动态生物网络模块分析算法研究与实现
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-11页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第7-8页 |
| 1.2 研究现状 | 第8-9页 |
| 1.3 论文工作内容 | 第9-10页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第10-11页 |
| 第二章 相关理论基础 | 第11-25页 |
| 2.1 图论 | 第11-14页 |
| 2.1.1 基本概念 | 第11-12页 |
| 2.1.2 相关描述 | 第12-14页 |
| 2.2 复杂网络 | 第14-20页 |
| 2.2.1 基本概念 | 第14-16页 |
| 2.2.2 复杂网络分类 | 第16-18页 |
| 2.2.3 生物网络简介 | 第18-20页 |
| 2.3 传统模块分析方法 | 第20-23页 |
| 2.3.1 基于模块度优化的算法 | 第20-21页 |
| 2.3.2 基于谱分析的算法 | 第21-22页 |
| 2.3.3 基于渗透的算法 | 第22-23页 |
| 2.4 本章小结 | 第23-25页 |
| 第三章 动态生物网络模块分析算法 | 第25-39页 |
| 3.1 算法思想 | 第25页 |
| 3.2 算法框架 | 第25-26页 |
| 3.3 动态网络建模及相关定义 | 第26-29页 |
| 3.3.1 动态网络建模 | 第26页 |
| 3.3.2 动态网络模块相关定义 | 第26-29页 |
| 3.4 模块识别算法 | 第29-32页 |
| 3.4.1 算法描述 | 第29页 |
| 3.4.2 算法时间复杂度分析 | 第29-30页 |
| 3.4.3 算法实例 | 第30-32页 |
| 3.5 模块演化算法 | 第32-38页 |
| 3.5.1 算法描述 | 第32-38页 |
| 3.5.2 算法时间复杂度分析 | 第38页 |
| 3.6 本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 实验结果分析 | 第39-51页 |
| 4.1 实验平台 | 第39页 |
| 4.2 实验数据 | 第39-40页 |
| 4.3 模块识别结果分析 | 第40-43页 |
| 4.3.1 模块变化规律 | 第40-41页 |
| 4.3.2 模块结构分析 | 第41-43页 |
| 4.4 模块演化结果分析 | 第43-48页 |
| 4.4.1 模块演化事件分析 | 第43-45页 |
| 4.4.2 元模块变化规律分析 | 第45-47页 |
| 4.4.3 网络进化结果分析 | 第47-48页 |
| 4.4.4 模块标准化互信息分析 | 第48页 |
| 4.5 性能分析 | 第48-49页 |
| 4.6 本章小结 | 第49-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 5.1 工作总结 | 第51-52页 |
| 5.2 工作展望 | 第52-53页 |
| 致谢 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 作者在读研期间的研究成果 | 第59-60页 |
