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抑制差减杂交技术筛选副猪嗜血杆菌SH0165株特异性基因及部分功能基因初步分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略语表第11-12页
1 文献综述第12-22页
   ·副猪嗜血杆菌研究进展第12-18页
     ·病原学与流行病学第12-13页
     ·致病机理与毒力因子研究进展第13-16页
       ·神经氨酸酶第14页
       ·外膜蛋白第14页
       ·转铁结合蛋白第14页
       ·生物被膜第14-15页
       ·DDRT-PCR筛选Hps毒力因子第15页
       ·基因芯片分析Hps适应宿主时表达的与毒力相关基因第15页
       ·SCOTS筛选Hps体内感染后的上调表达基因第15-16页
       ·RDA筛选Hps地方株毒力相关因子第16页
       ·全基因组测序第16页
     ·诊断方法与防治第16-18页
       ·细菌分离鉴定第16-17页
       ·血清学诊断方法第17页
       ·PCR诊断第17页
       ·防治第17-18页
   ·抑制差减杂交技术概述第18-22页
     ·多种差异显示技术第18页
     ·抑制差减杂交技术原理第18-20页
     ·抑制差减杂交技术的应用第20-21页
       ·在真核生物中的应用第20页
       ·在原核生物上的应用第20-21页
     ·抑制差减杂交的注意事项及优缺点第21-22页
2 研究目的与意义第22-23页
3 材料与方法第23-37页
   ·实验材料第23-26页
     ·菌株第23页
     ·载体与质粒第23页
     ·主要试剂第23页
     ·培养基及缓冲液配制第23-24页
     ·研究所用引物第24-26页
   ·方法第26-37页
     ·细菌基因组的提取(CTAB法)第26页
     ·酶切第26页
     ·抑制差减杂交第26-32页
     ·文库构建第32页
     ·探针制备第32页
     ·Southern blot第32-33页
     ·质粒的小量制备与检测第33-34页
     ·铁限制及氨基酸饥饿条件下Hps的培养第34页
     ·RNA提取第34-35页
     ·反转录cDNA第一链的合成第35页
     ·荧光定量PCR第35-36页
     ·PCR检测差异片段在标准株和地方分离株中出现频率第36页
     ·检测HC16(toxin-antitxin stability system)过量表达时对菌体的影响第36-37页
4 结果与分析第37-47页
   ·基因组提取第37页
   ·基因组的酶切第37页
   ·接头连接第37-39页
   ·抑制差减杂交第39页
   ·差减杂交效率检测第39页
   ·差减文库的筛选第39-41页
   ·特异性片段的测序及生物信息学分析第41-43页
   ·特异性片段在标准株及分离株中出现频率检测第43-44页
   ·铁限制及氨基酸饥饿条件下细菌RNA提取第44页
   ·HC36在铁限制条件下的转录第44页
   ·HC16在氨基酸饥饿条件下的转录第44-45页
   ·HC16(toxin-antitoxin stability system)过量表达对菌体的影响第45-47页
5 讨论第47-51页
   ·SSH技术在筛选Hps基因中的优化第47页
   ·差异片段同源性分析第47-48页
   ·片段HC36功能初步鉴定第48页
   ·片段HC16功能初步鉴定第48-49页
   ·部分片段功能推测第49-50页
   ·差异片段在标准株及地方分离株中出现频率第50-51页
6 结论第51-52页
参考文献第52-59页
致谢第59-60页
附录第60页

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