摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-7页 |
第一章 引言 | 第7-25页 |
·蛋白质晶体学的历史 | 第7-8页 |
·蛋白质X射线晶体结构测定的基本过程 | 第8-12页 |
·蛋白质结晶和晶体生长(sample preparation through crystallization) | 第8-9页 |
·衍射数据的收集(diffraction data collection) | 第9-10页 |
·相位测定(Phasing) | 第10页 |
·电子密度修饰(Density Modification) | 第10-11页 |
·建模与修正(model building and refinement) | 第11-12页 |
·常用蛋白质晶体学结构分析方法介绍 | 第12-25页 |
·从头推定法 | 第12-13页 |
·同晶置换法(Isomorphous Replacement) | 第13-15页 |
·反常散射法(Anomalous Dispersion) | 第15-19页 |
·分子置换法(Molecular Replacement) | 第19-25页 |
第二章 直接法相位模糊破解 | 第25-43页 |
·相位模糊问题 | 第25-27页 |
·破解相位模糊问题的几种方法 | 第27-30页 |
·使用平均相位 | 第27-28页 |
·利用重原子Sim分布 | 第28-29页 |
·溶剂平滑法(solvent flattening) | 第29页 |
·利用直接法 | 第29-30页 |
·直接法P+概率公式 | 第30-43页 |
·双峰概率分布的拟合 | 第30-35页 |
·P+公式的推导 | 第35-39页 |
·双空间迭代 | 第39-40页 |
·直接法在分子置换法中的应用 | 第40-42页 |
·OASIS程序的算法发展 | 第42-43页 |
第三章 单波长反常散射/单对同晶置换与分子置换法相结合 | 第43-51页 |
·MRSAD | 第43-44页 |
·一种新的SAD/SIR方法与MR相结合的方法 | 第44-51页 |
·实验数据 | 第45页 |
·实验过程 | 第45-46页 |
·实验结果 | 第46-51页 |
第四章 基于OASIS的蛋白质X射线晶体解析自动化 | 第51-77页 |
·蛋白质X射线晶体解析的发展及现状 | 第51-60页 |
·基于单机的蛋白质X射线晶体解析自动化程序 | 第52-56页 |
·基于网络的蛋白质X射线晶体解析服务器 | 第56-60页 |
·OASIS自动化的发展 | 第60-77页 |
·基于CCP4i的OASIS2006图形界面 | 第60-63页 |
·OASIS4.0的图形界面以及自动化控制程序 | 第63-73页 |
·OASIS自动化控制程序的新进展 | 第73-76页 |
·OASIS自动化进一步发展的设想 | 第76-77页 |
参考文献 | 第77-86页 |
发表文章目录 | 第86-87页 |
附录A 最大似然法及其在蛋白质晶体学中的应用 | 第87-91页 |
致谢 | 第91-92页 |