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直肠癌放射治疗相关的基因表达谱研究及MMP1基因在直肠癌细胞中的功能分析

中文摘要第10-15页
ABSTRACT第15-19页
符号说明第21-22页
第一部分 前言第22-30页
    1.1 直肠癌第22页
    1.2 放射治疗第22-25页
        1.2.1 术前放疗的优势和缺陷第23页
        1.2.2 术前放疗的方式第23-25页
    1.3 基因表达谱芯片第25-27页
    1.4 生物信息学第27-28页
    1.5 本文研究内容、目的及意义第28-29页
        1.5.1 研究内容第28-29页
        1.5.2 研究的目的和意义第29页
    1.6 技术路线第29-30页
第二部分 术前放疗前后直肠癌的mRNA表达谱分析第30-51页
    2.1 研究目的第30页
    2.2 材料和方法第30-37页
        2.2.1 放疗前后直肠癌组织样本的mRNA表达谱数据第30-32页
        2.2.2 放疗后直肠癌组织中差异表达基因的筛选第32-33页
        2.2.3 差异表达基因的GO功能富集分析第33-34页
        2.2.4 差异表达基因的KEGG通路富集分析第34-35页
        2.2.5 差异表达基因的蛋白互作网络构建第35-36页
        2.2.6 差异表达基因和转录因子的调控网络构建第36-37页
        2.2.7 差异表达基因和miRNA的调控网络构建第37页
    2.3 结果第37-43页
        2.3.1 放疗后直肠癌组织中的差异表达基因第37页
        2.3.2 差异表达基因的GO功能富集和KEGG通路富集第37-41页
        2.3.3 放疗后直肠癌中差异表达基因的蛋白互作网络分析第41页
        2.3.4 差异表达基因和转录因子的调控网络分析第41-42页
        2.3.5 差异表达基因和miRNA的调控网络分析第42-43页
    2.4 讨论第43-51页
第三部分 不同辐射剂量对结直肠癌细胞SW620中MMP1基因表达水平的影响,及沉默MMP1后对SW620细胞增殖和转移能力的影响第51-68页
    3.1 研究目的第51页
    3.2 材料和方法第51-62页
        3.2.1 材料第51-54页
            3.2.1.1 结直肠癌细胞系第51页
            3.2.1.2 主要试剂和仪器第51-54页
        3.2.2 实验方法第54-62页
            3.2.2.1 人结直肠癌细胞株SW620的培养第54-55页
            3.2.2.2 MTT实验检测不同剂量的X射线辐照对SW620细胞增殖的影响第55-56页
            3.2.2.3 Transwell实验检测不同剂量的X射线辐照对SW620细胞转移能力的影响第56页
            3.2.2.4 RT-PCR实验验证不同剂量的X射线辐照对SW620细胞MMP1基因表达的影响第56-58页
            3.2.2.5 siRNA法沉默SW620细胞MMP1基因第58-59页
            3.2.2.6 Western blot实验第59-61页
            3.2.2.7 MTT实验检测沉默MMP1后对SW620细胞增殖的影响第61页
            3.2.2.8 Transwell实验检测沉默MMP1后对SW620细胞转移的影响第61-62页
    3.3 实验结果第62-65页
        3.3.1 不同剂量的X射线辐射对SW620细胞增殖能力和转移能力的影响第62-63页
        3.3.2 不同剂量的X射线辐照对结直肠癌细胞SW620中MMP1基因表达的影响第63页
        3.3.3 MMP1 siRNA对结直肠癌细胞SW620细胞MMP1的沉默效果第63-64页
        3.3.4 沉默MMP1前后结直肠癌细胞SW620增殖和转移能力的变化第64-65页
    3.4 讨论第65-68页
第四部分 结论第68-69页
参考文献第69-80页
致谢第80-81页
攻读学位期间发表的学术论文第81-82页
学位论文评阅及答辩情况表第82-83页
附录第83-113页

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