中文摘要 | 第10-15页 |
ABSTRACT | 第15-19页 |
符号说明 | 第21-22页 |
第一部分 前言 | 第22-30页 |
1.1 直肠癌 | 第22页 |
1.2 放射治疗 | 第22-25页 |
1.2.1 术前放疗的优势和缺陷 | 第23页 |
1.2.2 术前放疗的方式 | 第23-25页 |
1.3 基因表达谱芯片 | 第25-27页 |
1.4 生物信息学 | 第27-28页 |
1.5 本文研究内容、目的及意义 | 第28-29页 |
1.5.1 研究内容 | 第28-29页 |
1.5.2 研究的目的和意义 | 第29页 |
1.6 技术路线 | 第29-30页 |
第二部分 术前放疗前后直肠癌的mRNA表达谱分析 | 第30-51页 |
2.1 研究目的 | 第30页 |
2.2 材料和方法 | 第30-37页 |
2.2.1 放疗前后直肠癌组织样本的mRNA表达谱数据 | 第30-32页 |
2.2.2 放疗后直肠癌组织中差异表达基因的筛选 | 第32-33页 |
2.2.3 差异表达基因的GO功能富集分析 | 第33-34页 |
2.2.4 差异表达基因的KEGG通路富集分析 | 第34-35页 |
2.2.5 差异表达基因的蛋白互作网络构建 | 第35-36页 |
2.2.6 差异表达基因和转录因子的调控网络构建 | 第36-37页 |
2.2.7 差异表达基因和miRNA的调控网络构建 | 第37页 |
2.3 结果 | 第37-43页 |
2.3.1 放疗后直肠癌组织中的差异表达基因 | 第37页 |
2.3.2 差异表达基因的GO功能富集和KEGG通路富集 | 第37-41页 |
2.3.3 放疗后直肠癌中差异表达基因的蛋白互作网络分析 | 第41页 |
2.3.4 差异表达基因和转录因子的调控网络分析 | 第41-42页 |
2.3.5 差异表达基因和miRNA的调控网络分析 | 第42-43页 |
2.4 讨论 | 第43-51页 |
第三部分 不同辐射剂量对结直肠癌细胞SW620中MMP1基因表达水平的影响,及沉默MMP1后对SW620细胞增殖和转移能力的影响 | 第51-68页 |
3.1 研究目的 | 第51页 |
3.2 材料和方法 | 第51-62页 |
3.2.1 材料 | 第51-54页 |
3.2.1.1 结直肠癌细胞系 | 第51页 |
3.2.1.2 主要试剂和仪器 | 第51-54页 |
3.2.2 实验方法 | 第54-62页 |
3.2.2.1 人结直肠癌细胞株SW620的培养 | 第54-55页 |
3.2.2.2 MTT实验检测不同剂量的X射线辐照对SW620细胞增殖的影响 | 第55-56页 |
3.2.2.3 Transwell实验检测不同剂量的X射线辐照对SW620细胞转移能力的影响 | 第56页 |
3.2.2.4 RT-PCR实验验证不同剂量的X射线辐照对SW620细胞MMP1基因表达的影响 | 第56-58页 |
3.2.2.5 siRNA法沉默SW620细胞MMP1基因 | 第58-59页 |
3.2.2.6 Western blot实验 | 第59-61页 |
3.2.2.7 MTT实验检测沉默MMP1后对SW620细胞增殖的影响 | 第61页 |
3.2.2.8 Transwell实验检测沉默MMP1后对SW620细胞转移的影响 | 第61-62页 |
3.3 实验结果 | 第62-65页 |
3.3.1 不同剂量的X射线辐射对SW620细胞增殖能力和转移能力的影响 | 第62-63页 |
3.3.2 不同剂量的X射线辐照对结直肠癌细胞SW620中MMP1基因表达的影响 | 第63页 |
3.3.3 MMP1 siRNA对结直肠癌细胞SW620细胞MMP1的沉默效果 | 第63-64页 |
3.3.4 沉默MMP1前后结直肠癌细胞SW620增殖和转移能力的变化 | 第64-65页 |
3.4 讨论 | 第65-68页 |
第四部分 结论 | 第68-69页 |
参考文献 | 第69-80页 |
致谢 | 第80-81页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第81-82页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第82-83页 |
附录 | 第83-113页 |