| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第1章 绪论 | 第12-26页 |
| 1.1 雨生红球藻虾青素的生物合成 | 第12-15页 |
| 1.1.1 雨生红球藻的简介 | 第12页 |
| 1.1.2 虾青素的生物合成 | 第12-14页 |
| 1.1.3 雨生红球藻虾青素合成与油脂代谢的关系 | 第14-15页 |
| 1.2 雨生红球藻虾青素合成调控的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3 miRNA概述 | 第16-19页 |
| 1.3.1 miRNA的发生 | 第16-17页 |
| 1.3.2 miRNA的作用机制 | 第17页 |
| 1.3.3 miRNA的功能研究 | 第17-19页 |
| 1.3.4 微藻miRNA的研究进展 | 第19页 |
| 1.4 高通量测序简介 | 第19-23页 |
| 1.4.1 转录组测序概述 | 第20-21页 |
| 1.4.2 小RNA(SmallRNA)测序概述 | 第21-22页 |
| 1.4.3 多组学联合分析 | 第22-23页 |
| 1.5 miRNA-TF共调控网络 | 第23-24页 |
| 1.5.1 转录因子简介 | 第23页 |
| 1.5.2 miRNA-TF共调控网络研究进展 | 第23-24页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 1.6.1 研究的目的 | 第24-25页 |
| 1.6.2 研究的意义 | 第25-26页 |
| 第2章 雨生红球藻胁迫初期的小RNA组学研究 | 第26-49页 |
| 2.1 实验材料 | 第26-27页 |
| 2.1.1 实验藻株 | 第26页 |
| 2.1.2 实验试剂及培养基 | 第26页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第26-27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-35页 |
| 2.2.1 样品处理及制备 | 第27-28页 |
| 2.2.2 雨生红球藻192.80小RNA文库构建及高通量测序 | 第28-29页 |
| 2.2.3 雨生红球藻192.80小RNA测序数据分析 | 第29-33页 |
| 2.2.4 雨生红球藻胁迫初期转录组和小RNA联合分析 | 第33-35页 |
| 2.3 实验结果 | 第35-47页 |
| 2.3.1 测序数据统计 | 第35-36页 |
| 2.3.2 miRNA的鉴定 | 第36-38页 |
| 2.3.3 差异表达miRNA 的分析 | 第38-40页 |
| 2.3.4 差异miRNA 靶基因的预测及分析 | 第40-43页 |
| 2.3.5 获取表达量负相关的miRNA-靶基因对 | 第43-47页 |
| 2.4 本章讨论 | 第47-49页 |
| 2.4.1 雨生红球藻小RNA长度分布特点 | 第47页 |
| 2.4.2 miRNA的鉴定及家族分析 | 第47-48页 |
| 2.4.3 差异表达miRNA及其靶基因分析 | 第48-49页 |
| 第3章 qRT-PCR验证差异表达的miRNA及其靶基因 | 第49-66页 |
| 3.1 实验材料 | 第49页 |
| 3.1.1 实验藻株 | 第49页 |
| 3.1.2 实验试剂及培养基 | 第49页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第49页 |
| 3.2 实验方法 | 第49-55页 |
| 3.2.1 样品的处理 | 第49页 |
| 3.2.2 雨生红球藻小RNA提取方法的研究 | 第49-51页 |
| 3.2.3 雨生红球藻小RNA的反转录 | 第51-52页 |
| 3.2.4 雨生红球藻miRNA的qRT-PCR实验 | 第52-54页 |
| 3.2.5 miRNA靶基因验证 | 第54-55页 |
| 3.3 实验结果 | 第55-63页 |
| 3.3.1 两种雨生红球藻小RNA提取方法的比较 | 第55-56页 |
| 3.3.2 获得雨生红球藻miRNAqRT-PCR实验的最佳内参 | 第56-57页 |
| 3.3.3 差异miRNA的qRT-PCR实验结果 | 第57-61页 |
| 3.3.4 miRNA靶基因的qRT-PCR实验结果 | 第61-63页 |
| 3.4 本章讨论 | 第63-66页 |
| 3.4.1 雨生红球藻小RNA的提取 | 第63-64页 |
| 3.4.2 qRT-PCR实验内参的选择 | 第64页 |
| 3.4.3 差异miRNAqRT-PCR实验 | 第64-65页 |
| 3.4.4 差异miRNA的靶基因验证 | 第65-66页 |
| 第4章 雨生红球藻共调控网络的构建与分析 | 第66-85页 |
| 4.1 实验数据 | 第66页 |
| 4.2 实验方法 | 第66-67页 |
| 4.2.1 虾青素及TAG合成途径关键酶基因的发现及表达分析 | 第66页 |
| 4.2.2 转录因子调控网络构建 | 第66-67页 |
| 4.2.3 miRNA-TF共调控网络构建 | 第67页 |
| 4.3 实验结果 | 第67-82页 |
| 4.3.1 关键酶基因的获得 | 第67-69页 |
| 4.3.2 关键酶基因的表达分析 | 第69-73页 |
| 4.3.3 雨生红球藻转录因子的预测结果 | 第73-76页 |
| 4.3.4 转录因子调控网络的构建 | 第76-80页 |
| 4.3.5 mi RNA-TF 共调控网络构建 | 第80-82页 |
| 4.4 本章讨论 | 第82-85页 |
| 4.4.1 关键酶基因的获取及表达分析 | 第82-83页 |
| 4.4.2 调控网络的分析 | 第83-85页 |
| 第5章 结论与展望 | 第85-87页 |
| 5.1 结论 | 第85-86页 |
| 5.2 展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-92页 |
| 附录 | 第92-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第97页 |
