摘要 | 第2-4页 |
abstract | 第4-5页 |
引言 | 第8-10页 |
第一部分 蝙蝠病毒宏基因组学研究 | 第10-27页 |
材料与方法 | 第11-17页 |
1 主要仪器和试剂 | 第11-12页 |
2 生物信息软件 | 第12页 |
3 蝙蝠样品采集 | 第12-13页 |
4 蝙蝠种类鉴定及解剖 | 第13页 |
5 高通量测序前组织样品处理 | 第13-16页 |
6 IlluminaHiseq测序 | 第16页 |
7 测序后生物信息分析 | 第16-17页 |
结果 | 第17-24页 |
1 蝙蝠种类鉴定结果 | 第17页 |
2 测序样品质量鉴定结果 | 第17-18页 |
3 病毒宏基因组分析结果 | 第18-24页 |
讨论 | 第24-27页 |
第二部分 蝙蝠新病毒的鉴定 | 第27-54页 |
材料与方法 | 第28-41页 |
1 实验仪器、主要试剂和耗材 | 第28-29页 |
2 样品、细胞系和实验动物 | 第29页 |
3 生物信息软件 | 第29页 |
4 特异性引物设计 | 第29页 |
5 病毒核酸提取 | 第29-31页 |
6 病毒RNA反转录 | 第31-32页 |
7 病毒流行病学筛查 | 第32-33页 |
8 病毒基因组扩增 | 第33-37页 |
9 制备DNA分子单克隆 | 第37-38页 |
10 实时荧光定量PCR | 第38-39页 |
11 DPRV致病性实验 | 第39-40页 |
12 构建病毒进化树 | 第40页 |
13 非同义突变替换率/同义突变替换率(dN/dS)比率分析 | 第40-41页 |
结果 | 第41-52页 |
1 新型汉坦病毒DodeHV | 第41-46页 |
2 新型弹状病毒DPRV | 第46-52页 |
讨论 | 第52-54页 |
研究结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
综述 | 第59-71页 |
综述参考文献 | 第67-71页 |
伦理证明 | 第71-72页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第72-73页 |
致谢 | 第73-74页 |