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草鱼NF-κB信号通路激活及其调控的分子机制

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 文献综述第12-23页
    1.1 NF-κB信号通路概述第12-13页
        1.1.1 NF-κB成员组成及结构特点第12页
        1.1.2 NF-κB抑制蛋白第12-13页
        1.1.3 IκB激酶复合物第13页
    1.2 NF-κB的激活第13-15页
        1.2.1 NF-κB经典途径第13-14页
        1.2.2 NF-κB非经典途径第14页
        1.2.3 NF-κB活化的其他途径第14-15页
    1.3 NF-κB信号通路的调节第15页
        1.3.1 正反馈调节第15页
        1.3.2 负反馈调节第15页
    1.4 NF-κB的生物学作用第15-18页
        1.4.1 抗细胞凋亡第15-16页
        1.4.2 促细胞凋亡第16页
        1.4.3 调控细胞周期第16-17页
        1.4.4 参与免疫反应第17-18页
        1.4.5 促进肿瘤发生第18页
    1.5 PKR介导NF-κB的激活第18页
    1.6 鱼类NF-κB的研究进展第18-21页
    1.7 本研究的目的及意义第21-23页
        1.7.1 本研究目的第21-22页
        1.7.2 本研究意义第22-23页
第二章 材料与方法第23-53页
    2.1 仪器与试剂第23-28页
        2.1.1 主要仪器设备第23-24页
        2.1.2 主要试剂第24-25页
        2.1.3 主要试剂盒第25页
        2.1.4 细胞实验主要试剂及耗材第25页
        2.1.5 质粒载体、菌种与细胞第25-26页
        2.1.6 引物表第26-28页
    2.2 实验材料第28页
    2.3 相关软件第28-29页
    2.4 Ci IKKβ 的克隆第29-32页
        2.4.1 Ci IKKβ 的同源克隆第29-30页
        2.4.2 Ci IKKβ 的 3′-RACE第30页
        2.4.3 Ci IKKβ 的 5′-RACE第30-31页
        2.4.4 Ci IKKβ 全长的拼接第31-32页
        2.4.5 Ci IKKβ 的系统进化分析第32页
    2.5 Ci IKKβ 表达水平分析第32-33页
        2.5.1 Ci IKKβ 组织表达水平的检测第32页
        2.5.2 Poly I:C刺激CIK细胞后Ci IKKβ 表达分析第32-33页
    2.6 Ci IKKβ 与Ci PKR的相互作用第33-40页
        2.6.1 免疫共沉淀检验Ci IKKβ 与Ci PKR相互作用第33-37页
        2.6.2 GST-pulldown确定Ci IKKβ 与Ci PKR相互作用第37-40页
    2.7 Ci IKKβ 与Ci IκBα 的相互作用第40-42页
        2.7.1 免疫共沉淀检验Ci IKKβ 与Ci IκBα 相互作用第40-41页
        2.7.2 GST-pulldown验证Ci IKKβ 与Ci IκBα 相互作用第41-42页
    2.8 草鱼NF-κB亚基Cip65, Cip105, Cic-Rel的克隆第42-44页
        2.8.1 Cip65, Cip105, Cic-Rel的同源克隆第42页
        2.8.2 Cip65, Cip105, Cic-Rel的 3′-RACE第42-43页
        2.8.3 Cip65, Cip105, Cic-Rel的 5′-RACE第43-44页
        2.8.4 Cip65, Cip105, Cic-Rel的全长拼接第44页
        2.8.5 Cip65, Cip105, Cic-Rel的系统进化分析第44页
    2.9 草鱼NF-κB亚基Cip65, Cip105, Cic-Rel表达水平分析第44-45页
    2.10 Cip65与Cip105, Cip50的相互作用第45-47页
        2.10.1 免疫共沉淀检验Cip65与Cip105, Cip50相互作用第45-46页
        2.10.2 GST-pulldown验证Cip65与Cip105, Cip50相互作用第46-47页
    2.11 Cip65, Cic-Rel与Ci IκBα 的相互作用第47-48页
        2.11.1 免疫共沉淀检验Cip65, Cic-Rel与Ci IκBα 的相互作用第47-48页
        2.11.2 GST-pulldown第48页
    2.12 Cip65对Ci IκBα 与Cip105转录调控分析第48-52页
        2.12.1 Ci IκBα、Cip105转录起始位点的确定第48-49页
        2.12.2 Ci IκBα、Cip105启动子的克隆第49-50页
        2.12.3 Ci IκBα、Cip105启动子和Cip65的亲和性分析第50-51页
        2.12.4 Ci IκBα、Cip105的转录调控分析第51-52页
    2.13 Ci IKKβ 和Cip65多克隆抗体的制备及其性能鉴定第52-53页
第三章 结果与分析第53-102页
    3.1 Ci IKKβ 的克隆和分析第53-58页
        3.1.1 Ci IKKβ 全长c DNA的克隆第53页
        3.1.2 Ci IKKβ 基因的序列分析第53-56页
        3.1.3 Ci IKKβ 基因的系统进化树第56-58页
    3.2 Ci IKKβ 基因的表达第58-59页
        3.2.1 Ci IKKβ 的组织表达第58-59页
        3.2.2 Ci IKKβ 在CIK细胞中的表达第59页
    3.3 Ci IKKβ 与Ci PKR的蛋白互作第59-63页
        3.3.1 真核表达载体p CMV-Ci IKKβ-FLAG的构建和鉴定第59-60页
        3.3.2 Ci IKKβ 与Ci PKR免疫共沉淀结果第60-61页
        3.3.3 融合蛋白的表达和纯化第61-62页
        3.3.4 GST-pulldown确定Ci IKKβ 与Ci PKR相互作用的结构域第62-63页
    3.4 Ci IKKβ 与Ci IκBα 的蛋白互作第63-66页
        3.4.1 真核表达载体p CS2-Ci IκBα-HA的构建和鉴定第63-64页
        3.4.2 Ci IKKβ 与Ci IκBα 免疫共沉淀结果第64-65页
        3.4.3 GST-pulldown确定Ci IKKβ 与Ci IκBα 相互作用第65-66页
    3.5 Cip65, Cip105, Cic-Rel的克隆和分析第66-77页
        3.5.1 Cip65, Cip105, Cic-Rel全长c DNA的克隆第66-67页
        3.5.2 Cip65、Cip105、Cic-Rel基因的序列分析第67-74页
        3.5.3 Cip65、Cip105、Cic-Rel基因的系统进化分析第74-77页
    3.6 Cip65、Cip105、Cic-Rel基因的表达第77-82页
        3.6.1 Cip65、Cip105、Cic-Rel在Poly I:C刺激后的组织表达第77-80页
        3.6.2 Cip65、Cip105、Cic-Rel在LPS刺激后的组织表达第80-82页
    3.7 Cip65与Cip105、Cip50的蛋白互作第82-86页
        3.7.1 p CMV-Cip65-FLAG、p CS2-Cip105-HA、p CS2-Cip50-HA载体的构建和鉴定第82-83页
        3.7.2 Cip65与Cip105、Cip50的免疫共沉淀结果第83-85页
        3.7.3 GST-pulldown确定Cip65与Cip105、Cip50的相互作用第85-86页
    3.8 Cip65、Cic-Rel与Ci IκBα 的蛋白互作第86-90页
        3.8.1 p CMV-Cic-Rel-FLAG载体的构建和鉴定第86-87页
        3.8.2 Cip65、Cic-Rel与Ci IκBα 的免疫共沉淀结果第87-89页
        3.8.3 GST-pulldown确定Cip65、Cic-Rel与Ci IκBα 的相互作用第89-90页
    3.9 Cip65对Ci IΚBα 与Cip105的转录调控第90-95页
        3.9.1 Ci IκBα、Cip105 c DNA 5′末端序列的获得第90-91页
        3.9.2 Ci IκBα 启动子的克隆和序列分析第91-93页
        3.9.3 Cip105启动子的克隆和序列分析第93-95页
    3.10 Ci IκBα、Cip105启动子和Cip65的亲和性分析第95-97页
        3.10.1 Cip65全长及截断蛋白的原核表达和纯化第95-96页
        3.10.2 Ci IκBα、Cip105启动子和Cip65的非放射性凝胶阻滞分析第96-97页
    3.11 Cip65激活Ci IκBα、Cip105启动子活性分析第97-100页
        3.11.1 Ci IκBα、Cip105启动子活性分析第97-98页
        3.11.2 Cip65调控Ci IκBα、Cip105的转录第98-100页
    3.12 WB测定Ci IKKβ 和Cip65多抗血清的特异性第100-102页
第四章 讨论第102-113页
    4.1 Ci PKR介导的NF-κB信号通路第102-103页
    4.2 草鱼NF-κB经典信号通路的进化保守性第103-105页
    4.3 草鱼NF-κB经典信号通路参与免疫反应第105-111页
    4.4 草鱼NF-κB经典信号通路的负反馈调节作用第111-113页
第五章 主要结论、创新点及研究展望第113-115页
    5.1 主要结论第113页
        5.1.1 Ci IKKβ,Cip65,Cip105和Cic-Rel的克隆和表达分析第113页
        5.1.2 Ci PKR介导NF-κB信号通路的机制初步分析第113页
        5.1.3 草鱼NF-κB经典信号通路的研究第113页
        5.1.4 草鱼NF-κB经典信号通路的负反馈调节分析第113页
    5.2 创新点第113-114页
    5.3 研究展望第114-115页
致谢第115-116页
参考文献第116-132页
附录 缩略语第132-134页
攻读学位期间的研究成果第134页

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