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山葡萄果皮转录组测序及PAL基因的克隆与表达分析

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 前言第11-18页
    1.1 山葡萄简介第11页
    1.2 花色苷概要第11-14页
        1.2.1 花色苷结构及种类第12页
        1.2.2 花色苷合成途径第12-14页
    1.3 高通量测序技术及其应用第14-16页
        1.3.1 高通量测序技术的发展第14-15页
        1.3.2 高通量测序技术的应用第15-16页
    1.4 苯丙氨酸解氨酶(PAL)第16-17页
    1.5 研究的目的与意义第17-18页
第二章 山葡萄不同着色时期果皮转录组测序分析第18-29页
    2.1 材料与方法第18-19页
        2.1.1 植物材料第18页
        2.1.2 试验方法第18-19页
    2.2 结果与分析第19-29页
        2.2.1 测序数据产出统计第19页
        2.2.2 转录组数据与参考序列的比对第19-20页
        2.2.3 SNP/InDel分析第20-21页
        2.2.4 可变剪切事件数量统计第21-22页
        2.2.5 差异基因表达分析第22页
        2.2.6 差异表达基因GO分类第22-24页
        2.2.7 差异表达基因COG分类第24-26页
        2.2.8 差异表达基因KEGG通路富集分析第26-28页
        2.2.9 苯丙烷类生物合成途径中的差异基因的筛选第28-29页
第三章 山葡萄苯丙氨酸解氨酶基因(VamPAL)的克隆与分析第29-40页
    3.1 材料与方法第29-33页
        3.1.1 植物材料第29-30页
            3.1.1.1 菌株、酶及生化试剂第29-30页
        3.1.2 试验方法第30-33页
    3.2 结果与分析第33-40页
        3.2.1 DNA提取结果与检测第33-34页
        3.2.2 VamPAL基因全长的克隆与分析第34页
        3.2.3 VamPAL基因编码蛋白质理化性状分析第34页
        3.2.4 VamPAL基因编码蛋白保守区预测第34-35页
        3.2.5 VamPAL基因编码蛋白的亲水性分析第35-36页
        3.2.6 VamPAL基因编码蛋白的跨膜结构域分析第36页
        3.2.7 VamPAL基因编码蛋白的信号肽预测第36-37页
        3.2.8 VamPAL基因编码蛋白的二级结构和三级结构预测第37页
        3.2.9 VamPAL基因的细胞定位分析第37-38页
        3.2.10 VamPAL基因编码蛋白质的同源性及进化分析第38-40页
第四章 山葡萄着色过程中VamPAL的定量分析第40-47页
    4.1 材料与方法第40-43页
        4.1.1 试验材料第40页
        4.1.2 主要试剂第40页
        4.1.3 主要仪器与设备第40页
        4.1.4 试验方法第40-43页
    4.2 结果与分析第43-47页
        4.2.1 RNA的提取第43页
        4.2.2 实时荧光定量PCR引物的常规PCR扩增第43页
        4.2.3 实时荧光定量PCR标准曲线的绘制第43-46页
        4.2.4 VamPAL基因在果皮不同着色时期的表达水平分析第46-47页
第五章 讨论与结论第47-51页
    5.1 讨论第47-49页
        5.1.1 山葡萄不同着色时期果皮转录组测序分析第47-48页
        5.1.2 山葡萄苯丙氨酸解氨酶基因(VamPAL)的克隆与分析第48页
        5.1.3 山葡萄着色过程中VamPAL的定量分析第48-49页
    5.2 结论第49-51页
参考文献第51-59页
附录第59-68页
致谢第68-69页
攻读学位期间发表的论文第69页

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