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天府肉鹅α干扰素基因克隆、表达及其生物学活性研究

中文摘要第1-20页
英文摘要(ABSTRACT)第20-25页
缩略词表第25-27页
第一章 文献综述第27-53页
 1 干扰素的分类及性质第27-30页
   ·Ⅰ型干扰素第28页
   ·Ⅱ型干扰素第28-29页
   ·Ⅲ型干扰素第29-30页
 2 干扰素的分子结构第30页
 3 干扰素的产生第30-32页
 4 干扰素的作用机制第32-37页
   ·干扰素受体第33-34页
     ·Ⅰ型干扰素受体第33-34页
     ·Ⅱ型干扰素受体第34页
     ·IFN-γ受体第34页
   ·干扰素的信号传导和效应途径第34-37页
     ·干扰素的信号传导第34-35页
       ·IFN-α/β第35页
       ·IFN-γ第35页
     ·效应途径第35-37页
       ·PKR途径第35-36页
       ·2'-5'OAS途径第36页
       ·Mx途径第36-37页
 5 IFN的生物学活性第37-43页
   ·抗病毒繁殖作用第37-38页
   ·抑制细胞分裂增殖、抗肿瘤作用第38页
   ·免疫凋节作用第38-39页
   ·免疫佐剂作用第39页
   ·干扰素与机体组织系统的相互作用和影响第39-43页
     ·干扰素信号的负调控因素第39-41页
       ·SOCS家族第40页
       ·PIAS家族第40页
       ·PTP家族第40-41页
     ·干扰素与神经内分泌系统的相互作用第41页
     ·病毒对干扰素的抵抗第41-43页
       ·转录水平的抑制—病毒阻抑干扰素的诱生第42页
       ·病毒对干扰素信号通路的抑制第42页
       ·病毒对干扰素效应蛋白的抑制第42-43页
 6 家禽α干扰素的研究概况第43-45页
 7 IFN的基因工程研究及应用第45-47页
   ·IFN的基因工程研究第45-46页
   ·干扰素的应用第46-47页
   ·干扰素临床应用中的副作用问题第47页
 8 α干扰素作为免疫佐剂的研究进展第47-49页
 9 利用毕赤酵母表达外源蛋白的研究第49-53页
   ·分泌蛋白的翻译后修饰加工第50-51页
   ·影响外源蛋白表达的因素第51-53页
第二章 研究目的与意义第53-56页
第三章 鹅INF-α基因的克隆及生物信息学分析第56-92页
 1 实验材料第56-60页
   ·实验动物第56页
   ·菌种和质粒第56-57页
   ·主要酶和试剂第57页
   ·试剂配制第57-59页
   ·主要仪器设备第59-60页
 2 实验方法第60-68页
   ·方法设计第60页
   ·引物设计第60页
   ·天府肉鹅外周血单核细胞的分离培养及细胞总RNA的提取第60-62页
     ·天府肉鹅外周血单核细胞的分离培养第60-61页
     ·细胞的诱导培养第61页
     ·细胞总RNA的提取第61-62页
   ·天府肉鹅IFN-α基因的扩增第62-63页
     ·RT-PCR反应第62页
     ·PCR扩增目的片段及检测第62-63页
     ·扩增产物的纯化第63页
   ·干扰素基因的克隆与测序第63-66页
     ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第63-64页
     ·PCR纯化产物与克隆载体的连接第64页
     ·连接产物的转化第64-65页
     ·阳性重组子的鉴定第65-66页
       ·质粒的提取第65页
       ·重组质粒pMD18-T-GoIFN-α的双酶切鉴定第65-66页
       ·重组质粒pMD18-T-GoIFN-α的PCR鉴定第66页
     ·序列测定第66页
   ·天府肉鹅干扰素α的生物信息学分析第66-68页
     ·tf-GoIFN-α ORF基因序列分裂第66页
     ·tf-GoIFN-α基因的密码子使用法特征分析第66-67页
     ·信号肽分析第67页
     ·糖基化位点分析第67页
     ·跨膜区预测第67页
     ·磷酸化位点预测第67页
     ·疏水性分析第67-68页
     ·亚细胞定位预测第68页
     ·抗原表位分析第68页
     ·二级结构分析第68页
     ·同源性及进化树分析第68页
 3 结果与分析第68-85页
   ·天府肉鹅外周血单核细胞诱导培养结果第68-69页
   ·天府肉鹅1FN-α基因PCR扩增第69页
   ·重组质粒的酶切鉴定第69-70页
   ·重组质粒的PCR鉴定第70页
   ·tf-GoIFN-α基因序列第70-71页
   ·生物信息学分析第71-85页
     ·tf-GoIFN-αORF基因序列分析第71-73页
     ·tf-GoIFN-α基因的密码子使用法特征分析第73-77页
       ·不同动物IFN-α基因参数的分析第73-74页
       ·天府肉鹅IFN-α基因密码子使用频率第74-77页
     ·信号肽分析第77-78页
     ·糖基化位点分析第78-80页
     ·跨膜区预测第80-81页
     ·磷酸化位点预测第81-82页
     ·疏水性分析第82页
     ·抗原表位分析第82-83页
     ·亚细胞定位预测第83页
     ·二级结构分析第83页
     ·同源性及进化树分析第83-85页
 4 讨论第85-91页
   ·天府肉鹅IFN-α的诱导和产生第85页
   ·RNA的提取及基因扩增第85-87页
   ·天府肉鹅IFN-α基因的生物信息学分析第87-88页
   ·天府肉鹅IFN-α基因的密码子特征第88-91页
 5 小结第91-92页
第四章 天府肉鹅IFN-α成熟肽基因的原核表达及抗病毒活性研究第92-121页
 1 实验材料第92-98页
   ·实验动物第92-93页
   ·菌种、质粒及毒株第93页
   ·主要酶和试剂第93-94页
   ·试剂配制第94-97页
   ·主要仪器设备第97-98页
 2 实验方法第98-109页
   ·天府肉鹅IFN-α成熟肽基因原核表达载体的构建第98-101页
     ·引物设计第98页
     ·成熟肽基因的扩增第98页
     ·成熟肽基因的克隆第98-99页
     ·pMD18-T-mGoIFN-α和pET-32a(+)质粒的提取第99页
     ·质粒DNA的酶切和回收第99页
     ·目的基因(mGoIFN-α)和表达载体pET-32a(+)的连接第99页
     ·重组质粒的转化第99-100页
     ·重组质粒的鉴定第100-101页
       ·PCR鉴定第100页
       ·酶切鉴定第100页
       ·原核表达质粒的序列测定第100-101页
   ·重组蛋白的表达第101-103页
     ·Rosetta感受态细胞的制备第101页
     ·工程菌的诱导表达第101页
     ·诱导表达重组蛋白的条件优化第101-102页
     ·重组蛋白的纯化和复性第102-103页
       ·包涵体的制备第102页
       ·包涵体的洗涤第102页
       ·包涵体的溶解第102页
       ·透析复性第102-103页
       ·Ni-IMAC纯化复性第103页
       ·蛋白浓度的测定第103页
   ·高免血清的制备第103-105页
     ·蛋白疫苗的制备第103-104页
     ·动物免疫第104页
     ·高免血清效价检测第104页
     ·Western Blot检测第104-105页
   ·重组天府肉鹅α干扰素的抗病毒活性研究第105-109页
     ·天府肉鹅IFN-α抗VSV活性研究第105-106页
       ·VSV的扩增与保存第105页
       ·原代鹅胚成纤维细胞的制备和培养第105页
       ·VSV半数细胞感染量(TCID50)测定第105-106页
       ·重组天府肉鹅IFN-α抗VSV活性的测定第106页
     ·重组天府肉鹅IFN-α抗GPV的研究第106-109页
       ·GPV的接种、收获与毒价测定第106页
       ·荧光定量PCR检测重组天府肉鹅IFN-α抗GPV的研究第106-109页
         ·引物设计与合成第106-107页
         ·标准阳性模板的制备第107页
         ·引物合理性验证及反应条件的优化第107-108页
         ·标准曲线制备第108页
         ·试验样品的制备第108-109页
           ·试验分组第108-109页
           ·样品制备第109页
         ·定量PCR检测第109页
         ·结果计算第109页
 3 结果与分析第109-117页
   ·天府肉鹅IFN-α成熟蛋白基因片段的克隆第109-110页
   ·天府肉鹅IFN-α成熟肽基因原核表达载体的构建第110-111页
   ·重组蛋白的原核表达第111-113页
     ·诱导时间的优化第111-112页
     ·IPTG诱导浓度的优化第112页
     ·天府肉鹅IFN-α成熟肽基因重组蛋白复性第112-113页
   ·高免血清效价测定第113页
   ·免疫兔血清的Western Blot检测第113-114页
   ·重组天府肉鹅α干扰素成熟蛋白的抗病毒活性研究第114-117页
     ·重组天府肉鹅IFN-α抗VSV活性研究第114页
     ·SYBR Green real-time PCR检测重组天府肉鹅IFN-α抗GPV的研究第114-117页
       ·反应条件的优化第114-115页
       ·标准曲线的建立第115页
       ·溶解曲线分析第115-116页
       ·SYBR Green real-time PCR检测鹅IFN-α抗GPV活性第116-117页
 4 讨论第117-120页
   ·关于信号肽及成熟蛋白基因表达第117页
   ·关于蛋白的复性第117-118页
   ·鹅IFN-α重组蛋白抗VSV活性第118-119页
   ·SYBR Green real-time PCR测鹅IFN-α抗GPV活性第119-120页
 5 小结第120-121页
第五章 鹅IgG的提取纯化及兔抗鹅IgG酶标抗体的制备第121-132页
 1 实验材料第121-122页
   ·实验动物\毒株第121页
   ·主要酶和试剂第121页
   ·试剂配制第121页
   ·主要仪器设备第121-122页
 2 实验方法第122-127页
   ·兔抗鹅IFN-α基因蛋白多克隆抗体的制备第122-125页
     ·实验动物准备第122页
     ·鹅卵黄IgG的提纯第122页
     ·鹅卵黄IgG的鉴定第122页
     ·蛋白含量的测定第122-123页
     ·蛋白疫苗的制备第123页
     ·动物免疫第123-124页
     ·血清的分离第124页
     ·兔抗鹅IgG效价的测定第124页
     ·兔血清IgG的纯化第124-125页
       ·用辛酸-硫酸铵法粗提血清IgG第124-125页
       ·DEAEA-50纤维柱层析纯化兔抗鹅血清IgG第125页
         ·纤维素平衡第125页
         ·离子交换层析纯化IgG第125页
   ·兔抗鹅IgG酶标抗体的制备第125-127页
     ·兔抗鹅辣根过氧化物(HRP)酶标抗体的制备第125-126页
     ·ELISA抗原的制备第126页
     ·间接ELISA操作方法第126页
     ·抗原最适浓度和最适鹅血清稀释度的确定第126-127页
     ·酶标抗体稀释度的选择第127页
 3 结果与分析第127-129页
   ·免疫扩散试验第127页
   ·抗体纯化检测第127-128页
   ·抗原包被浓度和鹅血清稀释度的确定第128-129页
   ·HRP酶标兔抗鹅二抗工作浓度的确定第129页
 4 讨论第129-131页
   ·关于血清IgG的纯化第129-130页
   ·关于ELISA条件的优化第130页
   ·关于酶标二抗第130-131页
 5 小结第131-132页
第六章 天府肉鹅IFN-α真核表达载体的构建及在COS-7细胞中的瞬时表达第132-148页
 1 实验材料第132-136页
   ·实验动物第132页
   ·菌种和质粒第132-133页
   ·主要酶和试剂第133页
   ·主要试剂配制第133-135页
   ·主要仪器设备第135-136页
 2 实验方法第136-141页
   ·天府肉鹅α干扰素真核表达质粒的构建第136-138页
     ·菌种的培养第136页
     ·pMD-18-T-GoIFN-α质粒的提取第136页
     ·目的基因的准备第136页
     ·pcDNA3.1(+)的线性化第136页
     ·pcDNA3.1(+)的去磷酸化第136-137页
     ·连接反应第137页
     ·重组质粒的转化第137页
     ·重组质粒的鉴定第137-138页
       ·PCR鉴定第137-138页
       ·酶切鉴定第138页
       ·真核表达质粒的序列测定第138页
   ·pcDNA3.1-GoIFN-α在COS-7细胞中的瞬时表达第138-140页
     ·重组质粒pcDNA3.1-GoIFN-α转染COS-7细胞第138-139页
       ·真核表达质粒pcDNA3.1-goIFN-α的提取第138页
       ·COS-7细胞的准备第138-139页
         ·COS-7细胞复苏第138-139页
         ·转染前COS-7细胞的处理第139页
       ·脂质体法转染COS-7细胞第139页
     ·间接免疫荧光法检测pcDNA3.1-GoIFN-α的表达第139-140页
     ·ELISA法鉴定目的蛋白的分泌第140页
     ·Westem blot分析第140页
   ·pcDNA3.1-GoIFN-α生物活性的测定第140-141页
 3 结果与分析第141-146页
   ·鹅α干扰素真核表达质粒的构建第141页
   ·GoIFN-α基因表达产物在COS-7细胞中的定位第141-142页
   ·GoIFN-α基因表达产物在细胞上清液中的检测第142-143页
   ·Westem-blot分析第143-144页
   ·基因表达产物GoIFN-α抗病毒检测第144-146页
 4 讨论第146-147页
   ·GoIFN-α外源蛋白在COS-7细胞中的表达第146页
   ·抗病毒活性的检测第146-147页
 5 小结第147-148页
第七章 天府肉鹅IFN-α真核表达质粒的免疫佐剂效应第148-170页
 1 实验材料第148-150页
   ·试验动物第148页
   ·菌种、质粒和毒株第148页
   ·主要酶和试剂第148-149页
   ·主要试剂配制第149-150页
   ·主要仪器设备第150页
 2 实验方法第150-155页
   ·分子佐剂和小鹅瘟VP3基因疫苗大量制备和纯化第150-152页
     ·碱裂解法提取质粒,大量制备基因疫苗及佐剂第150-151页
     ·聚乙二醇法(PEG-8000)纯化基因疫苗及佐剂质粒第151-152页
   ·动物分组和免疫第152-153页
   ·血样的采集和处理第153页
   ·淋巴细胞转化试验第153页
     ·外周血淋巴细胞的分离第153页
     ·淋巴细胞的诱导培养第153页
     ·检测及数据处理第153页
   ·血清IgG的变化第153-154页
     ·ELISA抗原的制备第153-154页
     ·血清抗体IgG检测第154页
     ·结果分析第154页
   ·中和抗体水平的检测第154-155页
     ·小鹅瘟强毒的培养第154-155页
     ·抗体水平检测第155页
     ·计算中和指数第155页
 3 结果与分析第155-166页
   ·鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和佐剂后淋巴细胞增殖试验检测结果第155-159页
     ·鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和不同剂量的佐剂后淋巴细胞增殖试验检测结果第157-158页
     ·鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和不同佐剂后淋巴细胞增殖试验检测结果第158-159页
     ·鹅免疫GPV-VP3基因疫苗及佐剂后淋巴细胞增殖试验检测结果第159页
   ·间接ELISA检测鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和佐剂后的IgG动态变化结果第159-164页
     ·间接ELISA检测鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和不同剂量佐剂后的IgG动态变化第161-162页
     ·间接ELISA检测鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和不同佐剂后的IgG动态变化第162-163页
     ·间接ELISA检测鹅免疫GPV-VP3基因疫苗和佐剂后的IgG动态变化第163-164页
   ·小鹅瘟强毒TCID_(50)的测定第164-165页
   ·中和抗体试验检测结果第165-166页
 4 讨论第166-169页
   ·关于细胞免疫和淋巴细胞体外增殖的关系第166-167页
   ·关于IFN-α的分子免疫佐剂功能第167-169页
 5 小结第169-170页
第八章 天府肉鹅α干扰素基因在毕赤酵母中的分泌表达及抗病毒活性研究第170-199页
 1 实验材料第170-178页
   ·菌种、质粒和病毒第170-171页
   ·主要酶和试剂第171页
   ·主要试剂配制第171-177页
   ·主要仪器设备第177-178页
 2 实验方法第178-188页
   ·天府肉鹅α干扰素成熟肽基因的克隆第178-179页
     ·引物设计及合成第178-179页
     ·基因扩增第179页
     ·成熟肽基因的克隆第179页
   ·酵母表达载体的构建第179-181页
     ·pMD18-T-m2GoIFN-α和pPICZαA质粒的提取第179页
     ·质粒DNA的酶切和回收第179-180页
     ·目的基因(mGoIFN-α)与表达载体pPICZαA的连接第180页
     ·连接产物的转化第180页
     ·酵母表达载体的鉴定第180-181页
       ·PCR鉴定第180-181页
       ·酶切鉴定第181页
       ·酵母表达载体的序列测定第181页
   ·天府肉鹅IFN-α在毕赤酵母中的表达第181-187页
     ·重组酵母的构建第181-184页
       ·空载体pPICZαA及表达载体pPICZαA-GoIFN-α的线性化第181-182页
         ·SacⅠ单酶切第181-182页
         ·线性化质粒的纯化第182页
       ·受体菌X-33感受态细胞的制备第182-183页
       ·酵母菌的电转化第183页
         ·电转仪参数的设置第183页
         ·电转化操作第183页
       ·重组鹅α干扰素基因酵母菌株的鉴定第183-184页
         ·重组酵母基因组DNA的提取第183页
         ·PCR鉴定第183-184页
     ·重组酵母菌株的诱导表达第184-186页
       ·Mut+型重组酵母菌株的初步表达第184页
       ·高拷贝重组酵母菌株的筛选第184-185页
       ·重组酵母菌株的表达条件的优化第185-186页
         ·诱导表达时间的优化第185页
         ·甲醇浓度的优化第185页
         ·双抗体夹心ELISA检测表达条件的优化第185-186页
     ·重组酵母表达产物的SDS-PAGE和Western-blot分析第186-187页
       ·配制SDS-PAGE凝胶第186页
       ·SDS-PAGE第186页
       ·表达产物的Western-blot分析第186-187页
   ·重组天府肉鹅α干扰素抗病毒活性检测第187-188页
     ·酵母表达产物的纯化第187页
       ·透析袋的预先处理第187页
       ·重组IFN-α的纯化第187页
     ·抗病毒活性检测第187-188页
 3 结果与分析第188-194页
   ·成熟肽基因的克隆第188-189页
   ·酵母表达载体的构建第189-190页
   ·酵母转化子的鉴定第190-191页
   ·斑点法筛选高表达菌株第191页
   ·诱导表达条件的优化第191页
   ·表达产物的SDS-PAGE第191-192页
   ·Western-blot检测第192-193页
   ·重组天府肉鹅IFN-α酵母表达产物的抗病毒活性检测第193-194页
 4 讨论第194-198页
   ·关于表达系统的选择第194-196页
   ·关于毕赤酵母转化方法的选取第196-197页
   ·关于酵母表达的糖基化第197-198页
   ·天府肉鹅α干扰素酵母表达产物的抗病毒活性第198页
 5 小结第198-199页
结论第199-200页
参考文献第200-215页
致谢第215-216页
攻读博士学位期间文章完成情况第216页

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