| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 第一篇 文献综述 | 第13-49页 |
| 第一章 尿路致病性大肠杆菌及其致病机理 | 第13-25页 |
| 1 简述 | 第13-14页 |
| 2 尿路致病性大肠杆菌的致病过程及其毒力相关因子 | 第14-25页 |
| 2.1 尿路致病性大肠杆菌致病过程概述 | 第14页 |
| 2.2 粘附素 | 第14-18页 |
| 2.3 毒素蛋白 | 第18页 |
| 2.4 摄铁系统 | 第18-21页 |
| 2.5 宿主对尿路致病性大肠杆菌的反应 | 第21-23页 |
| 2.6 尿路感染的传播、治疗和防控 | 第23-25页 |
| 第二章 二元调控系统在病原菌中的作用 | 第25-33页 |
| 1 二元调控系统简述 | 第25-26页 |
| 2 二元调控系统影响病原菌的毒力相关因子 | 第26-27页 |
| 3 二元调控系统影响细菌的抗药性和生长增殖 | 第27-28页 |
| 4 波氏菌中非典型的二元调控系统对毒力的调控 | 第28页 |
| 5 二元调控系统作为靶标开发新的抗菌药物 | 第28-33页 |
| 第三章 细菌的MFS和DASS家族转运蛋白 | 第33-49页 |
| 1 MFS家族转运蛋白 | 第33-35页 |
| 1.1 结构特征 | 第33-34页 |
| 1.2 转运机制 | 第34-35页 |
| 2 DASS家族转运蛋白 | 第35-37页 |
| 参考文献 | 第37-49页 |
| 第二篇 试验研究 | 第49-123页 |
| 第四章 新型二元调控系统KguSR调控尿路致病性大肠杆菌利用宿主体内代谢物的机制 | 第49-83页 |
| 1 材料与方法 | 第50-62页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第50-52页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第52页 |
| 1.3 生物信息学预测二元调控系统 | 第52页 |
| 1.4 缺失突变株的构建 | 第52-53页 |
| 1.5 互补菌株的构建 | 第53页 |
| 1.6 生长曲线的测定 | 第53页 |
| 1.7 小鼠尿路感染模型 | 第53-54页 |
| 1.8 双重PCR鉴定基因型 | 第54页 |
| 1.9 缺失突变株生长特性的描述 | 第54页 |
| 1.10 差异二维蛋白电泳鉴定靶基因 | 第54-56页 |
| 1.11 实时荧光定量PCR检测基因转录水平 | 第56页 |
| 1.12 反转录-PCR检测操纵元的形成 | 第56页 |
| 1.13 双亲接合构建lacZ融合菌株 | 第56-57页 |
| 1.14 MBP-C5040-His_6融合蛋白的超量表达与纯化 | 第57-58页 |
| 1.15 凝胶阻滞实验(EMSA) | 第58-62页 |
| 2 结果 | 第62-77页 |
| 2.1 UPEC str. CFT073中二元调控系统的预测 | 第62-63页 |
| 2.2 C5041/C5040编码一个新的二元调控系统 | 第63-64页 |
| 2.3 在尿路感染的动物模型上,c5041和c5040显著提高CFT073在体内的适应性 | 第64-66页 |
| 2.4 利用差异蛋白组学(2D-DIGE)鉴定C5041/C5040的靶基因 | 第66-68页 |
| 2.5 C5041/C5040调控靶基因岛影响细菌在体内的适应性 | 第68-70页 |
| 2.6 基因岛基因c5032-5039参与无氧条件下α-KG的利用 | 第70-71页 |
| 2.7 无氧条件下C5040直接调控c5032-5039的表达并且参与α-KG的利用 | 第71-74页 |
| 2.8 无氧条件下C5041对c5032-5039表达的调控及对利用α-KG的影响 | 第74-75页 |
| 2.9 KguS(C5041)的遗传发育分析 | 第75-77页 |
| 3 讨论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-83页 |
| 第五章 尿路致病性大肠杆菌利用α-酮戊二酸的转运蛋白C5038和KgtP的转录调控的研究 | 第83-109页 |
| 1 材料与方法 | 第84-89页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第84页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第84页 |
| 1.3 遗传发育树的构建 | 第84-85页 |
| 1.4 突变株、质粒载体和重组质粒的构建 | 第85-86页 |
| 1.5 β-半乳糖苷酶活性的测定 | 第86页 |
| 1.6 蛋白纯化和凝胶阻滞试验 | 第86-87页 |
| 1.7 生长参数的测定 | 第87页 |
| 1.8 小鼠尿路感染模型 | 第87-88页 |
| 1.9 实时荧光定量PCR检测基因转录水平 | 第88页 |
| 1.10 5'-RACE PCR方法鉴定转录起始位点 | 第88页 |
| 1.11 统计分析 | 第88-89页 |
| 2 结果 | 第89-101页 |
| 2.1 C5038和KgtP的序列及遗传发育分析 | 第89-91页 |
| 2.2 在不同的氧分压下,C5038和KgtP对KG的利用发挥的作用不同 | 第91-92页 |
| 2.3 低氧分压诱导c5038却抑制kgtP表达 | 第92-93页 |
| 2.4 FNR和ArcA诱导c5038但却抑制kgtP表达 | 第93-96页 |
| 2.5 c5038通过二元系统KguSR(C5041/C5040)感应低氧分压 | 第96页 |
| 2.6 c5038和kgtP在不同培养基和环境中的表达以及CRP的调控作用 | 第96-97页 |
| 2.7 c5038和kgtP受不同的Sigma因子控制 | 第97-99页 |
| 2.8 C5038无氧下工作效率更高而KgtP有氧下工作效率更高 | 第99-100页 |
| 2.9 c5038和kgtP对UPEC体内适应性的影响 | 第100-101页 |
| 3 讨论 | 第101-104页 |
| 参考文献 | 第104-109页 |
| 第六章 二元调控系统响应蛋白KguR调控的分子机理初探 | 第109-123页 |
| 1 材料与方法 | 第110-112页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第110页 |
| 1.2 试剂与仪器 | 第110页 |
| 1.3 突变株、质粒载体和重组质粒的构建 | 第110-111页 |
| 1.4 β-半乳糖苷酶活性的测定 | 第111页 |
| 1.5 蛋白纯化和凝胶阻滞试验 | 第111-112页 |
| 1.6 统计分析 | 第112页 |
| 2 结果 | 第112-118页 |
| 2.1 KguR结合位点的鉴定 | 第112-113页 |
| 2.2 KguR对其它基因的调控 | 第113-118页 |
| 3 讨论 | 第118-121页 |
| 参考文献 | 第121-123页 |
| 全文总结 | 第123-125页 |
| 攻读博士期间发表的文章 | 第125-127页 |
| 致谢 | 第127页 |
