| 英文缩写 | 第1-9页 |
| 样本符号对照表 | 第9-10页 |
| 中文摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-33页 |
| 1 研究背景 | 第15-16页 |
| 2 干扰素-τ及其在妊娠识别中的调控研究进展 | 第16-21页 |
| ·干扰素-τ的结构与同源性 | 第16-17页 |
| ·干扰素-τ的表达调控 | 第17页 |
| ·干扰素-τ在妊娠识别中的作用 | 第17-21页 |
| 3 孕酮及其在胚胎植入中的调控研究进展 | 第21-23页 |
| ·胚胎植入过程 | 第21-22页 |
| ·孕酮及其受体在胚胎植入过程中的作用 | 第22-23页 |
| 4 基因芯片技术及其在牛生物学上的应用研究进展 | 第23-32页 |
| ·基因芯片技术概述 | 第23-26页 |
| ·基因芯片技术在牛生物学研究中的应用 | 第26-32页 |
| 5 研究的目的意义及主要内容 | 第32-33页 |
| ·研究的目的意义 | 第32页 |
| ·研究的主要内容 | 第32-33页 |
| 第二章 牛子宫内膜细胞体外培养模型的建立 | 第33-41页 |
| 1 前言 | 第33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-37页 |
| ·试验材料 | 第33页 |
| ·试验中主要仪器和试剂 | 第33-35页 |
| ·实验方法 | 第35-37页 |
| 3 实验结果分析 | 第37-39页 |
| ·牛子宫内膜细胞原代培养 | 第37-38页 |
| ·牛子宫内膜细胞传代培养 | 第38页 |
| ·牛子宫内膜细胞鉴定 | 第38-39页 |
| 4 讨论 | 第39-41页 |
| ·牛子宫内膜细胞原代培养 | 第39-40页 |
| ·牛子宫内膜细胞传代培养与胰酶消化 | 第40页 |
| ·牛子宫内膜细胞免疫荧光鉴定 | 第40-41页 |
| 第三章 利用基因组表达谱芯片研究孕酮与干扰素-τ影响牛子宫内膜基因的表达谱 | 第41-57页 |
| 1 前言 | 第41页 |
| 2 材料与方法 | 第41-51页 |
| ·试验材料 | 第41页 |
| ·试验中主要仪器和试剂 | 第41-44页 |
| ·实验方法 | 第44-51页 |
| 3 结果分析 | 第51-54页 |
| ·Total RNA的甲醛变性琼脂糖电泳结果 | 第51页 |
| ·RNA Pool的毛细管电泳 | 第51-52页 |
| ·芯片扫描结果 | 第52-54页 |
| ·标准化结果 | 第54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| ·实验设计 | 第54-55页 |
| ·芯片类型的选择 | 第55页 |
| ·实验数据的标准化处理 | 第55-56页 |
| ·缺失值估计 | 第56-57页 |
| 第四章 基因表达差异分析和基因聚类分析 | 第57-66页 |
| 1 前言 | 第57-58页 |
| 2 分析策略及方法 | 第58-59页 |
| ·批量Blast数据库构建 | 第58页 |
| ·差异表达基因分析 | 第58-59页 |
| ·差异基因聚类分析 | 第59页 |
| 3 结果分析 | 第59-65页 |
| ·批量Blast数据库构建 | 第59页 |
| ·差异表达基因分析 | 第59-61页 |
| ·差异基因聚类分析 | 第61-65页 |
| 4 讨论 | 第65-66页 |
| 第五章 芯片数据的生物学功能挖掘——显著性功能及信号分析 | 第66-101页 |
| 1 前言 | 第66-67页 |
| 2 分析策略及方法 | 第67-69页 |
| ·Gene Ontology(GO)富集分析 | 第67-68页 |
| ·Pathway富集分析 | 第68页 |
| ·基因间共表达网络构建(Co-Expression-Network) | 第68-69页 |
| 3 结果分析 | 第69-91页 |
| ·Gene Ontology(GO)富集分析 | 第69-82页 |
| ·Pathway富集分析 | 第82-88页 |
| ·基因间共表达网络构建(Co-Expression-Network) | 第88-91页 |
| 4 讨论 | 第91-101页 |
| ·Gene Ontology(GO)富集分析 | 第91-93页 |
| ·Pathway富集分析 | 第93-96页 |
| ·基于基因间共表达网络的发现 | 第96-101页 |
| 第六章 表达谱数据的可靠性验证 | 第101-108页 |
| 1 前言 | 第101页 |
| 2 材料与方法 | 第101-104页 |
| ·芯片实验自身的质控 | 第101页 |
| ·荧光定量PCR验证 | 第101-104页 |
| ·引物设计与合成 | 第101-102页 |
| ·TotalRNA提取和质检 | 第102页 |
| ·cDNA的合成 | 第102-103页 |
| ·荧光定量PCR | 第103页 |
| ·数据统计与分析 | 第103-104页 |
| 3 结果与分析 | 第104-107页 |
| ·芯片实验的变异系数 | 第104页 |
| ·荧光定量PCR与芯片检测结果的相关性 | 第104-107页 |
| 4 讨论 | 第107-108页 |
| ·芯片质控评价 | 第107页 |
| ·荧光定量PCR与芯片检测结果的相关性 | 第107-108页 |
| 第七章 结论与展望 | 第108-111页 |
| 1 结论 | 第108-109页 |
| 2 研究展望 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-121页 |
| 附录 | 第121-129页 |
| 1 孕酮组vs对照组中差异基因的共表达网络图 | 第121-125页 |
| 2 孕酮+干扰素-τ组vs对照组中差异基因的共表达网络图 | 第125-129页 |
| 致谢 | 第129-130页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第130页 |
