| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-20页 |
| 1.1 淡水生态系统的生物多样性 | 第8-10页 |
| 1.1.1 淡水生物多样性的现状 | 第8-9页 |
| 1.1.2 淡水生物多样性的研究方法 | 第9-10页 |
| 1.2 环境DNA研究现状 | 第10-16页 |
| 1.2.1 环境DNA的定性检测研究进展 | 第10-12页 |
| 1.2.2 环境DNA的定量检测研究进展 | 第12-13页 |
| 1.2.3 环境DNA的应用领域 | 第13-14页 |
| 1.2.4 环境DNA的研究前景及问题 | 第14-16页 |
| 1.3 淡水生物的定性检测方法 | 第16-18页 |
| 1.3.1 DNA条形码技术 | 第16-17页 |
| 1.3.2 DNA barcoding方法与传统方法优劣势比较 | 第17-18页 |
| 1.4 所选四种目标物种的生活习性特点 | 第18-19页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 第2章 环境DNA检测方法研究 | 第20-32页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-24页 |
| 2.1.1 常见水生动物搜索 | 第20页 |
| 2.1.2 查找常见水生动物barcoding序列 | 第20-21页 |
| 2.1.3 特异性引物设计与检测 | 第21页 |
| 2.1.4 样品浓缩方法和DNA提取试剂盒确定 | 第21-24页 |
| 2.1.5 琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 | 第24页 |
| 2.2 实验结果与分析 | 第24-30页 |
| 2.2.1 常见水生动物搜索结果 | 第24-25页 |
| 2.2.2 DNA barcoding库搜索结果 | 第25-26页 |
| 2.2.3 设计特异性引物序列 | 第26-27页 |
| 2.2.4 特异性引物琼脂糖凝胶电泳检测图 | 第27-28页 |
| 2.2.5 五种浓缩方法探索结果 | 第28-30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-32页 |
| 第3章 基于环境DNA的四种常见淡水动物的定性检测 | 第32-42页 |
| 3.1 材料、仪器与试剂 | 第32-33页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.1.2 实验仪器和试剂 | 第32-33页 |
| 3.2 实验方法 | 第33-35页 |
| 3.2.1 目标物种barcoding序列 | 第33-34页 |
| 3.2.2 设计特异性引物 | 第34页 |
| 3.2.3 样品浓缩 | 第34页 |
| 3.2.4 实验物种的培养条件 | 第34页 |
| 3.2.5 根据浓缩方法-乙醇沉淀法进行环境DNA的提取 | 第34-35页 |
| 3.2.6 琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 | 第35页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第35-40页 |
| 3.3.1 DNA barcoding库搜索结果 | 第35-36页 |
| 3.3.2 设计特异性引物序列 | 第36页 |
| 3.3.3 PCR扩增条件 | 第36页 |
| 3.3.4 扩增产物的琼脂糖凝胶电泳 | 第36页 |
| 3.3.5 各物种PCR后琼脂糖凝胶检测图 | 第36-39页 |
| 3.3.6 不同密度梯度下各物种的PCR检测率 | 第39-40页 |
| 3.4 讨论 | 第40-42页 |
| 第4章 泥鳅和日本沼虾与其环境DNA之间的数量关系 | 第42-55页 |
| 4.1 材料、仪器与试剂 | 第42-43页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第42页 |
| 4.1.2 实验仪器和试剂 | 第42-43页 |
| 4.2 实验方法 | 第43-46页 |
| 4.2.1 环境DNA的提取 | 第43-44页 |
| 4.2.2 环境DNA浓度检测 | 第44页 |
| 4.2.3 PCR以及琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 | 第44-45页 |
| 4.2.4 实时荧光定量PCR | 第45-46页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第46-53页 |
| 4.3.1 环境DNA浓度检测 | 第46-47页 |
| 4.3.2 PCR产物检测率 | 第47-49页 |
| 4.3.3 测序结果 | 第49-50页 |
| 4.3.4 基因的荧光定量PCR扩增产物特异性 | 第50-51页 |
| 4.3.5 基因的荧光定量PCR分析 | 第51-53页 |
| 4.4 讨论 | 第53-55页 |
| 第5章 全文总结 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
