| 论文创新点 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第15-16页 |
| 第1章 文献综述 | 第16-38页 |
| 1.1 水稻开花过程研究 | 第16-20页 |
| 1.1.1 水稻开花过程 | 第16-17页 |
| 1.1.2 开花过程中花器官的细胞结构变化 | 第17页 |
| 1.1.3 水分在开花中作用 | 第17-18页 |
| 1.1.4 影响开花因素 | 第18-19页 |
| 1.1.5 水稻开花内在机制 | 第19-20页 |
| 1.2 植物水孔蛋白研究 | 第20-24页 |
| 1.2.1 水孔蛋白特性及分类 | 第20-21页 |
| 1.2.2 水孔蛋白结构 | 第21页 |
| 1.2.3 水孔蛋白功能 | 第21-23页 |
| 1.2.4 水孔蛋白在开花及逆境中作用 | 第23页 |
| 1.2.5 水孔蛋白基因家族的表达 | 第23-24页 |
| 1.3 水稻胚乳发育研究 | 第24-28页 |
| 1.3.1 水稻胚乳发育过程 | 第24-25页 |
| 1.3.2 水稻胚乳发育特点 | 第25-27页 |
| 1.3.3 水稻胚乳发育的相关基因 | 第27-28页 |
| 1.4 植物基因表达研究技术 | 第28-36页 |
| 1.4.1 mRNA差别显示技术(ddRT-PCR)及应用 | 第29-31页 |
| 1.4.2 表达序列标签(EST)技术及应用 | 第31-32页 |
| 1.4.3 基因表达序列分析技术(SAGE)及应用 | 第32-33页 |
| 1.4.4 荧光定量PCR技术(qRT-PCR)及应用 | 第33-34页 |
| 1.4.5 基因芯片技术(Gene Chip)及应用 | 第34-35页 |
| 1.4.6 转录组测序技术(RNA-Seq)及应用 | 第35-36页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第36-38页 |
| 第2章 水稻开花过程中水孔蛋白PIP基因家族的表达特征研究 | 第38-66页 |
| 2.1 材料与方法 | 第38-47页 |
| 2.1.1 水稻材料 | 第38-39页 |
| 2.1.2 形态学统计分析 | 第39页 |
| 2.1.3 细胞切面面积统计分析 | 第39-41页 |
| 2.1.4 总RNA的提取 | 第41-43页 |
| 2.1.5 cDNA的合成步骤 | 第43页 |
| 2.1.6 荧光定量PCR的序列检测 | 第43-46页 |
| 2.1.7 荧光定量PCR分析 | 第46页 |
| 2.1.8 冷胁迫下水孔蛋白基因家族表达分析 | 第46-47页 |
| 2.2 结果与分析 | 第47-62页 |
| 2.2.1 形态学观察及统计结果 | 第47-49页 |
| 2.2.2 细胞切面面积观察及统计结果 | 第49-51页 |
| 2.2.3 RNA的提取质量及测序结果 | 第51-52页 |
| 2.2.4 荧光定量PCR结果 | 第52-59页 |
| 2.2.5 水孔蛋白基因表达聚类结果 | 第59-61页 |
| 2.2.6 冷胁迫下水孔蛋白基因表达结果 | 第61-62页 |
| 2.3 讨论 | 第62-66页 |
| 第3章 水稻胚乳发育过程的基因表达特征研究 | 第66-102页 |
| 3.1 材料与方法 | 第66-75页 |
| 3.1.1 水稻材料 | 第66-67页 |
| 3.1.2 总RNA的提取 | 第67页 |
| 3.1.3 RNA测序(RNA-Seq)的技术流程 | 第67页 |
| 3.1.4 数据处理流程 | 第67-68页 |
| 3.1.5 基因表达的注释流程 | 第68页 |
| 3.1.6 基因的分布统计 | 第68页 |
| 3.1.7 基因表达量统计 | 第68-69页 |
| 3.1.8 显著性差异基因分析 | 第69页 |
| 3.1.9 差异基因表达模式聚类分析 | 第69页 |
| 3.1.10 水稻数据库整合分析 | 第69-70页 |
| 3.1.11 Gene Ontology(GO)功能显著性富集分析 | 第70-71页 |
| 3.1.12 生物学通路分析 | 第71页 |
| 3.1.13 转录因子(TF)分析 | 第71-72页 |
| 3.1.14 生物信息学软件/网站介绍 | 第72-73页 |
| 3.1.15 荧光定量PCR分析 | 第73-75页 |
| 3.2 结果与分析 | 第75-98页 |
| 3.2.1 RNA提取质量结果 | 第75页 |
| 3.2.2 测序质量评估结果 | 第75-77页 |
| 3.2.3 与参考基因组的比对结果 | 第77-78页 |
| 3.2.4 基因的分布结果 | 第78-80页 |
| 3.2.5 基因表达量的统计结果 | 第80页 |
| 3.2.6 显著性差异基因的分析结果 | 第80-81页 |
| 3.2.7 差异基因表达模式聚类结果 | 第81-82页 |
| 3.2.8 数据库的整合结果 | 第82页 |
| 3.2.9 Gene Ontology(GO)功能显著性富集结果 | 第82-86页 |
| 3.2.10 Pathway显著性富集结果 | 第86-91页 |
| 3.2.11 对表达量增幅前100的基因分析结果 | 第91-93页 |
| 3.2.12 转录因子分析结果 | 第93-97页 |
| 3.2.13 部分差异表达基因的荧光定量PCR结果 | 第97-98页 |
| 3.3 讨论 | 第98-102页 |
| 第4章 结论与展望 | 第102-105页 |
| 4.1 本文的主要结论 | 第102-103页 |
| 4.2 展望 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-121页 |
| 在读期间发表论文 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122页 |
