| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 第一章 综述部分 | 第14-29页 |
| 1.1 第四纪与家养动物的驯化 | 第14-23页 |
| 1.1.1 第四纪 | 第14页 |
| 1.1.2 家养动物的驯化 | 第14-16页 |
| 1.1.3 人工选择 | 第16页 |
| 1.1.4 几个牛种的起源及种间的基因渐渗 | 第16-23页 |
| 1.2 线粒体与适应性进化概述 | 第23-29页 |
| 1.2.1 线粒体概述及功能 | 第23-24页 |
| 1.2.2 进化论 | 第24-29页 |
| 第二章 牛亚科MTDNA ATPASE复合体基因的适应性进化 | 第29-69页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-37页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第30-31页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第31-35页 |
| 2.1.3 数据分析 | 第35-37页 |
| 2.2 结果与分析 | 第37-61页 |
| 2.2.1 PCR扩增 | 第37-38页 |
| 2.2.2 牛亚科物种mtDNA ATPase复合体基因的碱基组成与单倍型分布 | 第38-46页 |
| 2.2.3 基于mtDNA ATPase复合体基因的牛亚科系统发育关系 | 第46-49页 |
| 2.2.4 牛亚科物种的遗传多样性及群体扩张 | 第49-52页 |
| 2.2.5 Network结构分析 | 第52-53页 |
| 2.2.6 基牛亚科物种间的遗传距离 | 第53-55页 |
| 2.2.7 适应性进化分析 | 第55-61页 |
| 2.3 讨论 | 第61-67页 |
| 2.3.1 mtDNA在物种起源及适应性进化中的应用 | 第61页 |
| 2.3.2 牛亚科物种mtDNA ATPase复合体基因的单倍型分布 | 第61-62页 |
| 2.3.3 牛亚科系统发育关系 | 第62-63页 |
| 2.3.4 牛亚科物种的遗传多样性及群体扩张 | 第63-65页 |
| 2.3.5 适应性进化分析 | 第65-67页 |
| 2.4 结论 | 第67页 |
| 2.5 展望 | 第67-69页 |
| 第三章 牛亚科物种ND6基因的适应机制分析 | 第69-80页 |
| 3.1 材料与方法 | 第70页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第70页 |
| 3.1.2 实验方法 | 第70页 |
| 3.2 结果与分析 | 第70-78页 |
| 3.2.1 基于mtDNA ND6基因在牛亚科牛种的特征及单倍型分布 | 第70-74页 |
| 3.2.2 ND6基因的饱和度分析与牛亚科系统发育关系 | 第74-76页 |
| 3.2.3 ND6基因在各支系的遗传多样性参数 | 第76-77页 |
| 3.2.4 ND6基因在各支系的Ka/Ks、MK检验与NI值 | 第77-78页 |
| 3.3 讨论 | 第78-80页 |
| 第四章 大额牛与婆罗门牛种间杂交的细胞与分子生物学证据 | 第80-110页 |
| 4.1 家养动物的种间杂交 | 第80-82页 |
| 4.2 大额牛与婆罗门牛种间杂交后代的细胞遗传学分析 | 第82-93页 |
| 4.2.1 材料与方法 | 第84-86页 |
| 4.2.2 结果 | 第86-92页 |
| 4.2.3 讨论 | 第92-93页 |
| 4.3 大额牛与婆罗门牛种间杂交后代的亲子鉴定 | 第93-110页 |
| 4.3.1 材料与方法 | 第94-96页 |
| 4.3.2 数据分析 | 第96-97页 |
| 4.3.3 结果 | 第97-107页 |
| 4.3.4 讨论 | 第107-108页 |
| 4.3.5 结论 | 第108-109页 |
| 4.3.6 展望 | 第109-110页 |
| 第五章 结论 | 第110-112页 |
| 5.1 结论 | 第110-111页 |
| 5.2 创新点 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-130页 |
| 附录1 从GENBANK下载MTDNA基因组序列信息 | 第130-135页 |
| 附录2 牛科物种的分类系统 | 第135-136页 |
| 附录3 大额牛、大额牛与婆罗门牛的种间杂交后代 | 第136-138页 |
| 缩略词 | 第138-139页 |
| 致谢 | 第139-140页 |
| 个人简历 | 第140-141页 |
