| ·MATLAB 工具箱 | 第68-69页 |
| ·MATLAB GUI（Graphical User Interface） | 第69-75页 |
| ·MATLAB GUI 简述 | 第69页 |
| ·MATLAB GUI 设计原则 | 第69-70页 |
| ·AGPSim 设计步骤 | 第70-75页 |
| ·AGPBSimu——杂交群体基因聚合模拟 | 第75-80页 |
| ·设计目标 | 第75-76页 |
| ·软件设计流程图 | 第76页 |
| ·模块简介 | 第76-80页 |
| ·AGPBSimu——混合群体单性状基因聚合育种模拟 | 第80-83页 |
| ·主要内容 | 第80页 |
| ·设计目标 | 第80-81页 |
| ·设计框架 | 第81页 |
| ·模块简介 | 第81-82页 |
| ·操作界面 | 第82-83页 |
| ·AGPBSimu——混合群体多性状基因聚合育种模拟 | 第83-87页 |
| ·主要内容 | 第83页 |
| ·设计目标 | 第83-84页 |
| ·设计框架 | 第84页 |
| ·多性状基因聚合模拟育种 | 第84-85页 |
| ·模块简介 | 第85-86页 |
| ·操作界面 | 第86-87页 |
| 第五章 全文讨论与展望 | 第87-94页 |
| ·基于进化计算的模拟 | 第87页 |
| ·基因聚合优化育种设计 | 第87-88页 |
| ·分子标记聚合育种技术存在问题 | 第88-90页 |
| ·模拟平台建设——理论、信息数据库、模拟技术 | 第90-92页 |
| ·聚合理论的探索 | 第90页 |
| ·从生物信息数据库到知识库 | 第90-91页 |
| ·模拟技术与互联网 | 第91-92页 |
| ·设计育种与虚拟化育种 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 作者简历 | 第104-105页 |
