摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
第一章 前言 | 第11-18页 |
1.1 山葡萄简介 | 第11页 |
1.2 花色苷概要 | 第11-14页 |
1.2.1 花色苷结构及种类 | 第12页 |
1.2.2 花色苷合成途径 | 第12-14页 |
1.3 高通量测序技术及其应用 | 第14-16页 |
1.3.1 高通量测序技术的发展 | 第14-15页 |
1.3.2 高通量测序技术的应用 | 第15-16页 |
1.4 苯丙氨酸解氨酶(PAL) | 第16-17页 |
1.5 研究的目的与意义 | 第17-18页 |
第二章 山葡萄不同着色时期果皮转录组测序分析 | 第18-29页 |
2.1 材料与方法 | 第18-19页 |
2.1.1 植物材料 | 第18页 |
2.1.2 试验方法 | 第18-19页 |
2.2 结果与分析 | 第19-29页 |
2.2.1 测序数据产出统计 | 第19页 |
2.2.2 转录组数据与参考序列的比对 | 第19-20页 |
2.2.3 SNP/InDel分析 | 第20-21页 |
2.2.4 可变剪切事件数量统计 | 第21-22页 |
2.2.5 差异基因表达分析 | 第22页 |
2.2.6 差异表达基因GO分类 | 第22-24页 |
2.2.7 差异表达基因COG分类 | 第24-26页 |
2.2.8 差异表达基因KEGG通路富集分析 | 第26-28页 |
2.2.9 苯丙烷类生物合成途径中的差异基因的筛选 | 第28-29页 |
第三章 山葡萄苯丙氨酸解氨酶基因(VamPAL)的克隆与分析 | 第29-40页 |
3.1 材料与方法 | 第29-33页 |
3.1.1 植物材料 | 第29-30页 |
3.1.1.1 菌株、酶及生化试剂 | 第29-30页 |
3.1.2 试验方法 | 第30-33页 |
3.2 结果与分析 | 第33-40页 |
3.2.1 DNA提取结果与检测 | 第33-34页 |
3.2.2 VamPAL基因全长的克隆与分析 | 第34页 |
3.2.3 VamPAL基因编码蛋白质理化性状分析 | 第34页 |
3.2.4 VamPAL基因编码蛋白保守区预测 | 第34-35页 |
3.2.5 VamPAL基因编码蛋白的亲水性分析 | 第35-36页 |
3.2.6 VamPAL基因编码蛋白的跨膜结构域分析 | 第36页 |
3.2.7 VamPAL基因编码蛋白的信号肽预测 | 第36-37页 |
3.2.8 VamPAL基因编码蛋白的二级结构和三级结构预测 | 第37页 |
3.2.9 VamPAL基因的细胞定位分析 | 第37-38页 |
3.2.10 VamPAL基因编码蛋白质的同源性及进化分析 | 第38-40页 |
第四章 山葡萄着色过程中VamPAL的定量分析 | 第40-47页 |
4.1 材料与方法 | 第40-43页 |
4.1.1 试验材料 | 第40页 |
4.1.2 主要试剂 | 第40页 |
4.1.3 主要仪器与设备 | 第40页 |
4.1.4 试验方法 | 第40-43页 |
4.2 结果与分析 | 第43-47页 |
4.2.1 RNA的提取 | 第43页 |
4.2.2 实时荧光定量PCR引物的常规PCR扩增 | 第43页 |
4.2.3 实时荧光定量PCR标准曲线的绘制 | 第43-46页 |
4.2.4 VamPAL基因在果皮不同着色时期的表达水平分析 | 第46-47页 |
第五章 讨论与结论 | 第47-51页 |
5.1 讨论 | 第47-49页 |
5.1.1 山葡萄不同着色时期果皮转录组测序分析 | 第47-48页 |
5.1.2 山葡萄苯丙氨酸解氨酶基因(VamPAL)的克隆与分析 | 第48页 |
5.1.3 山葡萄着色过程中VamPAL的定量分析 | 第48-49页 |
5.2 结论 | 第49-51页 |
参考文献 | 第51-59页 |
附录 | 第59-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
攻读学位期间发表的论文 | 第69页 |