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ReaxFF MD模拟结果的化学反应网络自动构建及可视化

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
符号表第14-15页
缩略词/术语表第15-17页
第1章 引言第17-35页
    1.1 分子模拟方法简介第17-18页
    1.2 反应分子动力学ReaxFF MD第18-20页
    1.3 ReaxFF MD模拟结果分析工具研究现状第20-27页
        1.3.1 LAMMPS第22-24页
        1.3.2 ADF第24-26页
        1.3.3 Materials Studio第26-27页
        1.3.4 MAPS第27页
    1.4 VARxMD介绍第27-31页
        1.4.1 VARxMD现有功能介绍第27-30页
        1.4.2 VARxMD相关技术概述第30-31页
    1.5 图的遍历搜索算法第31-32页
    1.6 图布局算法第32-33页
    1.7 本论文的主要目标和研究内容第33-35页
第2章 化学反应网络的构建策略第35-43页
    2.1 基于反应列表构建化学反应网络第36-40页
        2.1.1 指定反应路径搜索目标第37页
        2.1.2 构建化学反应索引表第37-38页
        2.1.3 反应路径搜索的剪枝策略第38-39页
        2.1.4 基于反应列表的宽度优先反应路径搜索算法第39-40页
    2.2 基于原子搜索和构建反应网络思路第40-41页
    2.3 两种策略的对比第41-42页
    2.4 本章小结第42-43页
第3章 基于原子搜索和构建化学反应网络的方法第43-61页
    3.1 基本思路第43-44页
    3.2 原子集合的获取第44-45页
    3.3 反应路径的识别第45-53页
        3.3.1 搜索原子/化学键的反应路径第46-48页
        3.3.2 搜索分子对之间/分子的反应路径第48-51页
        3.3.3 搜索物种的反应路径第51-53页
    3.4 基于物种合并化学反应网络第53-55页
    3.5 化学反应网络的可视化第55-60页
        3.5.1 有向图布局算法第56-57页
        3.5.2 化学反应网络图可视化的实现策略第57-59页
        3.5.3 化学反应网络图的交互功能实现第59-60页
    3.6 本章小结第60-61页
第4章 化学反应网络搜索在ReaxFF MD模拟结果分析中的应用第61-73页
    4.1 功能概述第61-62页
    4.2 在复杂体系模拟分析中的应用第62-71页
        4.2.1 应用于含能材料热解体系第62-68页
        4.2.2 应用于航空煤油热解体系第68-71页
    4.3 本章小结第71-73页
第5章 结论与展望第73-75页
    5.1 结论第73-74页
    5.2 展望第74-75页
参考文献第75-79页
致谢第79-81页
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第81页

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